More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4805 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 791 aa  1621    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0685  TonB-dependent siderophore receptor  44.6 
 
 		 781 aa  664    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5755  TonB-dependent siderophore receptor  52.69 
 
 		 793 aa  798    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2470  TonB-dependent siderophore receptor  61.99 
 
 		 794 aa  984    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.555764  normal  0.521946 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  56.58 
 
 		 807 aa  920    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6718  TonB-dependent siderophore receptor  41.53 
 
 		 805 aa  614  9.999999999999999e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.960052 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  27.42 
 
 		 824 aa  291  5.0000000000000004e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1761  TonB-dependent siderophore receptor  29.69 
 
 		 769 aa  288  2.9999999999999996e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00472024  normal  0.310787 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  27.36 
 
 		 812 aa  278  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  27.89 
 
 		 814 aa  273  1e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  28.86 
 
 		 806 aa  260  8e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  28.65 
 
 		 850 aa  251  3e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0816  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 816 aa  251  5e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  29.26 
 
 		 815 aa  249  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  29.34 
 
 		 864 aa  246  9e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5324  TonB-dependent siderophore receptor  28.14 
 
 		 710 aa  243  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0890511 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 789 aa  238  4e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  29.41 
 
 		 825 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  29.66 
 
 		 825 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  28.29 
 
 		 862 aa  234  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  27.69 
 
 		 809 aa  234  5e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  27.92 
 
 		 837 aa  228  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  29.57 
 
 		 843 aa  228  5.0000000000000005e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2496  TonB-dependent siderophore receptor  25.74 
 
 		 785 aa  227  8e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2844  TonB-dependent siderophore receptor  27.2 
 
 		 782 aa  226  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5681  TonB-dependent siderophore receptor  27.46 
 
 		 786 aa  224  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0807191 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3121  TonB-dependent siderophore receptor  27.4 
 
 		 809 aa  223  9e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  27.97 
 
 		 859 aa  223  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  28.24 
 
 		 708 aa  218  5e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0199  TonB-dependent siderophore receptor  26.88 
 
 		 810 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  28.78 
 
 		 817 aa  214  7e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2119  TonB-dependent siderophore receptor  27.08 
 
 		 810 aa  210  7e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  27.63 
 
 		 711 aa  210  9e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  27.07 
 
 		 708 aa  209  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2284  TonB-dependent siderophore receptor  25.4 
 
 		 767 aa  207  5e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  27.69 
 
 		 709 aa  207  6e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2785  TonB-dependent siderophore receptor  26.18 
 
 		 786 aa  207  7e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00424821  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  28.84 
 
 		 860 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  27.16 
 
 		 708 aa  206  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  28 
 
 		 711 aa  205  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3233  TonB-dependent siderophore receptor  24.37 
 
 		 907 aa  204  5e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000192727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  26.76 
 
 		 795 aa  202  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  28.71 
 
 		 689 aa  201  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  27.65 
 
 		 710 aa  201  5e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  26.35 
 
 		 696 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  25.75 
 
 		 726 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  27.82 
 
 		 734 aa  197  6e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  25.75 
 
 		 726 aa  197  6e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  27.22 
 
 		 701 aa  197  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  26.95 
 
 		 703 aa  197  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  26.2 
 
 		 743 aa  196  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  25.98 
 
 		 696 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  27.75 
 
 		 710 aa  195  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  26.72 
 
 		 703 aa  194  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  26.74 
 
 		 714 aa  194  8e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.06 
 
 		 703 aa  193  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  26.32 
 
 		 713 aa  193  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  26.81 
 
 		 722 aa  192  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  27.56 
 
 		 741 aa  192  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  23.94 
 
 		 795 aa  191  5.999999999999999e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  26.85 
 
 		 710 aa  190  8e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5138  TonB-dependent siderophore receptor  25.53 
 
 		 789 aa  189  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0272944 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  26.91 
 
 		 701 aa  189  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  27.83 
 
 		 689 aa  189  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  27.47 
 
 		 701 aa  188  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  28.38 
 
 		 689 aa  188  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  26.32 
 
 		 701 aa  187  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  28.12 
 
 		 738 aa  187  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  26.33 
 
 		 757 aa  187  6e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  25.66 
 
 		 724 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  26.33 
 
 		 701 aa  186  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 709 aa  186  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  26.44 
 
 		 701 aa  183  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  24.91 
 
 		 776 aa  183  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  26.44 
 
 		 701 aa  183  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  27.47 
 
 		 732 aa  183  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  28.24 
 
 		 692 aa  182  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1729  TonB-dependent siderophore receptor  26.13 
 
 		 852 aa  182  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411333 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  26.35 
 
 		 723 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  26.3 
 
 		 701 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.31 
 
 		 833 aa  181  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  26.42 
 
 		 736 aa  181  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  26.25 
 
 		 724 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  26.72 
 
 		 722 aa  180  9e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2280  TonB-dependent siderophore receptor  26.72 
 
 		 742 aa  180  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  26.6 
 
 		 730 aa  179  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11443  ferrichrome-iron receptor  27.14 
 
 		 792 aa  179  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.601841  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  26.63 
 
 		 738 aa  178  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  26.8 
 
 		 802 aa  177  6e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  26.69 
 
 		 715 aa  177  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  25.03 
 
 		 712 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  26.58 
 
 		 797 aa  177  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3331  TonB-dependent siderophore receptor  25.48 
 
 		 766 aa  177  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153274  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  25.17 
 
 		 817 aa  176  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  25.52 
 
 		 808 aa  175  2.9999999999999996e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  26.91 
 
 		 742 aa  173  9e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  26.91 
 
 		 742 aa  173  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  27.02 
 
 		 801 aa  172  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  26.14 
 
 		 829 aa  170  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1367  TonB-dependent siderophore receptor  25.14 
 
 		 745 aa  170  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0632202  normal  0.0485131 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>