More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_B0148 on replicon NC_007410
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
862 aa  1733    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  66.13 
 
 
843 aa  1134    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  53.36 
 
 
850 aa  847    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  54.18 
 
 
859 aa  838    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  58.07 
 
 
864 aa  946    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  44.07 
 
 
817 aa  590  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  38.6 
 
 
837 aa  527  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  38.1 
 
 
860 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  39.69 
 
 
815 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  39.76 
 
 
825 aa  502  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  39.44 
 
 
825 aa  497  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  35.56 
 
 
734 aa  379  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  35.78 
 
 
741 aa  376  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  35.31 
 
 
722 aa  365  3e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  33.52 
 
 
708 aa  364  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  33.43 
 
 
703 aa  363  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  33.73 
 
 
715 aa  359  9.999999999999999e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  34.21 
 
 
736 aa  356  1e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  32.65 
 
 
711 aa  355  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  35.12 
 
 
738 aa  354  4e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  33.28 
 
 
708 aa  353  7e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  34.97 
 
 
732 aa  350  9e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  34.32 
 
 
703 aa  349  1e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  32.36 
 
 
709 aa  348  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  34.37 
 
 
714 aa  348  2e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  35.4 
 
 
726 aa  348  3e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  35.26 
 
 
726 aa  347  4e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  32.52 
 
 
708 aa  343  8e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  33.14 
 
 
701 aa  342  1e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  33.24 
 
 
696 aa  340  7e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 
689 aa  340  8e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  34.6 
 
 
743 aa  339  9.999999999999999e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  33.53 
 
 
703 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  34.37 
 
 
689 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  32.55 
 
 
701 aa  337  5e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  33.38 
 
 
722 aa  336  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  34.39 
 
 
722 aa  335  2e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  32.95 
 
 
696 aa  333  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  32.69 
 
 
709 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  34.25 
 
 
692 aa  332  2e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  32.98 
 
 
730 aa  330  7e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 
757 aa  327  5e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.28 
 
 
711 aa  325  3e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  31.62 
 
 
710 aa  323  9.000000000000001e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  32.64 
 
 
712 aa  323  9.999999999999999e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  33.88 
 
 
689 aa  322  1.9999999999999998e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  33.59 
 
 
710 aa  321  3e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  32.28 
 
 
701 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  34.27 
 
 
726 aa  310  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  32.95 
 
 
710 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  31.42 
 
 
701 aa  305  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  31.42 
 
 
701 aa  301  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  32.28 
 
 
703 aa  298  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  32.39 
 
 
701 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  32.39 
 
 
701 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  32.24 
 
 
701 aa  298  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5755  TonB-dependent siderophore receptor  31.91 
 
 
793 aa  292  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  31.18 
 
 
792 aa  291  4e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  32.15 
 
 
819 aa  288  2e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  31.05 
 
 
829 aa  288  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  31.34 
 
 
799 aa  285  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  32.05 
 
 
724 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  32.35 
 
 
723 aa  283  9e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  30.97 
 
 
821 aa  282  2e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  31.91 
 
 
719 aa  282  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  30.87 
 
 
724 aa  280  6e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  28.29 
 
 
797 aa  280  9e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  28.3 
 
 
812 aa  280  9e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  29.27 
 
 
713 aa  279  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  30.82 
 
 
789 aa  280  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04088  TonB-dependent outer membrane Receptor  30.56 
 
 
713 aa  279  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  31.66 
 
 
801 aa  279  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  31.36 
 
 
715 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  29.5 
 
 
707 aa  274  7e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  31.11 
 
 
769 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  29.34 
 
 
807 aa  270  7e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  30.95 
 
 
817 aa  270  8e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  29.34 
 
 
701 aa  269  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  30.66 
 
 
714 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  30.21 
 
 
720 aa  266  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  30.21 
 
 
720 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  29.91 
 
 
720 aa  262  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  30.08 
 
 
796 aa  262  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  29.72 
 
 
720 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  30.5 
 
 
721 aa  260  7e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  28.86 
 
 
710 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  30.3 
 
 
831 aa  259  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  28.71 
 
 
770 aa  259  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  28.71 
 
 
710 aa  259  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  30.26 
 
 
796 aa  256  9e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  30.06 
 
 
796 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2867  TonB-dependent siderophore receptor  30.77 
 
 
733 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132982  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2846  TonB-dependent siderophore receptor, putative  29.47 
 
 
728 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0306235  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  29.52 
 
 
700 aa  254  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  29.8 
 
 
771 aa  255  3e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  31.33 
 
 
695 aa  253  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  30.28 
 
 
829 aa  252  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  30.94 
 
 
706 aa  252  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  30.94 
 
 
706 aa  252  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  29.07 
 
 
730 aa  252  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.121009 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>