More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2881 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  80.98 
 
 		 715 aa  1197    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  87.36 
 
 		 720 aa  1295    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  86.81 
 
 		 720 aa  1291    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  87.36 
 
 		 720 aa  1294    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  51.48 
 
 		 702 aa  714    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  83.96 
 
 		 724 aa  1202    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  83.36 
 
 		 724 aa  1196    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  51.48 
 
 		 702 aa  714    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  87.36 
 
 		 720 aa  1291    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  81.42 
 
 		 723 aa  1201    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 714 aa  1453    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01528  TonB-dependent receptor  44.38 
 
 		 720 aa  597  1e-169  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  41.73 
 
 		 707 aa  535  1e-151  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  41.81 
 
 		 720 aa  528  1e-148  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3611  homoserine O-acetyltransferase  40.61 
 
 		 699 aa  501  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000219924  decreased coverage  0.00028675 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  37.44 
 
 		 689 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  37.19 
 
 		 708 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  37.27 
 
 		 703 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  38.47 
 
 		 712 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04088  TonB-dependent outer membrane Receptor  38.68 
 
 		 713 aa  442  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  36.36 
 
 		 703 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  36.27 
 
 		 757 aa  440  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  33.56 
 
 		 722 aa  434  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  37.35 
 
 		 722 aa  433  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  36.4 
 
 		 701 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  36.87 
 
 		 701 aa  421  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  36.53 
 
 		 701 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  36.27 
 
 		 701 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  36.53 
 
 		 701 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  36.38 
 
 		 701 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  35.44 
 
 		 701 aa  404  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  34.98 
 
 		 710 aa  395  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  34.08 
 
 		 709 aa  392  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  35.66 
 
 		 701 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  32.86 
 
 		 708 aa  382  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  33.43 
 
 		 696 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  33.66 
 
 		 703 aa  372  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  34.22 
 
 		 703 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  33.43 
 
 		 696 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  33.43 
 
 		 710 aa  362  2e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  32.83 
 
 		 711 aa  353  4e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  32.83 
 
 		 734 aa  354  4e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  32.26 
 
 		 692 aa  345  2e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  31.99 
 
 		 711 aa  345  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  32.19 
 
 		 715 aa  342  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  30.46 
 
 		 708 aa  342  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  32.3 
 
 		 741 aa  337  7e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  30.33 
 
 		 709 aa  336  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  31.99 
 
 		 736 aa  334  4e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  32.63 
 
 		 732 aa  332  1e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  30.33 
 
 		 730 aa  331  3e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  32.99 
 
 		 689 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  32.74 
 
 		 714 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  30.96 
 
 		 722 aa  325  2e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  32.02 
 
 		 710 aa  323  5e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  31.26 
 
 		 738 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  31.87 
 
 		 689 aa  294  3e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  31.56 
 
 		 843 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  31.91 
 
 		 850 aa  268  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  30.89 
 
 		 815 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  30.65 
 
 		 825 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  30.5 
 
 		 825 aa  266  8e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  32.05 
 
 		 837 aa  266  8e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  29.96 
 
 		 862 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  30.58 
 
 		 707 aa  254  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  30.45 
 
 		 864 aa  251  3e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  31.78 
 
 		 748 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  31.78 
 
 		 748 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  31.27 
 
 		 740 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  30.43 
 
 		 859 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  30.85 
 
 		 705 aa  244  6e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.28 
 
 		 706 aa  243  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  31.44 
 
 		 749 aa  242  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  28.7 
 
 		 817 aa  239  9e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  30.26 
 
 		 677 aa  238  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  29.78 
 
 		 714 aa  239  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  29.78 
 
 		 714 aa  239  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  30.41 
 
 		 721 aa  238  4e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  28.76 
 
 		 730 aa  232  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  30.63 
 
 		 737 aa  231  4e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  28.76 
 
 		 719 aa  230  7e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  27.05 
 
 		 860 aa  229  9e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  28.89 
 
 		 713 aa  228  4e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  28.55 
 
 		 738 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  29.41 
 
 		 742 aa  226  9e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 829 aa  225  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  29.41 
 
 		 742 aa  225  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  26.68 
 
 		 770 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  30.35 
 
 		 719 aa  223  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  30.58 
 
 		 795 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  30.39 
 
 		 795 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  26.68 
 
 		 710 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  27.22 
 
 		 710 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  29.9 
 
 		 708 aa  221  5e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  29.61 
 
 		 796 aa  220  6e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  27.68 
 
 		 713 aa  220  7.999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0391  TonB-dependent siderophore receptor  29.38 
 
 		 712 aa  220  7.999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.196206  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  28.82 
 
 		 701 aa  219  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  30.85 
 
 		 726 aa  218  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  27.54 
 
 		 713 aa  218  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>