More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2076 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  86.78 
 
 
726 aa  1280    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  85.7 
 
 
726 aa  1278    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
743 aa  1495    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  62.62 
 
 
726 aa  871    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  35.57 
 
 
825 aa  359  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  35.57 
 
 
825 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  35.65 
 
 
815 aa  356  6.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  32.58 
 
 
708 aa  348  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  34.07 
 
 
860 aa  348  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  36.49 
 
 
850 aa  345  1e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  34.29 
 
 
708 aa  345  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  33.24 
 
 
703 aa  336  9e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  34.87 
 
 
703 aa  331  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  32.39 
 
 
708 aa  331  3e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  32.87 
 
 
711 aa  331  4e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  34.87 
 
 
703 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  34.63 
 
 
741 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  33.61 
 
 
714 aa  327  5e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  33.68 
 
 
734 aa  326  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  33.97 
 
 
710 aa  326  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  33.48 
 
 
696 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  33.48 
 
 
696 aa  323  5e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  33.15 
 
 
732 aa  323  8e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  32.65 
 
 
709 aa  322  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  32.93 
 
 
736 aa  320  5e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  34.18 
 
 
862 aa  319  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  33.82 
 
 
701 aa  318  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  32.48 
 
 
710 aa  317  4e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  36.32 
 
 
859 aa  317  4e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  34.43 
 
 
843 aa  313  4.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  31.36 
 
 
709 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  34.16 
 
 
715 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  34.78 
 
 
864 aa  312  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  33.92 
 
 
817 aa  312  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.64 
 
 
711 aa  310  9e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  32.97 
 
 
722 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 
689 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  33 
 
 
730 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  32.3 
 
 
837 aa  303  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  32.89 
 
 
738 aa  298  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  31.31 
 
 
692 aa  298  3e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  31.95 
 
 
689 aa  295  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  31.82 
 
 
710 aa  276  8e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  31.89 
 
 
829 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0006  TonB-dependent siderophore receptor  33.62 
 
 
709 aa  273  7e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  29.85 
 
 
722 aa  270  7e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  31.65 
 
 
707 aa  268  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  31.55 
 
 
701 aa  267  5.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  32.44 
 
 
792 aa  267  5.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1499  TonB-dependent siderophore receptor  33.03 
 
 
747 aa  265  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  28.88 
 
 
757 aa  265  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  34.21 
 
 
726 aa  264  4e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  31.02 
 
 
701 aa  262  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  30.92 
 
 
689 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  30.79 
 
 
821 aa  260  7e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  30.88 
 
 
701 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  30.95 
 
 
698 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0885  TonB-dependent siderophore receptor  31.84 
 
 
794 aa  258  3e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.436888  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  29.9 
 
 
701 aa  258  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  31.29 
 
 
801 aa  256  9e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  30.97 
 
 
799 aa  256  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  31.17 
 
 
799 aa  255  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0267  TonB-dependent siderophore receptor  31.43 
 
 
689 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  30.04 
 
 
755 aa  253  9.000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  33.56 
 
 
745 aa  252  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  29.47 
 
 
701 aa  252  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 
701 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 
701 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2053  TonB-dependent siderophore receptor  32.7 
 
 
719 aa  251  4e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  29.83 
 
 
710 aa  250  7e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 
700 aa  250  8e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1381  TonB-dependent siderophore receptor  32.81 
 
 
742 aa  249  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00176773  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  30.29 
 
 
727 aa  248  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  31.65 
 
 
694 aa  249  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2005  TonB-dependent siderophore receptor  31.95 
 
 
724 aa  247  4e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.22147  normal  0.931942 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  29.93 
 
 
770 aa  247  6e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  31.36 
 
 
715 aa  246  8e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  29.97 
 
 
710 aa  246  9e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2282  TonB-dependent siderophore receptor  32.09 
 
 
724 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217728  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  31.84 
 
 
819 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3292  TonB-dependent siderophore receptor  29.22 
 
 
771 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  32.13 
 
 
796 aa  245  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  29.97 
 
 
707 aa  244  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04088  TonB-dependent outer membrane Receptor  29.73 
 
 
713 aa  245  3e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  30.52 
 
 
689 aa  243  6e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  30.12 
 
 
703 aa  244  6e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  32.1 
 
 
796 aa  244  6e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  31.75 
 
 
829 aa  243  7e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  31.35 
 
 
721 aa  243  1e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.91 
 
 
833 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  32.1 
 
 
796 aa  242  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  29.58 
 
 
809 aa  242  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  31.8 
 
 
796 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  31.47 
 
 
795 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  30.25 
 
 
753 aa  238  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  30.68 
 
 
708 aa  237  6e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  28.63 
 
 
757 aa  237  6e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  29.29 
 
 
719 aa  236  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1509  TonB-dependent siderophore receptor  32.75 
 
 
882 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826442  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1876  TonB-dependent siderophore receptor  31.8 
 
 
744 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.0292257 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>