More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4039 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  51.09 
 
 		 824 aa  860    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 814 aa  1660    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3331  TonB-dependent siderophore receptor  41.38 
 
 		 766 aa  553  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153274  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  29.3 
 
 		 789 aa  317  6e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  28.94 
 
 		 738 aa  273  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  27.89 
 
 		 791 aa  273  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  28.61 
 
 		 837 aa  270  7e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  27.95 
 
 		 809 aa  268  2.9999999999999995e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  28.73 
 
 		 742 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  28.67 
 
 		 742 aa  263  8e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  29.86 
 
 		 850 aa  259  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  29.09 
 
 		 737 aa  258  3e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  28.65 
 
 		 748 aa  258  3e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  28.65 
 
 		 748 aa  258  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  28.92 
 
 		 740 aa  258  4e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2470  TonB-dependent siderophore receptor  27.29 
 
 		 794 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.555764  normal  0.521946 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  28.1 
 
 		 749 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5755  TonB-dependent siderophore receptor  27.47 
 
 		 793 aa  248  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0391  TonB-dependent siderophore receptor  28.04 
 
 		 712 aa  248  4e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.196206  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  28.69 
 
 		 817 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6718  TonB-dependent siderophore receptor  26.86 
 
 		 805 aa  243  7e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.960052 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  26.67 
 
 		 806 aa  241  5.999999999999999e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  27.88 
 
 		 815 aa  240  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0199  TonB-dependent siderophore receptor  27.48 
 
 		 810 aa  239  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  29.46 
 
 		 859 aa  238  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1527  TonB-dependent siderophore receptor  27.56 
 
 		 714 aa  234  4.0000000000000004e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.698269  normal  0.163231 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2785  TonB-dependent siderophore receptor  25.21 
 
 		 786 aa  234  5e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00424821  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  28.84 
 
 		 722 aa  233  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  24.97 
 
 		 703 aa  233  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5681  TonB-dependent siderophore receptor  26.52 
 
 		 786 aa  233  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0807191 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  24.66 
 
 		 708 aa  233  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3233  TonB-dependent siderophore receptor  26.08 
 
 		 907 aa  233  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000192727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2844  TonB-dependent siderophore receptor  26.63 
 
 		 782 aa  232  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350592  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  28.47 
 
 		 808 aa  231  3e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  25.63 
 
 		 709 aa  231  4e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2284  TonB-dependent siderophore receptor  28.06 
 
 		 767 aa  231  5e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  26.73 
 
 		 812 aa  230  6e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0816  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 816 aa  230  6e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  27.96 
 
 		 864 aa  230  8e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  28.18 
 
 		 860 aa  230  8e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  26.57 
 
 		 795 aa  229  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  25.03 
 
 		 807 aa  229  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  28.42 
 
 		 862 aa  228  4e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  27.41 
 
 		 713 aa  227  8e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  26.38 
 
 		 776 aa  226  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  25.61 
 
 		 711 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  25.28 
 
 		 708 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  26.1 
 
 		 734 aa  226  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1142  TonB-dependent siderophore receptor  26.01 
 
 		 711 aa  221  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.634377  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  28.44 
 
 		 703 aa  221  6e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  27.57 
 
 		 770 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  27.84 
 
 		 757 aa  219  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  27.57 
 
 		 710 aa  219  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  26.31 
 
 		 703 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01148  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.69 
 
 		 708 aa  216  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0846293  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  25.27 
 
 		 701 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  24.01 
 
 		 708 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.09 
 
 		 703 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  27.44 
 
 		 701 aa  214  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0685  TonB-dependent siderophore receptor  25.09 
 
 		 781 aa  214  7e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  26.32 
 
 		 701 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  28.92 
 
 		 706 aa  213  9e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  28.92 
 
 		 706 aa  213  9e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  25.81 
 
 		 726 aa  212  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  25.78 
 
 		 726 aa  212  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  26.21 
 
 		 701 aa  212  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  25.8 
 
 		 710 aa  212  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  26.96 
 
 		 712 aa  210  7e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  26.92 
 
 		 710 aa  210  7e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  25.97 
 
 		 701 aa  208  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1729  TonB-dependent siderophore receptor  25.87 
 
 		 852 aa  208  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411333 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  25.57 
 
 		 743 aa  208  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2496  TonB-dependent siderophore receptor  23.76 
 
 		 785 aa  208  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  26.71 
 
 		 723 aa  208  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  26.08 
 
 		 701 aa  207  7e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  26.29 
 
 		 724 aa  207  7e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  25.53 
 
 		 821 aa  207  8e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  25.57 
 
 		 738 aa  204  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  24.54 
 
 		 696 aa  204  7e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  24.83 
 
 		 710 aa  203  9e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  27.6 
 
 		 707 aa  203  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  24.13 
 
 		 709 aa  203  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  26.51 
 
 		 701 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2461  TonB-dependent siderophore receptor  25.58 
 
 		 713 aa  202  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  26.01 
 
 		 724 aa  201  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  26.52 
 
 		 702 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  26.52 
 
 		 702 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  25.78 
 
 		 714 aa  201  5e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  26.66 
 
 		 757 aa  201  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  24.26 
 
 		 696 aa  200  7e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  27.32 
 
 		 727 aa  200  7e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  26.66 
 
 		 709 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  25.25 
 
 		 736 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  25.39 
 
 		 732 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  26.27 
 
 		 701 aa  198  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  26.27 
 
 		 701 aa  198  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  24.28 
 
 		 711 aa  198  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11443  ferrichrome-iron receptor  26.4 
 
 		 792 aa  197  8.000000000000001e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.601841  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  24.57 
 
 		 719 aa  197  9e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  28.04 
 
 		 735 aa  196  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>