More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0338 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0338  ferrioxamine B receptor precursor protein  100 
 
 
705 aa  1444    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.203857  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2192  ferrioxamine B receptor precursor protein  45.84 
 
 
724 aa  615  1e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411084  decreased coverage  0.00773577 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4135  ferrioxamine B receptor precursor protein  45.1 
 
 
726 aa  615  9.999999999999999e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156472  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3324  TonB-dependent siderophore receptor  39.37 
 
 
745 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177313 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2374  TonB-dependent siderophore receptor  40.56 
 
 
822 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4099  TonB-dependent siderophore receptor  38.87 
 
 
743 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0727583  decreased coverage  0.00321586 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0974  TonB-dependent siderophore receptor  37.92 
 
 
737 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.930305 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1676  TonB-dependent siderophore receptor  38.78 
 
 
757 aa  438  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235553  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  37.92 
 
 
817 aa  419  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  37.43 
 
 
729 aa  412  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4798  TonB-dependent siderophore receptor  37.07 
 
 
724 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4673  TonB-dependent siderophore receptor  35.25 
 
 
727 aa  398  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  35.21 
 
 
778 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  36.34 
 
 
829 aa  398  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3233  TonB-dependent siderophore receptor  35.95 
 
 
738 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0212526  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  36.71 
 
 
829 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  36.13 
 
 
769 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2654  TonB-dependent siderophore receptor  34.61 
 
 
757 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0434213 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  33.19 
 
 
740 aa  370  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  33.29 
 
 
717 aa  366  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  35.71 
 
 
771 aa  369  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  36.68 
 
 
771 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  35.05 
 
 
806 aa  360  6e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  33.92 
 
 
735 aa  359  9e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  33.77 
 
 
810 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  35.18 
 
 
745 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  34.2 
 
 
797 aa  355  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  34.84 
 
 
747 aa  352  1e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  34.84 
 
 
747 aa  351  2e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  35.83 
 
 
812 aa  351  2e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  34.39 
 
 
779 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  34.84 
 
 
747 aa  351  2e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2399  TonB-dependent siderophore receptor  34.45 
 
 
729 aa  351  3e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1079  TonB-dependent siderophore receptor  33.77 
 
 
714 aa  350  6e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.181404  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  32.9 
 
 
808 aa  348  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  35.97 
 
 
808 aa  348  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  34.56 
 
 
723 aa  348  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  33.97 
 
 
791 aa  348  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  33.56 
 
 
791 aa  347  3e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  35.66 
 
 
745 aa  346  8e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  34.98 
 
 
747 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  34.36 
 
 
789 aa  345  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  34.59 
 
 
806 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  33.14 
 
 
810 aa  344  4e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  33.57 
 
 
747 aa  343  5e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  34.84 
 
 
747 aa  343  8e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  31.65 
 
 
820 aa  340  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  35.19 
 
 
801 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  34.08 
 
 
752 aa  339  9.999999999999999e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  31.65 
 
 
794 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  33.14 
 
 
810 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3452  TonB-dependent siderophore receptor  34.41 
 
 
747 aa  338  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.380409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0155  ferrichrome outer membrane transporter  34.41 
 
 
747 aa  338  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1595  TonB-dependent siderophore receptor  35.58 
 
 
744 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  0.0988814 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1436  TonB-dependent siderophore receptor  33.29 
 
 
750 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  31.65 
 
 
863 aa  337  3.9999999999999995e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  32.85 
 
 
810 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3577  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  34.51 
 
 
718 aa  335  1e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.601026  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  33.19 
 
 
802 aa  334  3e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1876  TonB-dependent siderophore receptor  35.43 
 
 
744 aa  333  6e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.0292257 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  33.29 
 
 
815 aa  332  1e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  32.47 
 
 
729 aa  332  1e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  34 
 
 
733 aa  332  1e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4075  TonB-dependent siderophore receptor  33.43 
 
 
745 aa  331  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6866  TonB-dependent siderophore receptor  33.24 
 
 
748 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  32.8 
 
 
753 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  32.41 
 
 
821 aa  327  6e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  32.64 
 
 
833 aa  326  7e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  32.52 
 
 
736 aa  326  7e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  33.29 
 
 
828 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2415  TonB-dependent siderophore receptor  33.67 
 
 
738 aa  325  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0592424  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1945  ferric malleobactin transporter  33.96 
 
 
753 aa  324  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342742  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1930  ferric malleobactin transporter  33.96 
 
 
753 aa  324  3e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2736  TonB-dependent siderophore receptor  32.39 
 
 
705 aa  324  3e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111092 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2091  TonB-dependent siderophore receptor  33.96 
 
 
737 aa  324  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.552144  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  32.34 
 
 
797 aa  324  4e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4098  TonB-dependent siderophore receptor  33.23 
 
 
754 aa  323  6e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1178  TonB-dependent siderophore receptor  34.3 
 
 
741 aa  323  7e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0776508  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0285  TonB-dependent siderophore receptor  34.3 
 
 
752 aa  323  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0472595  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0876  TonB-dependent siderophore receptor  34.3 
 
 
736 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195373  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  33.04 
 
 
729 aa  322  9.999999999999999e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1622  TonB-dependent siderophore receptor  34.3 
 
 
736 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  33.28 
 
 
729 aa  322  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1594  TonB-dependent siderophore receptor  33.87 
 
 
734 aa  319  9e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000849595  hitchhiker  0.00416618 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  33.14 
 
 
729 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  32.9 
 
 
828 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  33.09 
 
 
703 aa  318  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  33.09 
 
 
703 aa  318  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  32.92 
 
 
828 aa  317  5e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  32.78 
 
 
828 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3272  TonB-dependent siderophore receptor  32.61 
 
 
750 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46801  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  33.53 
 
 
799 aa  313  6.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  33.82 
 
 
819 aa  312  1e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7042  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  32.39 
 
 
689 aa  312  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  29.64 
 
 
701 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1826  TonB-dependent siderophore receptor  31.81 
 
 
784 aa  310  6.999999999999999e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  33.98 
 
 
831 aa  308  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  34.12 
 
 
799 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  31.94 
 
 
799 aa  304  4.0000000000000003e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1499  TonB-dependent siderophore receptor  33.82 
 
 
747 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>