More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2736 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2736  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
705 aa  1457    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111092 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  46.49 
 
 
820 aa  625  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  46.19 
 
 
794 aa  621  1e-176  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  45.35 
 
 
828 aa  599  1e-170  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  45.49 
 
 
828 aa  599  1e-170  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  45.24 
 
 
797 aa  602  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  45.05 
 
 
828 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  41.83 
 
 
701 aa  590  1e-167  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  41.94 
 
 
736 aa  578  1.0000000000000001e-163  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  42.77 
 
 
696 aa  567  1e-160  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  42.42 
 
 
705 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0404  ferrichrome-iron receptor  42.71 
 
 
696 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000262521 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0458  ferrichrome-iron receptor  42.55 
 
 
696 aa  544  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000766311 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0398  ferrichrome-iron receptor  42.55 
 
 
698 aa  541  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0416  ferrichrome-iron receptor  42.4 
 
 
696 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0395  ferrichrome-iron receptor  42.25 
 
 
696 aa  537  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.458077  hitchhiker  0.000000000000143872 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  38.91 
 
 
717 aa  473  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  38.27 
 
 
729 aa  470  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  38.01 
 
 
735 aa  464  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  38.95 
 
 
740 aa  460  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1079  TonB-dependent siderophore receptor  35.98 
 
 
714 aa  441  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.181404  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  36.44 
 
 
729 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  36.68 
 
 
729 aa  436  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  36.44 
 
 
703 aa  438  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  36.44 
 
 
703 aa  438  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  35.61 
 
 
729 aa  431  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  37.26 
 
 
829 aa  428  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  37.04 
 
 
778 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  35.41 
 
 
729 aa  429  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  34.25 
 
 
752 aa  419  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  34.31 
 
 
747 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  34.31 
 
 
747 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  34.58 
 
 
747 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  34.44 
 
 
747 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  37.3 
 
 
797 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  34.41 
 
 
745 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  34.17 
 
 
747 aa  414  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  36.71 
 
 
806 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  35.67 
 
 
810 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3452  TonB-dependent siderophore receptor  34.17 
 
 
747 aa  409  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.380409  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  35.68 
 
 
810 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6866  TonB-dependent siderophore receptor  35.9 
 
 
748 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0155  ferrichrome outer membrane transporter  34.17 
 
 
747 aa  409  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  35.54 
 
 
810 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  35.18 
 
 
810 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  35.88 
 
 
808 aa  403  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  35.36 
 
 
753 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  33.52 
 
 
747 aa  399  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  34.58 
 
 
833 aa  399  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  34.94 
 
 
802 aa  399  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  34.28 
 
 
808 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4121  TonB-dependent siderophore receptor  34.77 
 
 
785 aa  392  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.922703 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  36.46 
 
 
831 aa  391  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4489  TonB-dependent siderophore receptor  34.63 
 
 
785 aa  392  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4602  TonB-dependent siderophore receptor  35.08 
 
 
784 aa  391  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3272  TonB-dependent siderophore receptor  34.74 
 
 
750 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46801  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  34.45 
 
 
829 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  35.03 
 
 
789 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  34.87 
 
 
828 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  35.29 
 
 
723 aa  382  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  35.53 
 
 
745 aa  380  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  35.36 
 
 
806 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2654  TonB-dependent siderophore receptor  35.17 
 
 
757 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0434213 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1474  TonB-dependent siderophore receptor  34.54 
 
 
715 aa  375  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.052337 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  36.86 
 
 
799 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0008  TonB-dependent siderophore receptor  33.05 
 
 
713 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000108759 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4066  TonB-dependent siderophore receptor  35.03 
 
 
785 aa  366  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  34.73 
 
 
779 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  36.22 
 
 
771 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0909  ferrioxamine B receptor  32.22 
 
 
716 aa  365  2e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4798  TonB-dependent siderophore receptor  33.91 
 
 
724 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  35.06 
 
 
817 aa  361  2e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  33.28 
 
 
821 aa  361  2e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  35.94 
 
 
771 aa  361  3e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1775  TonB-dependent siderophore receptor  34.49 
 
 
721 aa  360  3e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7042  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  33.14 
 
 
689 aa  355  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4673  TonB-dependent siderophore receptor  33.48 
 
 
727 aa  355  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  34.42 
 
 
791 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003321  ferrichrome-iron receptor  33.63 
 
 
711 aa  354  4e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2867  TonB-dependent siderophore receptor  35.17 
 
 
733 aa  353  5e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132982  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1006  TonB-dependent siderophore receptor  31.78 
 
 
726 aa  353  5.9999999999999994e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  34.05 
 
 
733 aa  351  3e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1876  TonB-dependent siderophore receptor  34.92 
 
 
744 aa  350  4e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.0292257 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1499  TonB-dependent siderophore receptor  34.1 
 
 
747 aa  350  5e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  34.12 
 
 
791 aa  349  8e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3324  TonB-dependent siderophore receptor  33.87 
 
 
745 aa  348  2e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177313 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  32.71 
 
 
819 aa  347  5e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1595  TonB-dependent siderophore receptor  34.78 
 
 
744 aa  347  6e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  0.0988814 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  33.29 
 
 
701 aa  345  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1436  TonB-dependent siderophore receptor  32.9 
 
 
750 aa  345  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4098  TonB-dependent siderophore receptor  33.77 
 
 
754 aa  344  4e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  34.15 
 
 
769 aa  343  7e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  33.71 
 
 
801 aa  341  2.9999999999999998e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003567  ferrichrome-iron receptor  31.36 
 
 
740 aa  341  2.9999999999999998e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06299  hypothetical protein  32.78 
 
 
715 aa  339  8e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2636  TonB-dependent siderophore receptor  34.29 
 
 
776 aa  339  9e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2192  ferrioxamine B receptor precursor protein  33.43 
 
 
724 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411084  decreased coverage  0.00773577 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4099  TonB-dependent siderophore receptor  33.68 
 
 
743 aa  337  5e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0727583  decreased coverage  0.00321586 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  33.53 
 
 
812 aa  335  1e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4135  ferrioxamine B receptor precursor protein  32.03 
 
 
726 aa  332  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>