More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5579 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2280  TonB-dependent siderophore receptor  45.84 
 
 		 742 aa  643    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3121  TonB-dependent siderophore receptor  44.28 
 
 		 809 aa  709    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 812 aa  1672    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2785  TonB-dependent siderophore receptor  29.28 
 
 		 786 aa  331  4e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00424821  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11443  ferrichrome-iron receptor  30.17 
 
 		 792 aa  315  2.9999999999999996e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.601841  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1761  TonB-dependent siderophore receptor  29.5 
 
 		 769 aa  300  8e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00472024  normal  0.310787 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  29.17 
 
 		 815 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5681  TonB-dependent siderophore receptor  28.14 
 
 		 786 aa  293  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0807191 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  31.99 
 
 		 817 aa  291  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  26.96 
 
 		 806 aa  280  8e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  27.36 
 
 		 791 aa  278  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5755  TonB-dependent siderophore receptor  28.53 
 
 		 793 aa  276  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2496  TonB-dependent siderophore receptor  26.22 
 
 		 785 aa  274  6e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  26.48 
 
 		 809 aa  274  6e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  30.95 
 
 		 850 aa  273  7e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2844  TonB-dependent siderophore receptor  27.57 
 
 		 782 aa  271  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  29.26 
 
 		 864 aa  270  7e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6718  TonB-dependent siderophore receptor  27.67 
 
 		 805 aa  266  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.960052 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3233  TonB-dependent siderophore receptor  27.28 
 
 		 907 aa  265  4e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000192727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  28.18 
 
 		 862 aa  263  8e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  26.78 
 
 		 807 aa  261  3e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  27.75 
 
 		 776 aa  261  4e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2119  TonB-dependent siderophore receptor  27.26 
 
 		 810 aa  259  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1729  TonB-dependent siderophore receptor  26.98 
 
 		 852 aa  252  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411333 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0816  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 816 aa  251  4e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  29.23 
 
 		 825 aa  251  5e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2470  TonB-dependent siderophore receptor  26.76 
 
 		 794 aa  250  7e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.555764  normal  0.521946 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  29 
 
 		 860 aa  250  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  29.23 
 
 		 825 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2284  TonB-dependent siderophore receptor  26.84 
 
 		 767 aa  247  4.9999999999999997e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5138  TonB-dependent siderophore receptor  26.74 
 
 		 789 aa  246  9e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0272944 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  30.52 
 
 		 859 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  24.83 
 
 		 708 aa  245  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  28 
 
 		 710 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  28 
 
 		 770 aa  244  6e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  27.07 
 
 		 789 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0199  TonB-dependent siderophore receptor  26.1 
 
 		 810 aa  242  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  28.29 
 
 		 711 aa  241  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  25.04 
 
 		 703 aa  240  8e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  28.13 
 
 		 694 aa  239  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  28.61 
 
 		 703 aa  239  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  27.12 
 
 		 708 aa  239  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  29.1 
 
 		 708 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  28.02 
 
 		 709 aa  239  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 		 712 aa  238  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  27.31 
 
 		 707 aa  238  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  26.97 
 
 		 715 aa  238  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  28.4 
 
 		 703 aa  236  9e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0685  TonB-dependent siderophore receptor  26.82 
 
 		 781 aa  236  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  26.35 
 
 		 795 aa  234  4.0000000000000004e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  28.22 
 
 		 710 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  26.94 
 
 		 837 aa  233  8.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  27.75 
 
 		 843 aa  233  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  27.97 
 
 		 701 aa  232  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  29.14 
 
 		 706 aa  232  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  29.14 
 
 		 706 aa  232  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  26.18 
 
 		 709 aa  231  5e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  26.73 
 
 		 814 aa  230  6e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  25.93 
 
 		 824 aa  229  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  26.01 
 
 		 795 aa  228  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  28.1 
 
 		 757 aa  227  7e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  28.14 
 
 		 709 aa  226  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 715 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  27.22 
 
 		 719 aa  222  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3611  homoserine O-acetyltransferase  28.98 
 
 		 699 aa  222  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000219924  decreased coverage  0.00028675 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  27.79 
 
 		 701 aa  223  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  29.37 
 
 		 722 aa  221  6e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  27.67 
 
 		 710 aa  219  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  26.92 
 
 		 701 aa  219  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  28.08 
 
 		 792 aa  218  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  29.24 
 
 		 710 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  26.84 
 
 		 701 aa  218  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  27.51 
 
 		 724 aa  218  5e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  26.66 
 
 		 707 aa  217  8e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  28.01 
 
 		 695 aa  216  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  27.69 
 
 		 724 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  28.49 
 
 		 703 aa  215  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  26.36 
 
 		 700 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  27.45 
 
 		 723 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  25.89 
 
 		 701 aa  211  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  25.89 
 
 		 701 aa  211  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.33 
 
 		 711 aa  211  6e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  28.76 
 
 		 789 aa  211  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  25.63 
 
 		 701 aa  210  8e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  28.44 
 
 		 720 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  27.31 
 
 		 696 aa  208  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  27.72 
 
 		 720 aa  208  4e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  27.85 
 
 		 720 aa  208  4e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  28.99 
 
 		 722 aa  207  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  27.63 
 
 		 742 aa  207  6e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  27.58 
 
 		 720 aa  207  8e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  28.76 
 
 		 730 aa  206  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 738 aa  206  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  27.16 
 
 		 696 aa  205  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  27.11 
 
 		 742 aa  205  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  27.9 
 
 		 757 aa  205  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  26.78 
 
 		 689 aa  204  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  26.11 
 
 		 692 aa  204  5e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  26.79 
 
 		 710 aa  204  7e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  28.53 
 
 		 741 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>