More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1440 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1440  TonB dependent, hydroxamate-type ferrisiderophore, outer membrane receptor  100 
 
 		 699 aa  1424    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453975  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0089  TonB-dependent siderophore receptor  98.71 
 
 		 699 aa  1409    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.26085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1139  TonB-dependent siderophore receptor  42.34 
 
 		 736 aa  540  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.489697 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  38.79 
 
 		 812 aa  432  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  34.38 
 
 		 797 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  34.56 
 
 		 806 aa  354  4e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  34.05 
 
 		 794 aa  348  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  33.19 
 
 		 829 aa  348  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 778 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  32.27 
 
 		 696 aa  343  5.999999999999999e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  33.76 
 
 		 820 aa  342  1e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  32.75 
 
 		 808 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  32.14 
 
 		 701 aa  340  5e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1775  TonB-dependent siderophore receptor  32.95 
 
 		 721 aa  340  5e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4673  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 727 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0458  ferrichrome-iron receptor  32.87 
 
 		 696 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000766311 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0404  ferrichrome-iron receptor  32.87 
 
 		 696 aa  337  5e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000262521 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  32.35 
 
 		 723 aa  337  5e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  33.73 
 
 		 821 aa  337  5e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  32.84 
 
 		 733 aa  337  5e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0398  ferrichrome-iron receptor  32.87 
 
 		 698 aa  337  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3474  ferrichrome receptor precursor protein  33.65 
 
 		 719 aa  336  1e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.588367  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  32.96 
 
 		 828 aa  335  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  33.29 
 
 		 797 aa  335  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0416  ferrichrome-iron receptor  32.73 
 
 		 696 aa  334  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0395  ferrichrome-iron receptor  32.73 
 
 		 696 aa  333  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.458077  hitchhiker  0.000000000000143872 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  33.88 
 
 		 729 aa  333  8e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3585  ferrichrome receptor precursor protein  33.43 
 
 		 718 aa  330  4e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.885271  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  33.85 
 
 		 829 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  34.01 
 
 		 819 aa  330  6e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  33.28 
 
 		 828 aa  329  9e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4098  TonB-dependent siderophore receptor  34.26 
 
 		 754 aa  329  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  33.28 
 
 		 828 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  32.76 
 
 		 810 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  34.13 
 
 		 815 aa  326  9e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  34.01 
 
 		 779 aa  324  3e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  32.65 
 
 		 802 aa  324  3e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  32.98 
 
 		 799 aa  323  5e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  33.09 
 
 		 753 aa  323  8e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  32.6 
 
 		 810 aa  323  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  32.54 
 
 		 771 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  34.44 
 
 		 817 aa  322  1.9999999999999998e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  31.16 
 
 		 808 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  34.33 
 
 		 745 aa  321  3e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.16 
 
 		 833 aa  320  5e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6718  ferrichrome receptor precursor protein  35.02 
 
 		 719 aa  319  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0249127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4798  TonB-dependent siderophore receptor  32.71 
 
 		 724 aa  319  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  31.75 
 
 		 717 aa  317  7e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  34.71 
 
 		 791 aa  316  9e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  32.13 
 
 		 705 aa  316  9e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  32.02 
 
 		 789 aa  316  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  32.63 
 
 		 797 aa  316  9.999999999999999e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3272  TonB-dependent siderophore receptor  33.43 
 
 		 750 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46801  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  32.21 
 
 		 771 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  33.62 
 
 		 831 aa  314  2.9999999999999996e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  31.72 
 
 		 810 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  34.71 
 
 		 791 aa  314  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0946  TonB-dependent siderophore receptor  33.09 
 
 		 706 aa  313  7.999999999999999e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2415  TonB-dependent siderophore receptor  33.29 
 
 		 738 aa  310  4e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0592424  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  31.3 
 
 		 810 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  31.93 
 
 		 735 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1178  TonB-dependent siderophore receptor  32.85 
 
 		 741 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0776508  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0285  TonB-dependent siderophore receptor  32.85 
 
 		 752 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0472595  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0876  TonB-dependent siderophore receptor  32.85 
 
 		 736 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1622  TonB-dependent siderophore receptor  32.85 
 
 		 736 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001284  putative iron(III) compound receptor  30.91 
 
 		 701 aa  307  5.0000000000000004e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000165675  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  30.33 
 
 		 740 aa  307  5.0000000000000004e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4135  ferrioxamine B receptor precursor protein  32.79 
 
 		 726 aa  306  6e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156472  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1930  ferric malleobactin transporter  33.09 
 
 		 753 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2091  TonB-dependent siderophore receptor  33.09 
 
 		 737 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.552144  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1945  ferric malleobactin transporter  33.09 
 
 		 753 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342742  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1367  TonB-dependent siderophore receptor  32.06 
 
 		 745 aa  306  1.0000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0632202  normal  0.0485131 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2140  ferrichrome receptor precursor protein  32.89 
 
 		 740 aa  304  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2736  TonB-dependent siderophore receptor  30.87 
 
 		 705 aa  304  3.0000000000000004e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111092 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1079  TonB-dependent siderophore receptor  31.56 
 
 		 714 aa  303  6.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.181404  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  30.04 
 
 		 729 aa  302  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1045  TonB-dependent siderophore receptor  31.78 
 
 		 699 aa  302  1e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616371  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  29.9 
 
 		 729 aa  301  2e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  30.12 
 
 		 736 aa  301  2e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  31.88 
 
 		 806 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  32.02 
 
 		 701 aa  301  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  33.19 
 
 		 719 aa  299  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6866  TonB-dependent siderophore receptor  32.91 
 
 		 748 aa  299  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  32.73 
 
 		 769 aa  299  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1006  TonB-dependent siderophore receptor  29.77 
 
 		 726 aa  297  4e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1876  TonB-dependent siderophore receptor  33.78 
 
 		 744 aa  297  4e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.0292257 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2192  ferrioxamine B receptor precursor protein  31.82 
 
 		 724 aa  297  5e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411084  decreased coverage  0.00773577 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  31 
 
 		 799 aa  296  9e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4099  TonB-dependent siderophore receptor  32.11 
 
 		 743 aa  295  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0727583  decreased coverage  0.00321586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7042  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  32.75 
 
 		 689 aa  295  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1594  TonB-dependent siderophore receptor  32.77 
 
 		 734 aa  294  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000849595  hitchhiker  0.00416618 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  29.88 
 
 		 729 aa  294  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  30.51 
 
 		 729 aa  295  3e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2867  TonB-dependent siderophore receptor  30.64 
 
 		 733 aa  294  4e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132982  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1595  TonB-dependent siderophore receptor  33.48 
 
 		 744 aa  293  6e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  0.0988814 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4075  TonB-dependent siderophore receptor  31.73 
 
 		 745 aa  292  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1676  TonB-dependent siderophore receptor  30.7 
 
 		 757 aa  292  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7174  TonB-dependent siderophore receptor  32.39 
 
 		 729 aa  292  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.229498 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3324  TonB-dependent siderophore receptor  31.35 
 
 		 745 aa  292  1e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177313 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  30.1 
 
 		 703 aa  293  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>