More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0685 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0685  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 781 aa  1590    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5755  TonB-dependent siderophore receptor  48.63 
 
 		 793 aa  718    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  43.88 
 
 		 791 aa  667    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  41.7 
 
 		 807 aa  637    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2470  TonB-dependent siderophore receptor  42.93 
 
 		 794 aa  624  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.555764  normal  0.521946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6718  TonB-dependent siderophore receptor  38.9 
 
 		 805 aa  599  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.960052 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5324  TonB-dependent siderophore receptor  31.42 
 
 		 710 aa  284  5.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0890511 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  29.11 
 
 		 789 aa  258  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  30.8 
 
 		 864 aa  256  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  26.96 
 
 		 812 aa  239  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  28.87 
 
 		 815 aa  238  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  29.36 
 
 		 837 aa  237  8e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  27.16 
 
 		 862 aa  225  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  28.13 
 
 		 859 aa  220  6e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  25.03 
 
 		 814 aa  215  2.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  27.93 
 
 		 708 aa  212  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  28.03 
 
 		 709 aa  211  4e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  27.04 
 
 		 850 aa  210  7e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3233  TonB-dependent siderophore receptor  26.28 
 
 		 907 aa  209  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000192727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  27.7 
 
 		 713 aa  208  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  28.39 
 
 		 703 aa  207  9e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1761  TonB-dependent siderophore receptor  28.38 
 
 		 769 aa  206  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00472024  normal  0.310787 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  28.72 
 
 		 817 aa  205  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  29.22 
 
 		 710 aa  204  4e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  27.15 
 
 		 711 aa  204  7e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  27.31 
 
 		 708 aa  202  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  29.14 
 
 		 860 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2284  TonB-dependent siderophore receptor  26.76 
 
 		 767 aa  201  5e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  26.34 
 
 		 843 aa  201  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  26.41 
 
 		 712 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  27.53 
 
 		 825 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  27.53 
 
 		 825 aa  197  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.83 
 
 		 711 aa  197  9e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  29.33 
 
 		 734 aa  196  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  27.13 
 
 		 703 aa  194  8e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  27.33 
 
 		 692 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.59 
 
 		 703 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  26.27 
 
 		 701 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2785  TonB-dependent siderophore receptor  27.8 
 
 		 786 aa  191  5.999999999999999e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00424821  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  28.31 
 
 		 757 aa  190  8e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  26.43 
 
 		 708 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  28.71 
 
 		 689 aa  190  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  27.62 
 
 		 710 aa  189  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  27.87 
 
 		 689 aa  189  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1367  TonB-dependent siderophore receptor  26.87 
 
 		 745 aa  188  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0632202  normal  0.0485131 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  27.59 
 
 		 696 aa  188  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  27.45 
 
 		 696 aa  187  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  26.1 
 
 		 709 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  28.43 
 
 		 722 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  25.99 
 
 		 809 aa  186  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  29.4 
 
 		 730 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2844  TonB-dependent siderophore receptor  25.41 
 
 		 782 aa  185  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  26.43 
 
 		 776 aa  185  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1729  TonB-dependent siderophore receptor  25.1 
 
 		 852 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411333 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  27.57 
 
 		 701 aa  184  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5138  TonB-dependent siderophore receptor  26.3 
 
 		 789 aa  184  7e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0272944 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1027  TonB-dependent siderophore receptor  27.76 
 
 		 717 aa  182  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.424895 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  27.31 
 
 		 701 aa  182  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  28.59 
 
 		 741 aa  181  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0199  TonB-dependent siderophore receptor  25.98 
 
 		 810 aa  180  8e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  27.23 
 
 		 710 aa  180  8e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  29.03 
 
 		 722 aa  180  8e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  26.47 
 
 		 808 aa  180  9e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  29.43 
 
 		 689 aa  179  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  26.93 
 
 		 829 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0945  TonB-dependent siderophore receptor  27.61 
 
 		 717 aa  179  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  27.81 
 
 		 719 aa  178  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  25.62 
 
 		 806 aa  177  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0917  TonB-dependent siderophore receptor  28.55 
 
 		 696 aa  177  6e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.572242 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  27.55 
 
 		 736 aa  177  9e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5681  TonB-dependent siderophore receptor  24.85 
 
 		 786 aa  175  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0807191 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2496  TonB-dependent siderophore receptor  25.44 
 
 		 785 aa  175  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  25.12 
 
 		 795 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  28.31 
 
 		 738 aa  174  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  29.09 
 
 		 715 aa  174  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3331  TonB-dependent siderophore receptor  24.06 
 
 		 766 aa  174  6.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153274  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0974  TonB-dependent siderophore receptor  29.29 
 
 		 737 aa  173  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.930305 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  27.22 
 
 		 714 aa  173  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  25.9 
 
 		 799 aa  172  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  25.21 
 
 		 797 aa  172  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  28.43 
 
 		 703 aa  171  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0816  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 816 aa  171  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  26.14 
 
 		 723 aa  171  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3121  TonB-dependent siderophore receptor  24.85 
 
 		 809 aa  171  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  25.58 
 
 		 724 aa  169  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  25.69 
 
 		 729 aa  169  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04088  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.06 
 
 		 713 aa  168  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  24.46 
 
 		 795 aa  169  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  25.41 
 
 		 724 aa  167  5e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3731  putative ferrisiderophore receptor  26.18 
 
 		 728 aa  168  5e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  27.58 
 
 		 799 aa  167  9e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  26.53 
 
 		 732 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  27.35 
 
 		 719 aa  166  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  24.47 
 
 		 707 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1049  TonB-dependent siderophore receptor  26.71 
 
 		 788 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  26.93 
 
 		 723 aa  166  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  26.78 
 
 		 733 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06299  hypothetical protein  24.89 
 
 		 715 aa  164  5.0000000000000005e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  26.59 
 
 		 778 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  26.33 
 
 		 831 aa  164  8.000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>