More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3121 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  44.28 
 
 		 812 aa  709    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3121  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 809 aa  1631    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2280  TonB-dependent siderophore receptor  43.39 
 
 		 742 aa  572  1.0000000000000001e-162  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2785  TonB-dependent siderophore receptor  28.82 
 
 		 786 aa  270  1e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00424821  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11443  ferrichrome-iron receptor  28.71 
 
 		 792 aa  268  2e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.601841  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2496  TonB-dependent siderophore receptor  27.8 
 
 		 785 aa  249  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  28.05 
 
 		 809 aa  244  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1761  TonB-dependent siderophore receptor  28.4 
 
 		 769 aa  241  5e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00472024  normal  0.310787 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  25.35 
 
 		 806 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  29 
 
 		 815 aa  235  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2119  TonB-dependent siderophore receptor  27.49 
 
 		 810 aa  229  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  27.81 
 
 		 850 aa  229  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0816  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 816 aa  229  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5681  TonB-dependent siderophore receptor  27.96 
 
 		 786 aa  226  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0807191 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  27.4 
 
 		 791 aa  223  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  28.4 
 
 		 712 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2284  TonB-dependent siderophore receptor  29.35 
 
 		 767 aa  220  7e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  27.11 
 
 		 824 aa  216  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  27.45 
 
 		 707 aa  216  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  27.42 
 
 		 789 aa  213  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  28.61 
 
 		 843 aa  212  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0199  TonB-dependent siderophore receptor  27.78 
 
 		 810 aa  207  9e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  26.71 
 
 		 701 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  26.56 
 
 		 701 aa  205  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  26.56 
 
 		 701 aa  205  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  26.93 
 
 		 776 aa  204  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  26.62 
 
 		 703 aa  204  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1729  TonB-dependent siderophore receptor  27.23 
 
 		 852 aa  204  8e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411333 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  26.85 
 
 		 701 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  28.88 
 
 		 817 aa  203  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  28.35 
 
 		 757 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  28.35 
 
 		 709 aa  202  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  25.41 
 
 		 708 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  26.72 
 
 		 864 aa  201  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  27.85 
 
 		 689 aa  200  9e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  27.14 
 
 		 862 aa  200  9e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3611  homoserine O-acetyltransferase  29.2 
 
 		 699 aa  199  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000219924  decreased coverage  0.00028675 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  27.75 
 
 		 837 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  26.16 
 
 		 701 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  27.31 
 
 		 694 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5755  TonB-dependent siderophore receptor  26.91 
 
 		 793 aa  197  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  26.16 
 
 		 701 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  28.14 
 
 		 825 aa  197  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  25.59 
 
 		 709 aa  196  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2844  TonB-dependent siderophore receptor  25.68 
 
 		 782 aa  195  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350592  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 715 aa  195  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  25.92 
 
 		 703 aa  195  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  27.75 
 
 		 859 aa  195  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  26.15 
 
 		 795 aa  194  4e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  27.83 
 
 		 825 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  27.68 
 
 		 711 aa  194  6e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  27.72 
 
 		 715 aa  194  6e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  25.36 
 
 		 807 aa  194  6e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  27.77 
 
 		 708 aa  194  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.78 
 
 		 703 aa  193  9e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2470  TonB-dependent siderophore receptor  27.76 
 
 		 794 aa  193  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.555764  normal  0.521946 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  24.97 
 
 		 707 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  26.98 
 
 		 709 aa  191  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  27.86 
 
 		 708 aa  191  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3233  TonB-dependent siderophore receptor  26.64 
 
 		 907 aa  191  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000192727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  25.52 
 
 		 814 aa  191  5.999999999999999e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  27.71 
 
 		 701 aa  191  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  28.75 
 
 		 722 aa  190  7e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  26.97 
 
 		 860 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  27.09 
 
 		 689 aa  188  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  26.95 
 
 		 719 aa  188  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1175  TonB-dependent siderophore receptor  26.79 
 
 		 749 aa  188  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1655  TonB-dependent siderophore receptor  26.7 
 
 		 656 aa  188  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  26.31 
 
 		 703 aa  187  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  25.14 
 
 		 701 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  25.94 
 
 		 720 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6718  TonB-dependent siderophore receptor  25.92 
 
 		 805 aa  186  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.960052 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  25.94 
 
 		 720 aa  185  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  25.63 
 
 		 724 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  25.63 
 
 		 723 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1629  TonB-dependent siderophore receptor  26.52 
 
 		 712 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385709 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  25.96 
 
 		 720 aa  184  6e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  25.66 
 
 		 720 aa  184  6e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  26.06 
 
 		 710 aa  184  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  25.34 
 
 		 745 aa  184  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  26.06 
 
 		 770 aa  184  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  25.88 
 
 		 724 aa  184  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  26.2 
 
 		 710 aa  183  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  28.17 
 
 		 722 aa  183  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  26.81 
 
 		 714 aa  182  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  27.9 
 
 		 710 aa  182  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  25.66 
 
 		 720 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5138  TonB-dependent siderophore receptor  25.8 
 
 		 789 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0272944 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0391  TonB-dependent siderophore receptor  26.59 
 
 		 712 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.196206  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  26.69 
 
 		 734 aa  181  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  27.62 
 
 		 722 aa  181  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  26.89 
 
 		 757 aa  181  5.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  26.8 
 
 		 696 aa  180  8e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  26.5 
 
 		 696 aa  180  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  28.06 
 
 		 713 aa  179  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  28.17 
 
 		 707 aa  178  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  25.61 
 
 		 702 aa  178  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  25.61 
 
 		 702 aa  178  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  26.47 
 
 		 741 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  27.79 
 
 		 730 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>