More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4099 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1676  TonB-dependent siderophore receptor  55.02 
 
 		 757 aa  752    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4099  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 743 aa  1487    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0727583  decreased coverage  0.00321586 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3233  TonB-dependent siderophore receptor  64.72 
 
 		 738 aa  895    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0212526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0974  TonB-dependent siderophore receptor  68.32 
 
 		 737 aa  969    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.930305 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3324  TonB-dependent siderophore receptor  47.7 
 
 		 745 aa  595  1e-168  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177313 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2192  ferrioxamine B receptor precursor protein  43.09 
 
 		 724 aa  526  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411084  decreased coverage  0.00773577 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2374  TonB-dependent siderophore receptor  41.32 
 
 		 822 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4135  ferrioxamine B receptor precursor protein  40.17 
 
 		 726 aa  488  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156472  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  40.09 
 
 		 829 aa  465  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  40.38 
 
 		 769 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0338  ferrioxamine B receptor precursor protein  38.96 
 
 		 705 aa  438  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.203857  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  39.8 
 
 		 771 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  37.53 
 
 		 771 aa  429  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  37.09 
 
 		 729 aa  418  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  36.63 
 
 		 789 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  36.44 
 
 		 779 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2654  TonB-dependent siderophore receptor  37.37 
 
 		 757 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0434213 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1499  TonB-dependent siderophore receptor  37.57 
 
 		 747 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  38.68 
 
 		 745 aa  404  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4798  TonB-dependent siderophore receptor  36.26 
 
 		 724 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1876  TonB-dependent siderophore receptor  36.41 
 
 		 744 aa  394  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.0292257 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5955  TonB-dependent siderophore receptor  36.38 
 
 		 877 aa  392  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0124539 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1595  TonB-dependent siderophore receptor  36.28 
 
 		 744 aa  392  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  0.0988814 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4673  TonB-dependent siderophore receptor  35.85 
 
 		 727 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  35.58 
 
 		 812 aa  384  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  35.15 
 
 		 829 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  35.35 
 
 		 833 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  36.08 
 
 		 753 aa  379  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  36.42 
 
 		 797 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  36.31 
 
 		 817 aa  375  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6866  TonB-dependent siderophore receptor  36.22 
 
 		 748 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4489  TonB-dependent siderophore receptor  35.88 
 
 		 785 aa  370  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  34.91 
 
 		 717 aa  370  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  35.15 
 
 		 778 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4121  TonB-dependent siderophore receptor  35.76 
 
 		 785 aa  368  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.922703 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  35.69 
 
 		 806 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  34.94 
 
 		 729 aa  365  2e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4602  TonB-dependent siderophore receptor  35.5 
 
 		 784 aa  365  2e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1178  TonB-dependent siderophore receptor  34.62 
 
 		 741 aa  364  4e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0776508  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  33.55 
 
 		 729 aa  364  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2415  TonB-dependent siderophore receptor  34.15 
 
 		 738 aa  364  4e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0592424  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0876  TonB-dependent siderophore receptor  34.62 
 
 		 736 aa  363  4e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1622  TonB-dependent siderophore receptor  34.62 
 
 		 736 aa  363  4e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0285  TonB-dependent siderophore receptor  34.62 
 
 		 752 aa  364  4e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0472595  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2091  TonB-dependent siderophore receptor  34.76 
 
 		 737 aa  363  8e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.552144  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1079  TonB-dependent siderophore receptor  35.44 
 
 		 714 aa  362  1e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.181404  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1930  ferric malleobactin transporter  34.51 
 
 		 753 aa  362  1e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1945  ferric malleobactin transporter  34.51 
 
 		 753 aa  362  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342742  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  35.38 
 
 		 799 aa  361  2e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  35.99 
 
 		 801 aa  362  2e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  34.06 
 
 		 703 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  34.7 
 
 		 729 aa  362  2e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  34.06 
 
 		 703 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1436  TonB-dependent siderophore receptor  34.7 
 
 		 750 aa  359  8e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  33.86 
 
 		 740 aa  359  9.999999999999999e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  34.85 
 
 		 799 aa  358  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3272  TonB-dependent siderophore receptor  35.1 
 
 		 750 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46801  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  35.23 
 
 		 815 aa  357  3.9999999999999996e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  33.29 
 
 		 729 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  33.97 
 
 		 808 aa  357  5e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  35.4 
 
 		 733 aa  357  5e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  35.6 
 
 		 802 aa  357  5.999999999999999e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  33.48 
 
 		 745 aa  355  2e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  35.14 
 
 		 821 aa  354  2.9999999999999997e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  33.67 
 
 		 735 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1594  TonB-dependent siderophore receptor  35.07 
 
 		 734 aa  351  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000849595  hitchhiker  0.00416618 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  34.4 
 
 		 810 aa  352  2e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1164  TonB-dependent siderophore receptor  34.99 
 
 		 754 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0408687  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1644  TonB-dependent siderophore receptor  34.99 
 
 		 754 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.107171  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  33.38 
 
 		 747 aa  350  5e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  33.38 
 
 		 747 aa  350  5e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1619  TonB-dependent siderophore receptor  34.84 
 
 		 754 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285071 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  33.24 
 
 		 747 aa  348  2e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4098  TonB-dependent siderophore receptor  36.23 
 
 		 754 aa  348  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1562  TonB-dependent siderophore receptor  34.25 
 
 		 753 aa  346  7e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000416689  normal  0.182143 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  33.84 
 
 		 799 aa  346  8.999999999999999e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  33.43 
 
 		 831 aa  346  1e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  34 
 
 		 828 aa  346  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4790  TonB-dependent siderophore receptor  34.73 
 
 		 750 aa  345  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00609925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  33.98 
 
 		 791 aa  345  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4075  TonB-dependent siderophore receptor  34.19 
 
 		 745 aa  345  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  34.63 
 
 		 806 aa  344  4e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3577  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  35.07 
 
 		 718 aa  343  5.999999999999999e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.601026  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  34.13 
 
 		 791 aa  343  7e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  34.63 
 
 		 723 aa  342  1e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  34.14 
 
 		 810 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  34.34 
 
 		 828 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1541  TonB-dependent siderophore receptor  33.76 
 
 		 750 aa  341  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0957373  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0683  TonB-dependent siderophore receptor  36.03 
 
 		 728 aa  341  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344523 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  31.48 
 
 		 747 aa  340  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3452  TonB-dependent siderophore receptor  33.38 
 
 		 747 aa  340  5e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.380409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0155  ferrichrome outer membrane transporter  33.38 
 
 		 747 aa  340  5e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0672  TonB-dependent siderophore receptor  35.75 
 
 		 728 aa  340  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264811  normal  0.669281 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  33.86 
 
 		 828 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2736  TonB-dependent siderophore receptor  33.77 
 
 		 705 aa  339  9.999999999999999e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111092 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1474  TonB-dependent siderophore receptor  34.71 
 
 		 715 aa  339  9.999999999999999e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.052337 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  32.43 
 
 		 752 aa  339  9.999999999999999e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4066  TonB-dependent siderophore receptor  36.43 
 
 		 785 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  33.62 
 
 		 828 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  35.44 
 
 		 819 aa  338  2.9999999999999997e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>