More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0947 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0947  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 683 aa  1393    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0779656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3560  TonB-dependent siderophore receptor  58.35 
 
 		 710 aa  759    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0917  TonB-dependent siderophore receptor  40.31 
 
 		 696 aa  474  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.572242 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  37.64 
 
 		 701 aa  412  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1367  TonB-dependent siderophore receptor  38.13 
 
 		 745 aa  393  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0632202  normal  0.0485131 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0945  TonB-dependent siderophore receptor  37.89 
 
 		 717 aa  374  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  37.69 
 
 		 719 aa  372  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1027  TonB-dependent siderophore receptor  37.59 
 
 		 717 aa  368  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.424895 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0946  TonB-dependent siderophore receptor  34.08 
 
 		 706 aa  357  5.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2875  outer membrane protein  35.07 
 
 		 733 aa  347  3e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.917114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3731  putative ferrisiderophore receptor  34.37 
 
 		 728 aa  345  1e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  34.46 
 
 		 799 aa  336  1e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0646  TonB-dependent siderophore receptor  34.68 
 
 		 665 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123915  normal  0.553141 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0683  TonB-dependent siderophore receptor  34.38 
 
 		 728 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344523 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0672  TonB-dependent siderophore receptor  34.68 
 
 		 728 aa  320  7e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264811  normal  0.669281 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  32.1 
 
 		 733 aa  312  1e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  34.05 
 
 		 801 aa  303  6.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  31.63 
 
 		 723 aa  301  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  32.51 
 
 		 806 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  31.77 
 
 		 829 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  32.99 
 
 		 810 aa  294  4e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  33.38 
 
 		 829 aa  293  6e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  31.69 
 
 		 863 aa  291  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  32.74 
 
 		 808 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003567  ferrichrome-iron receptor  31.09 
 
 		 740 aa  288  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  31.85 
 
 		 745 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1930  ferric malleobactin transporter  32.5 
 
 		 753 aa  281  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2091  TonB-dependent siderophore receptor  32.5 
 
 		 737 aa  281  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.552144  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1945  ferric malleobactin transporter  32.5 
 
 		 753 aa  281  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342742  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1178  TonB-dependent siderophore receptor  32.25 
 
 		 741 aa  280  5e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0776508  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4075  TonB-dependent siderophore receptor  31.91 
 
 		 745 aa  280  5e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0285  TonB-dependent siderophore receptor  32.25 
 
 		 752 aa  280  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0472595  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1622  TonB-dependent siderophore receptor  32.25 
 
 		 736 aa  280  6e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0876  TonB-dependent siderophore receptor  32.25 
 
 		 736 aa  280  6e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195373  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  32.4 
 
 		 810 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  31.66 
 
 		 821 aa  278  2e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  29.32 
 
 		 789 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1006  TonB-dependent siderophore receptor  29.88 
 
 		 726 aa  278  3e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  32.4 
 
 		 810 aa  278  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1594  TonB-dependent siderophore receptor  31.52 
 
 		 734 aa  278  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000849595  hitchhiker  0.00416618 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  32.11 
 
 		 810 aa  277  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.43 
 
 		 833 aa  276  7e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  31.12 
 
 		 817 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  31.55 
 
 		 797 aa  272  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2736  TonB-dependent siderophore receptor  30.58 
 
 		 705 aa  271  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111092 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  31.65 
 
 		 745 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  32.05 
 
 		 799 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1541  TonB-dependent siderophore receptor  30.49 
 
 		 750 aa  270  5e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0957373  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  30.55 
 
 		 799 aa  270  5.9999999999999995e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  32.1 
 
 		 778 aa  270  7e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2415  TonB-dependent siderophore receptor  31.81 
 
 		 738 aa  270  8e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0592424  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2867  TonB-dependent siderophore receptor  32.56 
 
 		 733 aa  270  8e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132982  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  32.14 
 
 		 769 aa  269  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  31.7 
 
 		 747 aa  269  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  31.18 
 
 		 752 aa  269  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  31.7 
 
 		 701 aa  269  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  29.88 
 
 		 802 aa  268  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  30.57 
 
 		 696 aa  268  2.9999999999999995e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  31.56 
 
 		 747 aa  267  4e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  30.4 
 
 		 747 aa  268  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  30.4 
 
 		 747 aa  267  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  31.56 
 
 		 747 aa  267  5e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  31.41 
 
 		 797 aa  267  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1562  TonB-dependent siderophore receptor  30.25 
 
 		 753 aa  266  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000416689  normal  0.182143 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0416  ferrichrome-iron receptor  30.85 
 
 		 696 aa  266  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  30.44 
 
 		 808 aa  266  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  31.85 
 
 		 819 aa  265  2e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1045  TonB-dependent siderophore receptor  30.51 
 
 		 699 aa  265  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616371  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  30.84 
 
 		 828 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1436  TonB-dependent siderophore receptor  31.28 
 
 		 750 aa  264  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0404  ferrichrome-iron receptor  30.85 
 
 		 696 aa  265  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000262521 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  30.36 
 
 		 736 aa  264  3e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0458  ferrichrome-iron receptor  31.18 
 
 		 696 aa  265  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000766311 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003321  ferrichrome-iron receptor  29.53 
 
 		 711 aa  265  3e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  31.73 
 
 		 828 aa  264  4e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6866  TonB-dependent siderophore receptor  30.87 
 
 		 748 aa  264  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4790  TonB-dependent siderophore receptor  30.04 
 
 		 750 aa  264  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00609925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  32.01 
 
 		 806 aa  263  6e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4098  TonB-dependent siderophore receptor  32.3 
 
 		 754 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1619  TonB-dependent siderophore receptor  29.96 
 
 		 754 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285071 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  31.49 
 
 		 740 aa  263  8e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1164  TonB-dependent siderophore receptor  29.96 
 
 		 754 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0408687  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1644  TonB-dependent siderophore receptor  29.96 
 
 		 754 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.107171  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  31.38 
 
 		 779 aa  262  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0398  ferrichrome-iron receptor  30.72 
 
 		 698 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7174  TonB-dependent siderophore receptor  30.78 
 
 		 729 aa  261  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.229498 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3452  TonB-dependent siderophore receptor  31.3 
 
 		 747 aa  260  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.380409  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  32.34 
 
 		 791 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0155  ferrichrome outer membrane transporter  31.3 
 
 		 747 aa  260  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  32.42 
 
 		 791 aa  260  6e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  29.6 
 
 		 729 aa  260  6e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  31.53 
 
 		 797 aa  259  8e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2399  TonB-dependent siderophore receptor  29.16 
 
 		 729 aa  259  9e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  31.44 
 
 		 828 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  29.47 
 
 		 729 aa  259  1e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4798  TonB-dependent siderophore receptor  32.72 
 
 		 724 aa  259  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  31.25 
 
 		 729 aa  258  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  30.77 
 
 		 747 aa  258  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  31.44 
 
 		 828 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1775  TonB-dependent siderophore receptor  31.03 
 
 		 721 aa  259  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.441598 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>