More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2192 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2192  ferrioxamine B receptor precursor protein  100 
 
 		 724 aa  1478    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411084  decreased coverage  0.00773577 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4135  ferrioxamine B receptor precursor protein  68.23 
 
 		 726 aa  1021    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156472  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0338  ferrioxamine B receptor precursor protein  45.84 
 
 		 705 aa  598  1e-169  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.203857  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3324  TonB-dependent siderophore receptor  44.46 
 
 		 745 aa  561  1e-158  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0974  TonB-dependent siderophore receptor  42.03 
 
 		 737 aa  525  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.930305 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4099  TonB-dependent siderophore receptor  43.13 
 
 		 743 aa  520  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0727583  decreased coverage  0.00321586 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2374  TonB-dependent siderophore receptor  42.17 
 
 		 822 aa  511  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4798  TonB-dependent siderophore receptor  38.77 
 
 		 724 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3233  TonB-dependent siderophore receptor  41.37 
 
 		 738 aa  491  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0212526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1676  TonB-dependent siderophore receptor  41.32 
 
 		 757 aa  486  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4673  TonB-dependent siderophore receptor  37.88 
 
 		 727 aa  481  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  40.32 
 
 		 829 aa  476  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  38.22 
 
 		 817 aa  462  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  37.48 
 
 		 779 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  37.83 
 
 		 729 aa  444  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  37.09 
 
 		 797 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  39.09 
 
 		 769 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  38.34 
 
 		 778 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  38.17 
 
 		 771 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  36.23 
 
 		 806 aa  432  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  38.48 
 
 		 771 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  36.84 
 
 		 833 aa  428  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  35.3 
 
 		 829 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2654  TonB-dependent siderophore receptor  36.26 
 
 		 757 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0434213 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  34.25 
 
 		 808 aa  412  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  38.19 
 
 		 806 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  37.04 
 
 		 733 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1079  TonB-dependent siderophore receptor  36.31 
 
 		 714 aa  408  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.181404  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  37.46 
 
 		 791 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  36.46 
 
 		 794 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  34.32 
 
 		 810 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  36.06 
 
 		 820 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  36.97 
 
 		 791 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  35.92 
 
 		 828 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  36.38 
 
 		 802 aa  394  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  35.07 
 
 		 808 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  35.13 
 
 		 740 aa  390  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  35.86 
 
 		 789 aa  392  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  36.44 
 
 		 723 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  36.52 
 
 		 747 aa  389  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  34.31 
 
 		 810 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  35.04 
 
 		 828 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  36.38 
 
 		 747 aa  387  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  34.55 
 
 		 810 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  36.48 
 
 		 745 aa  389  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  36.52 
 
 		 747 aa  389  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  34.9 
 
 		 828 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  35.94 
 
 		 729 aa  385  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  36.36 
 
 		 801 aa  385  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  34.62 
 
 		 821 aa  384  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  34.76 
 
 		 828 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  36.63 
 
 		 812 aa  385  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  35.13 
 
 		 810 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  35.94 
 
 		 729 aa  384  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3577  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  35.33 
 
 		 718 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.601026  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  33.52 
 
 		 729 aa  382  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  37.02 
 
 		 819 aa  382  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1594  TonB-dependent siderophore receptor  36.17 
 
 		 734 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000849595  hitchhiker  0.00416618 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1178  TonB-dependent siderophore receptor  34.18 
 
 		 741 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0776508  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  35.25 
 
 		 729 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  35.85 
 
 		 747 aa  379  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2091  TonB-dependent siderophore receptor  34.13 
 
 		 737 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.552144  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  34.56 
 
 		 797 aa  379  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6866  TonB-dependent siderophore receptor  34.71 
 
 		 748 aa  379  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1945  ferric malleobactin transporter  34.13 
 
 		 753 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342742  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2415  TonB-dependent siderophore receptor  34.77 
 
 		 738 aa  379  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0592424  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  35.4 
 
 		 703 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  35.4 
 
 		 703 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0876  TonB-dependent siderophore receptor  34.18 
 
 		 736 aa  379  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1930  ferric malleobactin transporter  34.13 
 
 		 753 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1622  TonB-dependent siderophore receptor  34.18 
 
 		 736 aa  379  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0285  TonB-dependent siderophore receptor  34.18 
 
 		 752 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0472595  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3452  TonB-dependent siderophore receptor  36.38 
 
 		 747 aa  375  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.380409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0155  ferrichrome outer membrane transporter  36.38 
 
 		 747 aa  375  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1775  TonB-dependent siderophore receptor  35.09 
 
 		 721 aa  374  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  35.23 
 
 		 753 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  35.42 
 
 		 747 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  34.14 
 
 		 863 aa  374  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  34.75 
 
 		 752 aa  371  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  34.7 
 
 		 717 aa  372  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1164  TonB-dependent siderophore receptor  34.85 
 
 		 754 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0408687  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1541  TonB-dependent siderophore receptor  35.51 
 
 		 750 aa  372  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0957373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1644  TonB-dependent siderophore receptor  34.85 
 
 		 754 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.107171  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  36.07 
 
 		 799 aa  372  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1619  TonB-dependent siderophore receptor  34.71 
 
 		 754 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285071 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  36.14 
 
 		 745 aa  371  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1562  TonB-dependent siderophore receptor  35.36 
 
 		 753 aa  369  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000416689  normal  0.182143 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3272  TonB-dependent siderophore receptor  35.04 
 
 		 750 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46801  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1826  TonB-dependent siderophore receptor  36.21 
 
 		 784 aa  365  1e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  35.53 
 
 		 799 aa  365  2e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  33.9 
 
 		 735 aa  363  8e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  32.26 
 
 		 831 aa  360  4e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4790  TonB-dependent siderophore receptor  34.18 
 
 		 750 aa  360  4e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00609925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  32.99 
 
 		 747 aa  360  4e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  35.16 
 
 		 815 aa  360  6e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2867  TonB-dependent siderophore receptor  33.9 
 
 		 733 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132982  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4075  TonB-dependent siderophore receptor  32.58 
 
 		 745 aa  356  8.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1499  TonB-dependent siderophore receptor  35.56 
 
 		 747 aa  353  4e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1436  TonB-dependent siderophore receptor  32.56 
 
 		 750 aa  353  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  33.02 
 
 		 736 aa  352  2e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>