More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4221 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
795 aa  1608    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0199  TonB-dependent siderophore receptor  42.86 
 
 
810 aa  626  1e-178  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  43.54 
 
 
809 aa  625  1e-177  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2119  TonB-dependent siderophore receptor  43.02 
 
 
810 aa  619  1e-176  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  39.83 
 
 
806 aa  578  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5681  TonB-dependent siderophore receptor  40.65 
 
 
786 aa  568  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0807191 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5138  TonB-dependent siderophore receptor  41.94 
 
 
789 aa  565  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0272944 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3233  TonB-dependent siderophore receptor  38.87 
 
 
907 aa  552  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000192727  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  39.85 
 
 
808 aa  550  1e-155  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2496  TonB-dependent siderophore receptor  39.08 
 
 
785 aa  526  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0816  TonB-dependent receptor  37.38 
 
 
816 aa  525  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1729  TonB-dependent siderophore receptor  37.34 
 
 
852 aa  502  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.411333 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2844  TonB-dependent siderophore receptor  37.58 
 
 
782 aa  502  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350592  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2284  TonB-dependent siderophore receptor  39.25 
 
 
767 aa  493  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1761  TonB-dependent siderophore receptor  35.99 
 
 
769 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00472024  normal  0.310787 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  26.01 
 
 
812 aa  238  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  28.06 
 
 
850 aa  236  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  28.35 
 
 
789 aa  235  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  28.97 
 
 
859 aa  233  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  28.66 
 
 
864 aa  227  7e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  28.18 
 
 
807 aa  224  4e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  27.79 
 
 
825 aa  220  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  27.07 
 
 
843 aa  218  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  26.37 
 
 
825 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  27.08 
 
 
860 aa  214  7e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  29.6 
 
 
837 aa  213  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  27 
 
 
791 aa  211  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2470  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 
794 aa  208  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.555764  normal  0.521946 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11443  ferrichrome-iron receptor  27.62 
 
 
792 aa  207  5e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.601841  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3121  TonB-dependent siderophore receptor  26.15 
 
 
809 aa  205  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  26.24 
 
 
795 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  25.87 
 
 
815 aa  200  9e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  27.89 
 
 
711 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2280  TonB-dependent siderophore receptor  27.58 
 
 
742 aa  198  4.0000000000000005e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6718  TonB-dependent siderophore receptor  25.32 
 
 
805 aa  195  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.960052 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  26.33 
 
 
862 aa  195  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5755  TonB-dependent siderophore receptor  27.25 
 
 
793 aa  195  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  26.46 
 
 
730 aa  187  9e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  26.72 
 
 
741 aa  184  6e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  25.71 
 
 
708 aa  182  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  25.8 
 
 
709 aa  178  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  27.1 
 
 
817 aa  177  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  25.44 
 
 
708 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  26.6 
 
 
701 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  27.54 
 
 
692 aa  174  7.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  24.3 
 
 
708 aa  171  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3412  ferrichrome iron receptor  26.32 
 
 
691 aa  169  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000883951  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  26.03 
 
 
709 aa  168  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  27.09 
 
 
715 aa  167  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0685  TonB-dependent siderophore receptor  24.81 
 
 
781 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  26.63 
 
 
722 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  24.53 
 
 
726 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  25.63 
 
 
757 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  27.56 
 
 
730 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  34.06 
 
 
814 aa  165  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  24.47 
 
 
726 aa  165  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  27.02 
 
 
770 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  23.48 
 
 
709 aa  164  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.69 
 
 
703 aa  164  7e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  27.02 
 
 
710 aa  163  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  26.78 
 
 
707 aa  163  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  27.41 
 
 
710 aa  163  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  25.6 
 
 
821 aa  162  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  24.59 
 
 
743 aa  162  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  25.82 
 
 
712 aa  161  6e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  25.29 
 
 
696 aa  160  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  26.83 
 
 
703 aa  159  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  26.07 
 
 
738 aa  159  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  27.33 
 
 
713 aa  159  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  25.81 
 
 
797 aa  157  6e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  25.78 
 
 
710 aa  157  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  25.34 
 
 
696 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  25.54 
 
 
696 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  24.69 
 
 
713 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  25.15 
 
 
734 aa  155  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  27.05 
 
 
792 aa  154  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  26.52 
 
 
705 aa  154  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  26.2 
 
 
724 aa  154  5e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  23.74 
 
 
733 aa  154  5e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2327  TonB-dependent siderophore receptor  24.07 
 
 
790 aa  154  7e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.929044  normal  0.271692 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  24.32 
 
 
705 aa  153  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  24.45 
 
 
713 aa  152  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  25.92 
 
 
723 aa  152  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  23.63 
 
 
680 aa  152  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  24.48 
 
 
806 aa  152  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  24.45 
 
 
713 aa  151  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  27.32 
 
 
720 aa  150  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0607  TonB-dependent siderophore receptor  26.12 
 
 
706 aa  149  2.0000000000000003e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3331  TonB-dependent siderophore receptor  25.58 
 
 
766 aa  149  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153274  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  25.92 
 
 
724 aa  148  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  26.02 
 
 
828 aa  148  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  26.17 
 
 
710 aa  147  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  24.75 
 
 
689 aa  147  9e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  24.43 
 
 
801 aa  147  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.07 
 
 
711 aa  147  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.35 
 
 
706 aa  147  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  24.68 
 
 
808 aa  147  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  26.62 
 
 
796 aa  146  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  26.86 
 
 
796 aa  146  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4239  TonB-dependent siderophore receptor  25.93 
 
 
781 aa  145  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.475083 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>