More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6718 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5755  TonB-dependent siderophore receptor  46.46 
 
 		 793 aa  670    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6718  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 805 aa  1662    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.960052 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  41.53 
 
 		 791 aa  614  9.999999999999999e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0685  TonB-dependent siderophore receptor  39.19 
 
 		 781 aa  595  1e-169  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2470  TonB-dependent siderophore receptor  41.56 
 
 		 794 aa  574  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.555764  normal  0.521946 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  39.35 
 
 		 807 aa  570  1e-161  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5324  TonB-dependent siderophore receptor  29.24 
 
 		 710 aa  273  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0890511 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  27.67 
 
 		 812 aa  266  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  28.79 
 
 		 850 aa  250  7e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 859 aa  248  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2496  TonB-dependent siderophore receptor  28.21 
 
 		 785 aa  248  4e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  26.86 
 
 		 814 aa  243  7e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  27.45 
 
 		 815 aa  243  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  25.62 
 
 		 824 aa  231  4e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2844  TonB-dependent siderophore receptor  26.44 
 
 		 782 aa  230  9e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  26.69 
 
 		 837 aa  224  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5138  TonB-dependent siderophore receptor  26.41 
 
 		 789 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0272944 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1729  TonB-dependent siderophore receptor  26.37 
 
 		 852 aa  213  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  24.55 
 
 		 789 aa  213  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  27.47 
 
 		 708 aa  211  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  27.46 
 
 		 862 aa  211  5e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  28.46 
 
 		 817 aa  211  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  26.92 
 
 		 864 aa  210  9e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1761  TonB-dependent siderophore receptor  26.15 
 
 		 769 aa  207  8e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00472024  normal  0.310787 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  27.7 
 
 		 711 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  27.25 
 
 		 709 aa  206  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  27.17 
 
 		 843 aa  206  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  27.09 
 
 		 701 aa  206  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  26.78 
 
 		 708 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  25.84 
 
 		 708 aa  201  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2284  TonB-dependent siderophore receptor  25.2 
 
 		 767 aa  201  6e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0199  TonB-dependent siderophore receptor  26.49 
 
 		 810 aa  200  9e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  24.21 
 
 		 809 aa  196  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.38 
 
 		 711 aa  194  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  27.87 
 
 		 726 aa  194  6e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  25.42 
 
 		 860 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  28.22 
 
 		 726 aa  192  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 705 aa  192  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3331  TonB-dependent siderophore receptor  24.39 
 
 		 766 aa  192  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153274  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  27.96 
 
 		 743 aa  191  5e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  26.25 
 
 		 806 aa  191  5e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  27.23 
 
 		 689 aa  191  5.999999999999999e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2280  TonB-dependent siderophore receptor  26.64 
 
 		 742 aa  189  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  26.25 
 
 		 710 aa  189  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5681  TonB-dependent siderophore receptor  24.76 
 
 		 786 aa  189  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0807191 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1367  TonB-dependent siderophore receptor  24.42 
 
 		 745 aa  189  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0632202  normal  0.0485131 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  24.85 
 
 		 703 aa  187  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  27.7 
 
 		 749 aa  187  6e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  25.86 
 
 		 703 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  25.53 
 
 		 701 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  26.65 
 
 		 723 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  26.65 
 
 		 724 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  26.65 
 
 		 724 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3121  TonB-dependent siderophore receptor  25.92 
 
 		 809 aa  186  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  25.75 
 
 		 696 aa  185  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  25.17 
 
 		 795 aa  185  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  25.95 
 
 		 825 aa  185  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  27.38 
 
 		 748 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  27.38 
 
 		 748 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.7 
 
 		 703 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  25.75 
 
 		 696 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  25.52 
 
 		 829 aa  184  6e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  26.19 
 
 		 825 aa  184  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3233  TonB-dependent siderophore receptor  23.26 
 
 		 907 aa  184  7e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000192727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2119  TonB-dependent siderophore receptor  23.84 
 
 		 810 aa  183  9.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  26.85 
 
 		 801 aa  183  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0816  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 816 aa  182  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0395  ferrichrome-iron receptor  25.04 
 
 		 696 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.458077  hitchhiker  0.000000000000143872 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  28.71 
 
 		 738 aa  182  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0398  ferrichrome-iron receptor  25.14 
 
 		 698 aa  182  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0416  ferrichrome-iron receptor  24.89 
 
 		 696 aa  181  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  27.24 
 
 		 710 aa  181  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  25.63 
 
 		 808 aa  181  5.999999999999999e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  25.51 
 
 		 730 aa  181  5.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  27.36 
 
 		 701 aa  181  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  26.03 
 
 		 741 aa  180  7e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  27.81 
 
 		 742 aa  179  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11443  ferrichrome-iron receptor  25.2 
 
 		 792 aa  179  1e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.601841  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  27.7 
 
 		 710 aa  179  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1028  TonB-dependent siderophore receptor  26.2 
 
 		 718 aa  180  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.289591  normal  0.407367 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0404  ferrichrome-iron receptor  24.89 
 
 		 696 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000262521 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0458  ferrichrome-iron receptor  24.75 
 
 		 696 aa  178  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000766311 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  27.81 
 
 		 742 aa  179  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  27.23 
 
 		 737 aa  177  6e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  24.53 
 
 		 707 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  24.7 
 
 		 712 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  25.26 
 
 		 817 aa  174  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0946  TonB-dependent siderophore receptor  26.06 
 
 		 715 aa  174  6.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  23.76 
 
 		 797 aa  174  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  25.04 
 
 		 829 aa  173  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0946  TonB-dependent siderophore receptor  25.62 
 
 		 706 aa  173  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  25.7 
 
 		 689 aa  172  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  26.47 
 
 		 740 aa  172  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  25.28 
 
 		 701 aa  171  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  25.27 
 
 		 722 aa  171  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  24.96 
 
 		 692 aa  171  6e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  26.34 
 
 		 734 aa  170  8e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  24.78 
 
 		 778 aa  170  9e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  25.22 
 
 		 799 aa  169  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  24.52 
 
 		 735 aa  169  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>