More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4673 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_4673  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
727 aa  1495    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4798  TonB-dependent siderophore receptor  86.52 
 
 
724 aa  1296    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2654  TonB-dependent siderophore receptor  48.88 
 
 
757 aa  635  1e-180  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0434213 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2192  ferrioxamine B receptor precursor protein  37.88 
 
 
724 aa  481  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411084  decreased coverage  0.00773577 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4135  ferrioxamine B receptor precursor protein  38.4 
 
 
726 aa  468  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156472  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2374  TonB-dependent siderophore receptor  38.47 
 
 
822 aa  449  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  38.26 
 
 
779 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3324  TonB-dependent siderophore receptor  36.28 
 
 
745 aa  426  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177313 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  36.11 
 
 
817 aa  412  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  37.13 
 
 
771 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  37.87 
 
 
829 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6718  ferrichrome receptor precursor protein  37.4 
 
 
719 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0249127  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  37.04 
 
 
771 aa  405  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  36.94 
 
 
794 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  36.96 
 
 
797 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  36.01 
 
 
828 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  35.86 
 
 
828 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  35.76 
 
 
828 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  37.74 
 
 
820 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  36.07 
 
 
829 aa  399  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  36.47 
 
 
778 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3272  TonB-dependent siderophore receptor  34.92 
 
 
750 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46801  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  34.16 
 
 
753 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  36.61 
 
 
791 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1676  TonB-dependent siderophore receptor  35.61 
 
 
757 aa  394  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235553  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0974  TonB-dependent siderophore receptor  36.35 
 
 
737 aa  394  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.930305 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  35.62 
 
 
729 aa  395  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1079  TonB-dependent siderophore receptor  34.07 
 
 
714 aa  389  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.181404  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  36.47 
 
 
791 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4099  TonB-dependent siderophore receptor  35.92 
 
 
743 aa  390  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0727583  decreased coverage  0.00321586 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3233  TonB-dependent siderophore receptor  35.97 
 
 
738 aa  390  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0212526  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  33.75 
 
 
833 aa  388  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  34.11 
 
 
740 aa  389  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  35.81 
 
 
797 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  35.96 
 
 
745 aa  384  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  36.16 
 
 
789 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  35.43 
 
 
810 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0338  ferrioxamine B receptor precursor protein  35.25 
 
 
705 aa  385  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.203857  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  35.07 
 
 
717 aa  384  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  36.19 
 
 
812 aa  380  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  35.4 
 
 
806 aa  382  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  34.75 
 
 
808 aa  378  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  34.58 
 
 
696 aa  377  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  34.81 
 
 
769 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  35.87 
 
 
810 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  33.92 
 
 
729 aa  375  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  34.01 
 
 
729 aa  375  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  34.34 
 
 
863 aa  372  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  34 
 
 
815 aa  370  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  35.2 
 
 
819 aa  371  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  33.7 
 
 
729 aa  369  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  34.71 
 
 
701 aa  366  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  35.28 
 
 
821 aa  366  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  35.74 
 
 
705 aa  369  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  35.31 
 
 
736 aa  369  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  33.42 
 
 
729 aa  369  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  34.64 
 
 
703 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  34.64 
 
 
703 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  37.24 
 
 
799 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  34.28 
 
 
735 aa  365  2e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  34.49 
 
 
808 aa  365  2e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  32.43 
 
 
747 aa  364  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0458  ferrichrome-iron receptor  34.79 
 
 
696 aa  363  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000766311 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0404  ferrichrome-iron receptor  34.79 
 
 
696 aa  363  8e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000262521 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  34.83 
 
 
810 aa  362  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  32.3 
 
 
747 aa  361  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0398  ferrichrome-iron receptor  34.35 
 
 
698 aa  361  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1775  TonB-dependent siderophore receptor  35.34 
 
 
721 aa  360  7e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  34.41 
 
 
810 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0416  ferrichrome-iron receptor  34.64 
 
 
696 aa  358  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0395  ferrichrome-iron receptor  34.21 
 
 
696 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.458077  hitchhiker  0.000000000000143872 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2140  ferrichrome receptor precursor protein  33.38 
 
 
740 aa  356  6.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262117  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3577  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  34.86 
 
 
718 aa  355  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.601026  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2736  TonB-dependent siderophore receptor  33.48 
 
 
705 aa  355  2e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111092 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1876  TonB-dependent siderophore receptor  34.81 
 
 
744 aa  354  4e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.0292257 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1826  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 
784 aa  353  5.9999999999999994e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2636  TonB-dependent siderophore receptor  33.97 
 
 
776 aa  353  7e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1595  TonB-dependent siderophore receptor  34.67 
 
 
744 aa  351  2e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  0.0988814 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1436  TonB-dependent siderophore receptor  35.54 
 
 
750 aa  350  6e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  34.21 
 
 
799 aa  349  1e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  31.45 
 
 
747 aa  348  2e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  32.24 
 
 
747 aa  348  3e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7042  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  33.09 
 
 
689 aa  347  3e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  32.24 
 
 
747 aa  347  3e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  31.98 
 
 
752 aa  348  3e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  32.24 
 
 
747 aa  347  4e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  32.32 
 
 
745 aa  347  4e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6866  TonB-dependent siderophore receptor  34.27 
 
 
748 aa  347  4e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  36.1 
 
 
828 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1499  TonB-dependent siderophore receptor  34.76 
 
 
747 aa  343  9e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  33.43 
 
 
802 aa  342  2e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  34.95 
 
 
831 aa  340  5.9999999999999996e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2415  TonB-dependent siderophore receptor  34.33 
 
 
738 aa  339  8e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0592424  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  34.65 
 
 
806 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3452  TonB-dependent siderophore receptor  32.06 
 
 
747 aa  337  5e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.380409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0155  ferrichrome outer membrane transporter  32.06 
 
 
747 aa  337  5e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1930  ferric malleobactin transporter  34.04 
 
 
753 aa  333  5e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1945  ferric malleobactin transporter  34.04 
 
 
753 aa  333  5e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342742  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2867  TonB-dependent siderophore receptor  34.23 
 
 
733 aa  333  7.000000000000001e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132982  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1622  TonB-dependent siderophore receptor  33.9 
 
 
736 aa  333  8e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>