More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2470 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2470  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 794 aa  1623    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.555764  normal  0.521946 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  56.61 
 
 		 807 aa  926    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  61.99 
 
 		 791 aa  1016    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5755  TonB-dependent siderophore receptor  49.74 
 
 		 793 aa  729    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0685  TonB-dependent siderophore receptor  43.36 
 
 		 781 aa  639    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6718  TonB-dependent siderophore receptor  41.88 
 
 		 805 aa  579  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.960052 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  27.33 
 
 		 814 aa  264  6e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  26.56 
 
 		 812 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  26.47 
 
 		 824 aa  252  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  30.2 
 
 		 864 aa  243  7e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  29.45 
 
 		 862 aa  242  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5324  TonB-dependent siderophore receptor  29.58 
 
 		 710 aa  242  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0890511 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  29.77 
 
 		 815 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1761  TonB-dependent siderophore receptor  28.1 
 
 		 769 aa  236  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00472024  normal  0.310787 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  28.44 
 
 		 837 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  28.99 
 
 		 711 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  28.29 
 
 		 850 aa  229  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  27.99 
 
 		 708 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  28.28 
 
 		 709 aa  223  9e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  26.42 
 
 		 789 aa  221  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2844  TonB-dependent siderophore receptor  26.72 
 
 		 782 aa  221  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  27.66 
 
 		 734 aa  220  6e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  29.87 
 
 		 806 aa  220  7e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  29.3 
 
 		 817 aa  220  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  27.13 
 
 		 809 aa  219  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  28.75 
 
 		 843 aa  218  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  28.44 
 
 		 825 aa  214  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2119  TonB-dependent siderophore receptor  25.81 
 
 		 810 aa  214  4.9999999999999996e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2284  TonB-dependent siderophore receptor  26.25 
 
 		 767 aa  214  5.999999999999999e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  28.44 
 
 		 825 aa  213  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  26.14 
 
 		 708 aa  208  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5681  TonB-dependent siderophore receptor  26.96 
 
 		 786 aa  207  6e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0807191 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  27.53 
 
 		 795 aa  207  6e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  29.88 
 
 		 689 aa  207  6e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  28.7 
 
 		 738 aa  206  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  27.91 
 
 		 708 aa  201  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  28.51 
 
 		 701 aa  199  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  27.5 
 
 		 859 aa  199  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0816  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 816 aa  197  6e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2496  TonB-dependent siderophore receptor  25.92 
 
 		 785 aa  197  9e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3121  TonB-dependent siderophore receptor  27.76 
 
 		 809 aa  194  7e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.99 
 
 		 711 aa  194  8e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  26.35 
 
 		 713 aa  194  8e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  25.59 
 
 		 795 aa  193  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  27.35 
 
 		 730 aa  193  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  27.63 
 
 		 703 aa  192  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0199  TonB-dependent siderophore receptor  25.42 
 
 		 810 aa  192  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  26.15 
 
 		 860 aa  191  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  28.25 
 
 		 689 aa  191  5e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  25.48 
 
 		 709 aa  191  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  28.11 
 
 		 692 aa  190  9e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  25.91 
 
 		 696 aa  188  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2785  TonB-dependent siderophore receptor  26.12 
 
 		 786 aa  188  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00424821  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1729  TonB-dependent siderophore receptor  24.94 
 
 		 852 aa  188  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411333 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  25.91 
 
 		 696 aa  188  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  26.97 
 
 		 722 aa  188  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  26.7 
 
 		 710 aa  187  9e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3233  TonB-dependent siderophore receptor  25.39 
 
 		 907 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000192727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  28.98 
 
 		 737 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  26.51 
 
 		 736 aa  183  9.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  26.28 
 
 		 703 aa  182  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  28.88 
 
 		 748 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  28.88 
 
 		 748 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2280  TonB-dependent siderophore receptor  25.75 
 
 		 742 aa  179  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  26.15 
 
 		 715 aa  180  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3331  TonB-dependent siderophore receptor  25.9 
 
 		 766 aa  179  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153274  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  26.4 
 
 		 741 aa  179  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.1 
 
 		 703 aa  177  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5138  TonB-dependent siderophore receptor  26.91 
 
 		 789 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0272944 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  27.01 
 
 		 710 aa  176  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  27.34 
 
 		 689 aa  175  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  25.43 
 
 		 712 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  28.47 
 
 		 749 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  27.22 
 
 		 738 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  26.44 
 
 		 829 aa  174  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  25.76 
 
 		 714 aa  173  9e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  26.67 
 
 		 701 aa  173  9e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  26.32 
 
 		 707 aa  173  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  25.99 
 
 		 724 aa  172  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  27.21 
 
 		 742 aa  172  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 742 aa  172  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  25.78 
 
 		 723 aa  172  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  25.15 
 
 		 808 aa  171  3e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  25.53 
 
 		 732 aa  171  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 701 aa  171  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  26.86 
 
 		 720 aa  169  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  25.71 
 
 		 724 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  26.12 
 
 		 779 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  27.94 
 
 		 701 aa  169  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  25.45 
 
 		 722 aa  169  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  26.21 
 
 		 710 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  26.36 
 
 		 778 aa  168  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  26.3 
 
 		 801 aa  168  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  28.02 
 
 		 740 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  26.56 
 
 		 757 aa  167  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  25.14 
 
 		 726 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  25.63 
 
 		 743 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  26.87 
 
 		 703 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  26.18 
 
 		 706 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  26.18 
 
 		 706 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>