More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4928 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  88.02 
 
 		 701 aa  1290    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  74.82 
 
 		 703 aa  1060    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  87.16 
 
 		 701 aa  1284    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 701 aa  1422    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  96.29 
 
 		 701 aa  1379    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  87.16 
 
 		 701 aa  1284    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  99 
 
 		 701 aa  1407    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  50.76 
 
 		 689 aa  634  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  43.59 
 
 		 757 aa  575  1.0000000000000001e-163  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  43.22 
 
 		 722 aa  575  1.0000000000000001e-163  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  44.97 
 
 		 722 aa  554  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  42.09 
 
 		 708 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  42.19 
 
 		 712 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  41.51 
 
 		 703 aa  511  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  40.92 
 
 		 701 aa  505  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04088  TonB-dependent outer membrane Receptor  41.45 
 
 		 713 aa  489  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  40.2 
 
 		 702 aa  490  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  40.2 
 
 		 702 aa  490  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  41.8 
 
 		 710 aa  489  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  40 
 
 		 709 aa  471  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  40.46 
 
 		 708 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  38.44 
 
 		 701 aa  451  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  38.7 
 
 		 696 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  38.56 
 
 		 696 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  39.11 
 
 		 711 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  36.92 
 
 		 703 aa  443  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  37.2 
 
 		 703 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  40.2 
 
 		 734 aa  445  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  41.34 
 
 		 689 aa  442  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  36.29 
 
 		 724 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  40.31 
 
 		 689 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  38.97 
 
 		 692 aa  437  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  36.29 
 
 		 724 aa  438  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  40.15 
 
 		 736 aa  434  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  36.57 
 
 		 723 aa  433  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  36.15 
 
 		 715 aa  429  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  38.52 
 
 		 708 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  36.33 
 
 		 720 aa  426  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  38.98 
 
 		 710 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  36.19 
 
 		 720 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  40.12 
 
 		 738 aa  422  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  36.19 
 
 		 720 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  37.5 
 
 		 707 aa  419  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  39.55 
 
 		 732 aa  419  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  39.55 
 
 		 714 aa  421  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  35.9 
 
 		 720 aa  422  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  38.69 
 
 		 741 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  36.27 
 
 		 714 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  37.77 
 
 		 711 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  38.48 
 
 		 722 aa  413  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  37.46 
 
 		 710 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  37.06 
 
 		 709 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  35.22 
 
 		 720 aa  403  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01528  TonB-dependent receptor  36.13 
 
 		 720 aa  402  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3611  homoserine O-acetyltransferase  35.96 
 
 		 699 aa  399  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000219924  decreased coverage  0.00028675 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  37.12 
 
 		 715 aa  385  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  38.08 
 
 		 730 aa  383  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  33.28 
 
 		 850 aa  313  9e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  32.34 
 
 		 843 aa  303  6.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  32.88 
 
 		 817 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  32.22 
 
 		 864 aa  294  4e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  32.17 
 
 		 837 aa  292  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  31.13 
 
 		 862 aa  291  3e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  33.96 
 
 		 860 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  32.02 
 
 		 815 aa  287  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  31.21 
 
 		 825 aa  274  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  31.21 
 
 		 825 aa  273  6e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  30.72 
 
 		 726 aa  271  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  30.72 
 
 		 726 aa  269  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  31.86 
 
 		 796 aa  266  8e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  30.73 
 
 		 859 aa  265  3e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  31.02 
 
 		 743 aa  262  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  31.2 
 
 		 721 aa  261  3e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  31.39 
 
 		 796 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0020  TonB-dependent siderophore receptor  32.19 
 
 		 881 aa  254  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655193  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1422  TonB-dependent siderophore receptor  32.19 
 
 		 881 aa  254  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1509  TonB-dependent siderophore receptor  32 
 
 		 882 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826442  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  29.95 
 
 		 707 aa  254  5.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  31.2 
 
 		 796 aa  253  7e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  30.49 
 
 		 726 aa  252  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1162  TonB-dependent siderophore receptor  32.05 
 
 		 881 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283901  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1180  TonB-dependent siderophore receptor  32.17 
 
 		 679 aa  252  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14569  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1381  TonB-dependent siderophore receptor  31.73 
 
 		 742 aa  252  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00176773  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  30.97 
 
 		 796 aa  252  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0418  TonB-dependent siderophore receptor  32.05 
 
 		 921 aa  251  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0139  TonB-dependent siderophore receptor  32.05 
 
 		 921 aa  251  3e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354912  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  31.68 
 
 		 795 aa  249  8e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  31.77 
 
 		 795 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3640  TonB-dependent siderophore receptor  31.05 
 
 		 767 aa  246  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0918046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  29.49 
 
 		 810 aa  244  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0879  TonB-dependent siderophore receptor  31.39 
 
 		 855 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.136442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1361  TonB-dependent siderophore receptor  31.39 
 
 		 855 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586931  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0006  TonB-dependent siderophore receptor  32.92 
 
 		 709 aa  243  6e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  31.59 
 
 		 719 aa  243  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  29.78 
 
 		 770 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  29.5 
 
 		 714 aa  243  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  30.01 
 
 		 710 aa  243  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  29.5 
 
 		 714 aa  243  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  29.96 
 
 		 677 aa  242  2e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  29.96 
 
 		 809 aa  240  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>