More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2282 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  51.48 
 
 		 806 aa  824    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0816  TonB-dependent receptor  50.43 
 
 		 816 aa  803    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2119  TonB-dependent siderophore receptor  49.14 
 
 		 810 aa  748    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0199  TonB-dependent siderophore receptor  44.39 
 
 		 810 aa  659    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 809 aa  1642    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  47.96 
 
 		 808 aa  726    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3233  TonB-dependent siderophore receptor  42.36 
 
 		 907 aa  614  9.999999999999999e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000192727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  42.68 
 
 		 795 aa  603  1.0000000000000001e-171  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5138  TonB-dependent siderophore receptor  42.96 
 
 		 789 aa  556  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0272944 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2284  TonB-dependent siderophore receptor  40.24 
 
 		 767 aa  537  1e-151  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5681  TonB-dependent siderophore receptor  40.48 
 
 		 786 aa  535  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0807191 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2496  TonB-dependent siderophore receptor  38.81 
 
 		 785 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2844  TonB-dependent siderophore receptor  37.83 
 
 		 782 aa  507  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1729  TonB-dependent siderophore receptor  40.03 
 
 		 852 aa  503  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1761  TonB-dependent siderophore receptor  37.44 
 
 		 769 aa  445  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00472024  normal  0.310787 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  26.48 
 
 		 812 aa  274  6e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  27.95 
 
 		 814 aa  268  2.9999999999999995e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  27.26 
 
 		 824 aa  251  5e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3121  TonB-dependent siderophore receptor  28.05 
 
 		 809 aa  244  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  26.74 
 
 		 789 aa  239  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  28.5 
 
 		 859 aa  236  9e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  27.69 
 
 		 791 aa  234  5e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  25.78 
 
 		 850 aa  229  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  26.43 
 
 		 860 aa  216  9e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  27.15 
 
 		 776 aa  216  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  27.25 
 
 		 862 aa  216  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5755  TonB-dependent siderophore receptor  28.38 
 
 		 793 aa  215  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  25.97 
 
 		 807 aa  214  3.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2470  TonB-dependent siderophore receptor  27.13 
 
 		 794 aa  213  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.555764  normal  0.521946 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  26.85 
 
 		 843 aa  212  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  27.64 
 
 		 817 aa  205  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3331  TonB-dependent siderophore receptor  27.72 
 
 		 766 aa  202  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153274  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  26.92 
 
 		 815 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11443  ferrichrome-iron receptor  25.92 
 
 		 792 aa  202  1.9999999999999998e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.601841  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  25.82 
 
 		 730 aa  201  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  25.12 
 
 		 795 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2280  TonB-dependent siderophore receptor  27.81 
 
 		 742 aa  200  9e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  26.5 
 
 		 703 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  28.25 
 
 		 689 aa  198  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3640  TonB-dependent siderophore receptor  26.04 
 
 		 767 aa  197  5.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0918046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6718  TonB-dependent siderophore receptor  24.21 
 
 		 805 aa  196  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.960052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  25.64 
 
 		 837 aa  194  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  25.93 
 
 		 708 aa  194  7e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  25.25 
 
 		 825 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  26.47 
 
 		 701 aa  192  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  25.86 
 
 		 864 aa  191  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  25.79 
 
 		 726 aa  191  5.999999999999999e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  25.79 
 
 		 726 aa  191  7e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  24.96 
 
 		 825 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  26.82 
 
 		 724 aa  189  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  27.29 
 
 		 703 aa  188  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  27.58 
 
 		 738 aa  188  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  25.69 
 
 		 743 aa  188  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  26.53 
 
 		 723 aa  187  6e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  25.51 
 
 		 696 aa  187  9e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  26.48 
 
 		 770 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.3 
 
 		 703 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  25.8 
 
 		 696 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  26.48 
 
 		 710 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  26.53 
 
 		 724 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  26.83 
 
 		 710 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  26.89 
 
 		 734 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2785  TonB-dependent siderophore receptor  23.61 
 
 		 786 aa  185  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00424821  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  25.86 
 
 		 708 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  26.01 
 
 		 711 aa  181  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3412  ferrichrome iron receptor  25.6 
 
 		 691 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000883951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0685  TonB-dependent siderophore receptor  25.82 
 
 		 781 aa  179  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  24.56 
 
 		 709 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 715 aa  178  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  24.48 
 
 		 709 aa  176  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  25.6 
 
 		 736 aa  171  5e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  25.07 
 
 		 701 aa  171  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  25.45 
 
 		 700 aa  170  8e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  25.14 
 
 		 714 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  25.71 
 
 		 720 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  25.03 
 
 		 689 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  24.5 
 
 		 708 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  26.23 
 
 		 720 aa  167  8e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  26.12 
 
 		 720 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  25.71 
 
 		 732 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  24.25 
 
 		 741 aa  164  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  25.35 
 
 		 740 aa  164  6e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  25.67 
 
 		 720 aa  164  7e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  25.62 
 
 		 713 aa  163  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01528  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 720 aa  162  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  25.16 
 
 		 738 aa  162  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  26 
 
 		 707 aa  162  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  25.51 
 
 		 715 aa  160  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  25.32 
 
 		 742 aa  160  7e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  26.37 
 
 		 714 aa  160  9e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  23.38 
 
 		 801 aa  160  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  26.23 
 
 		 713 aa  159  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  26.24 
 
 		 713 aa  159  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1142  TonB-dependent siderophore receptor  24.68 
 
 		 711 aa  159  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.634377  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  25.57 
 
 		 742 aa  159  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  24.93 
 
 		 799 aa  159  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  26.8 
 
 		 713 aa  158  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  24.62 
 
 		 749 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  24.56 
 
 		 748 aa  157  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  26.11 
 
 		 745 aa  157  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>