More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3233 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1676  TonB-dependent siderophore receptor  49.47 
 
 		 757 aa  666    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0974  TonB-dependent siderophore receptor  62.5 
 
 		 737 aa  850    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.930305 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3233  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 738 aa  1476    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0212526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4099  TonB-dependent siderophore receptor  64.7 
 
 		 743 aa  866    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0727583  decreased coverage  0.00321586 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3324  TonB-dependent siderophore receptor  43.52 
 
 		 745 aa  553  1e-156  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177313 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2192  ferrioxamine B receptor precursor protein  41.35 
 
 		 724 aa  496  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411084  decreased coverage  0.00773577 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2374  TonB-dependent siderophore receptor  41.85 
 
 		 822 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4135  ferrioxamine B receptor precursor protein  39.88 
 
 		 726 aa  480  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156472  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  37.65 
 
 		 829 aa  434  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  39.53 
 
 		 769 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1499  TonB-dependent siderophore receptor  39.06 
 
 		 747 aa  411  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2654  TonB-dependent siderophore receptor  37.02 
 
 		 757 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0434213 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  37.41 
 
 		 771 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  35.65 
 
 		 771 aa  399  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4798  TonB-dependent siderophore receptor  36.16 
 
 		 724 aa  395  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  36.16 
 
 		 789 aa  392  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  37.99 
 
 		 745 aa  390  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4673  TonB-dependent siderophore receptor  35.16 
 
 		 727 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  36.53 
 
 		 779 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1876  TonB-dependent siderophore receptor  36.94 
 
 		 744 aa  381  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.0292257 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  36.15 
 
 		 812 aa  380  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0338  ferrioxamine B receptor precursor protein  36.04 
 
 		 705 aa  382  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.203857  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1595  TonB-dependent siderophore receptor  37.4 
 
 		 744 aa  381  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  0.0988814 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  36.26 
 
 		 821 aa  377  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6866  TonB-dependent siderophore receptor  36.96 
 
 		 748 aa  371  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  33.38 
 
 		 829 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  34.95 
 
 		 806 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  35.64 
 
 		 778 aa  365  2e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  34.3 
 
 		 729 aa  364  3e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  34.56 
 
 		 797 aa  362  1e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  34.23 
 
 		 833 aa  362  2e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1436  TonB-dependent siderophore receptor  35.74 
 
 		 750 aa  361  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  34.97 
 
 		 817 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  33.87 
 
 		 808 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  33.95 
 
 		 729 aa  356  1e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  34.01 
 
 		 810 aa  355  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  35.35 
 
 		 802 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  34.39 
 
 		 815 aa  353  7e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  35.23 
 
 		 801 aa  349  1e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  34.71 
 
 		 753 aa  349  1e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  36.02 
 
 		 819 aa  347  3e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1826  TonB-dependent siderophore receptor  33.6 
 
 		 784 aa  346  7e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  32.71 
 
 		 717 aa  343  5.999999999999999e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  34.14 
 
 		 810 aa  343  9e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4489  TonB-dependent siderophore receptor  33.92 
 
 		 785 aa  342  1e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5955  TonB-dependent siderophore receptor  34.25 
 
 		 877 aa  340  5e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0124539 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  34.79 
 
 		 723 aa  339  9.999999999999999e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4121  TonB-dependent siderophore receptor  33.67 
 
 		 785 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.922703 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  32.62 
 
 		 735 aa  337  5e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  34.47 
 
 		 808 aa  337  5e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  32.99 
 
 		 831 aa  337  5.999999999999999e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  34.48 
 
 		 799 aa  337  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4602  TonB-dependent siderophore receptor  33.46 
 
 		 784 aa  335  3e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3272  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 750 aa  334  3e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46801  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  33.28 
 
 		 729 aa  334  3e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  34.58 
 
 		 733 aa  333  6e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  32.18 
 
 		 828 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  33.14 
 
 		 729 aa  332  2e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 791 aa  330  6e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  32.54 
 
 		 740 aa  330  8e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1079  TonB-dependent siderophore receptor  33.09 
 
 		 714 aa  330  8e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.181404  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4066  TonB-dependent siderophore receptor  34.03 
 
 		 785 aa  330  8e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  33.33 
 
 		 791 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  34.19 
 
 		 810 aa  328  3e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  32.6 
 
 		 729 aa  328  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  32.6 
 
 		 703 aa  327  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  32.6 
 
 		 703 aa  327  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  32.33 
 
 		 747 aa  325  2e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  34.05 
 
 		 810 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  31.5 
 
 		 736 aa  324  3e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  32.95 
 
 		 828 aa  324  4e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  33 
 
 		 799 aa  324  4e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  31.72 
 
 		 752 aa  324  5e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  32.95 
 
 		 828 aa  323  5e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  32.79 
 
 		 794 aa  323  8e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  31.75 
 
 		 745 aa  323  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3577  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  34.8 
 
 		 718 aa  322  9.999999999999999e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.601026  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  33.09 
 
 		 828 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  32.64 
 
 		 820 aa  321  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1027  TonB-dependent siderophore receptor  34.11 
 
 		 717 aa  321  3e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.424895 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2867  TonB-dependent siderophore receptor  33.76 
 
 		 733 aa  321  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132982  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4098  TonB-dependent siderophore receptor  35.06 
 
 		 754 aa  320  5e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  31.72 
 
 		 799 aa  319  9e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  32.38 
 
 		 747 aa  320  9e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  31.66 
 
 		 747 aa  318  2e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  31.66 
 
 		 747 aa  318  2e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0945  TonB-dependent siderophore receptor  33.82 
 
 		 717 aa  318  3e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2636  TonB-dependent siderophore receptor  32.56 
 
 		 776 aa  318  3e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2736  TonB-dependent siderophore receptor  33.04 
 
 		 705 aa  317  4e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111092 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  35.36 
 
 		 719 aa  317  7e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  31.52 
 
 		 747 aa  317  7e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  32.23 
 
 		 747 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1619  TonB-dependent siderophore receptor  34.72 
 
 		 754 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285071 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1164  TonB-dependent siderophore receptor  34.72 
 
 		 754 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0408687  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1644  TonB-dependent siderophore receptor  34.72 
 
 		 754 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.107171  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  34 
 
 		 806 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  31.86 
 
 		 863 aa  311  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2415  TonB-dependent siderophore receptor  31.24 
 
 		 738 aa  310  5e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0592424  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  32.1 
 
 		 701 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1930  ferric malleobactin transporter  31.55 
 
 		 753 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>