More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3155 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  93.37 
 
 		 708 aa  1350    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  100 
 
 		 709 aa  1453    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  71.19 
 
 		 711 aa  1011    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  70.69 
 
 		 710 aa  1004    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  71.95 
 
 		 708 aa  1061    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  85.96 
 
 		 711 aa  1253    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  58.41 
 
 		 710 aa  805    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  45.26 
 
 		 741 aa  587  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  45.05 
 
 		 722 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  47.89 
 
 		 730 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  45.18 
 
 		 696 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  42.7 
 
 		 708 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  45.11 
 
 		 696 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  42.8 
 
 		 703 aa  567  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  46.49 
 
 		 715 aa  560  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  43.06 
 
 		 701 aa  546  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  43.36 
 
 		 703 aa  544  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  43.05 
 
 		 709 aa  541  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  42.92 
 
 		 703 aa  536  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  43 
 
 		 692 aa  531  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  41.26 
 
 		 734 aa  502  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  39.46 
 
 		 738 aa  478  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  40.36 
 
 		 732 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  38.42 
 
 		 701 aa  470  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  39.35 
 
 		 736 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  39.88 
 
 		 714 aa  469  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  40.06 
 
 		 689 aa  464  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  40.9 
 
 		 710 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  38.51 
 
 		 689 aa  442  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  39.49 
 
 		 689 aa  434  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  37.76 
 
 		 701 aa  420  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  37.52 
 
 		 703 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  37.2 
 
 		 701 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  37.2 
 
 		 701 aa  411  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  36.89 
 
 		 701 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  36.89 
 
 		 701 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  36.61 
 
 		 701 aa  405  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  38.01 
 
 		 722 aa  404  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  35.25 
 
 		 722 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  35.57 
 
 		 757 aa  397  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  36.13 
 
 		 712 aa  378  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  34.86 
 
 		 850 aa  372  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  34.77 
 
 		 860 aa  352  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  34.87 
 
 		 837 aa  350  5e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  31.25 
 
 		 723 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  31.1 
 
 		 724 aa  340  4e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  30.28 
 
 		 714 aa  340  7e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04088  TonB-dependent outer membrane Receptor  33.38 
 
 		 713 aa  339  9.999999999999999e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  32.59 
 
 		 825 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  32.59 
 
 		 825 aa  337  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  30.95 
 
 		 724 aa  336  9e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  30.97 
 
 		 702 aa  332  1e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  30.97 
 
 		 702 aa  332  1e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  32.89 
 
 		 859 aa  325  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01528  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 		 720 aa  324  3e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  31.97 
 
 		 726 aa  323  7e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  29.85 
 
 		 720 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 		 720 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 		 720 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  30.61 
 
 		 715 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  32.6 
 
 		 726 aa  321  3e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  29.71 
 
 		 720 aa  320  5e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  33.66 
 
 		 843 aa  320  5e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  33.68 
 
 		 864 aa  317  6e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  31.36 
 
 		 743 aa  316  9.999999999999999e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  32.44 
 
 		 862 aa  313  5.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  33.68 
 
 		 817 aa  306  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  30.01 
 
 		 707 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  31.21 
 
 		 815 aa  303  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  32.27 
 
 		 726 aa  302  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  29.84 
 
 		 720 aa  301  4e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  31.14 
 
 		 727 aa  297  4e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3611  homoserine O-acetyltransferase  29.37 
 
 		 699 aa  290  9e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000219924  decreased coverage  0.00028675 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  32.47 
 
 		 721 aa  286  1.0000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.27 
 
 		 833 aa  279  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  32.04 
 
 		 707 aa  279  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  32.44 
 
 		 796 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  29.36 
 
 		 799 aa  273  6e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6052  putative TonB-dependent siderophore receptor  33.69 
 
 		 766 aa  273  7e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  31.96 
 
 		 724 aa  273  8.000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  30.86 
 
 		 701 aa  272  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  33.53 
 
 		 708 aa  272  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  32.14 
 
 		 795 aa  272  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  31.06 
 
 		 801 aa  271  4e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  30.04 
 
 		 729 aa  270  8.999999999999999e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  33.24 
 
 		 796 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  33 
 
 		 796 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  32.29 
 
 		 795 aa  269  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  30.54 
 
 		 733 aa  268  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  29.66 
 
 		 770 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  31.21 
 
 		 796 aa  266  7e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  29.52 
 
 		 710 aa  266  7e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  32.35 
 
 		 719 aa  266  1e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  32.13 
 
 		 809 aa  265  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  30.42 
 
 		 806 aa  265  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  29.99 
 
 		 710 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  28.82 
 
 		 747 aa  261  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  29.87 
 
 		 778 aa  259  8e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.68 
 
 		 706 aa  259  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  28.95 
 
 		 752 aa  258  2e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>