More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5955 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5955  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 877 aa  1755    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0124539 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  38.07 
 
 		 829 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  35.12 
 
 		 829 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  34.13 
 
 		 821 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  34.67 
 
 		 778 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  38.04 
 
 		 769 aa  399  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  34.76 
 
 		 819 aa  390  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  32.57 
 
 		 808 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4099  TonB-dependent siderophore receptor  37.55 
 
 		 743 aa  384  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0727583  decreased coverage  0.00321586 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.26 
 
 		 833 aa  382  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4121  TonB-dependent siderophore receptor  36.52 
 
 		 785 aa  381  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.922703 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4602  TonB-dependent siderophore receptor  36.83 
 
 		 784 aa  380  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4489  TonB-dependent siderophore receptor  36.65 
 
 		 785 aa  382  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  32.35 
 
 		 817 aa  363  5.0000000000000005e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1676  TonB-dependent siderophore receptor  35.35 
 
 		 757 aa  362  1e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  32.21 
 
 		 815 aa  361  3e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  33.17 
 
 		 797 aa  361  3e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4066  TonB-dependent siderophore receptor  35.46 
 
 		 785 aa  357  5e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  32.14 
 
 		 799 aa  357  5e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  34.58 
 
 		 789 aa  357  5.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  34.86 
 
 		 753 aa  355  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  33.05 
 
 		 812 aa  354  5e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0974  TonB-dependent siderophore receptor  34.18 
 
 		 737 aa  352  2e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.930305 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  32.27 
 
 		 806 aa  350  7e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  32.12 
 
 		 863 aa  348  3e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6866  TonB-dependent siderophore receptor  35.06 
 
 		 748 aa  347  4e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  31.04 
 
 		 797 aa  342  2e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  34.39 
 
 		 745 aa  342  2e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1876  TonB-dependent siderophore receptor  35.16 
 
 		 744 aa  341  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.0292257 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1595  TonB-dependent siderophore receptor  35.16 
 
 		 744 aa  340  5e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  0.0988814 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2192  ferrioxamine B receptor precursor protein  33.24 
 
 		 724 aa  337  3.9999999999999995e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411084  decreased coverage  0.00773577 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  32.2 
 
 		 794 aa  337  5e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  32.37 
 
 		 806 aa  337  5e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2374  TonB-dependent siderophore receptor  31.42 
 
 		 822 aa  335  2e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3233  TonB-dependent siderophore receptor  34.25 
 
 		 738 aa  335  2e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0212526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  32.55 
 
 		 701 aa  333  1e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  31.39 
 
 		 828 aa  331  3e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  30.9 
 
 		 828 aa  331  3e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1499  TonB-dependent siderophore receptor  33.92 
 
 		 747 aa  331  3e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  31.57 
 
 		 820 aa  331  4e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3272  TonB-dependent siderophore receptor  34.58 
 
 		 750 aa  330  6e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46801  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  31.96 
 
 		 801 aa  329  2.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  32.3 
 
 		 729 aa  329  2.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  32.85 
 
 		 831 aa  329  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  31.23 
 
 		 799 aa  329  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  32.15 
 
 		 729 aa  328  3e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7042  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  34.05 
 
 		 689 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2636  TonB-dependent siderophore receptor  34.09 
 
 		 776 aa  328  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  31.09 
 
 		 828 aa  328  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  35.83 
 
 		 771 aa  326  1e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  31.51 
 
 		 701 aa  326  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  32.23 
 
 		 717 aa  325  2e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0646  TonB-dependent siderophore receptor  33.48 
 
 		 665 aa  325  2e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123915  normal  0.553141 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4135  ferrioxamine B receptor precursor protein  31.84 
 
 		 726 aa  325  3e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156472  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  31.31 
 
 		 735 aa  325  3e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  32.21 
 
 		 747 aa  324  5e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0672  TonB-dependent siderophore receptor  33.02 
 
 		 728 aa  323  6e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264811  normal  0.669281 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2654  TonB-dependent siderophore receptor  33.66 
 
 		 757 aa  323  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0434213 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  35.51 
 
 		 771 aa  323  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  32.08 
 
 		 747 aa  322  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  32.08 
 
 		 745 aa  322  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  32.08 
 
 		 747 aa  322  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0683  TonB-dependent siderophore receptor  32.97 
 
 		 728 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344523 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  32.01 
 
 		 705 aa  322  3e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  30.9 
 
 		 808 aa  321  3e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0946  TonB-dependent siderophore receptor  31.19 
 
 		 706 aa  320  5e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1079  TonB-dependent siderophore receptor  32 
 
 		 714 aa  320  7.999999999999999e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.181404  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  30.3 
 
 		 810 aa  319  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  31.22 
 
 		 696 aa  317  7e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4673  TonB-dependent siderophore receptor  32.86 
 
 		 727 aa  316  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  31.44 
 
 		 747 aa  316  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  31.98 
 
 		 752 aa  316  9.999999999999999e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2875  outer membrane protein  31.62 
 
 		 733 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.917114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3324  TonB-dependent siderophore receptor  33.43 
 
 		 745 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177313 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1178  TonB-dependent siderophore receptor  30.66 
 
 		 741 aa  314  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0776508  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0285  TonB-dependent siderophore receptor  30.66 
 
 		 752 aa  314  5.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0472595  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  31.44 
 
 		 747 aa  313  6.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0876  TonB-dependent siderophore receptor  30.66 
 
 		 736 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1622  TonB-dependent siderophore receptor  30.66 
 
 		 736 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  31.71 
 
 		 729 aa  313  7.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2415  TonB-dependent siderophore receptor  31.39 
 
 		 738 aa  312  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0592424  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3452  TonB-dependent siderophore receptor  32.08 
 
 		 747 aa  312  2e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.380409  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  30.11 
 
 		 828 aa  312  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0155  ferrichrome outer membrane transporter  32.08 
 
 		 747 aa  312  2e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  31.71 
 
 		 703 aa  312  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  31.71 
 
 		 703 aa  312  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  32 
 
 		 729 aa  311  5e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1930  ferric malleobactin transporter  30.63 
 
 		 753 aa  310  8e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1945  ferric malleobactin transporter  30.63 
 
 		 753 aa  310  8e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342742  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  31.86 
 
 		 729 aa  309  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2091  TonB-dependent siderophore receptor  30.63 
 
 		 737 aa  310  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.552144  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  31.63 
 
 		 740 aa  310  1.0000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  30.13 
 
 		 799 aa  308  3e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1367  TonB-dependent siderophore receptor  31.34 
 
 		 745 aa  308  3e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0632202  normal  0.0485131 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  32.11 
 
 		 779 aa  308  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4798  TonB-dependent siderophore receptor  32.33 
 
 		 724 aa  308  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0416  ferrichrome-iron receptor  32.01 
 
 		 696 aa  307  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2736  TonB-dependent siderophore receptor  30.86 
 
 		 705 aa  307  7e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111092 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  30.12 
 
 		 802 aa  306  9.000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1775  TonB-dependent siderophore receptor  32.28 
 
 		 721 aa  306  9.000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.441598 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>