More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1049 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1049  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 788 aa  1600    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6108  TonB-dependent siderophore receptor  33.9 
 
 		 796 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1152  TonB-dependent siderophore receptor  33.77 
 
 		 790 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  27.81 
 
 		 815 aa  219  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3440  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 827 aa  212  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.411786  hitchhiker  0.000375138 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4504  TonB-dependent siderophore receptor  27.83 
 
 		 858 aa  207  8e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198405  normal  0.487097 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  28.4 
 
 		 860 aa  204  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  28.48 
 
 		 801 aa  203  8e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1933  TonB-dependent siderophore receptor  28.54 
 
 		 863 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57776  hitchhiker  0.00557515 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0879  TonB-dependent siderophore receptor  28.02 
 
 		 855 aa  201  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.136442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1361  TonB-dependent siderophore receptor  28.02 
 
 		 855 aa  201  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586931  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4653  TonB-dependent receptor plug  26.9 
 
 		 836 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  30.4 
 
 		 817 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  27.05 
 
 		 825 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  26.91 
 
 		 825 aa  197  9e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  27.42 
 
 		 862 aa  194  5e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  27.42 
 
 		 701 aa  194  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  27.23 
 
 		 799 aa  193  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0878  outer membrane receptor PRHA signal peptide protein  24.61 
 
 		 770 aa  192  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.68825  normal  0.0178454 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  27.9 
 
 		 799 aa  189  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  26.21 
 
 		 864 aa  189  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  27.76 
 
 		 837 aa  187  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1367  TonB-dependent siderophore receptor  27.56 
 
 		 745 aa  184  7e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0632202  normal  0.0485131 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0759  TonB-dependent siderophore receptor  24.81 
 
 		 800 aa  183  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  27.4 
 
 		 850 aa  179  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1028  TonB-dependent siderophore receptor  27.45 
 
 		 718 aa  178  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.289591  normal  0.407367 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  27.13 
 
 		 843 aa  178  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1422  TonB-dependent siderophore receptor  26.41 
 
 		 881 aa  177  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0020  TonB-dependent siderophore receptor  26.41 
 
 		 881 aa  177  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655193  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1162  TonB-dependent siderophore receptor  26.41 
 
 		 881 aa  177  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283901  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0418  TonB-dependent siderophore receptor  26.41 
 
 		 921 aa  177  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0946  TonB-dependent siderophore receptor  27.49 
 
 		 715 aa  177  7e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0139  TonB-dependent siderophore receptor  26.41 
 
 		 921 aa  177  7e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354912  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  27.92 
 
 		 733 aa  177  9e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.61 
 
 		 833 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  25.5 
 
 		 789 aa  176  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1509  TonB-dependent siderophore receptor  26.49 
 
 		 882 aa  174  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826442  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3731  putative ferrisiderophore receptor  26.9 
 
 		 728 aa  173  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2415  TonB-dependent siderophore receptor  25.97 
 
 		 738 aa  173  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0592424  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1732  TonB-dependent siderophore receptor  25.23 
 
 		 864 aa  171  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0884061  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  25.19 
 
 		 806 aa  171  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  26.21 
 
 		 797 aa  170  9e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1945  ferric malleobactin transporter  25.88 
 
 		 753 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342742  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1930  ferric malleobactin transporter  25.88 
 
 		 753 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1027  TonB-dependent siderophore receptor  25.98 
 
 		 717 aa  169  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.424895 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  27.75 
 
 		 708 aa  169  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1178  TonB-dependent siderophore receptor  25.92 
 
 		 741 aa  169  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0776508  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2091  TonB-dependent siderophore receptor  25.88 
 
 		 737 aa  169  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.552144  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1622  TonB-dependent siderophore receptor  25.92 
 
 		 736 aa  169  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0285  TonB-dependent siderophore receptor  25.92 
 
 		 752 aa  169  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0472595  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0876  TonB-dependent siderophore receptor  25.92 
 
 		 736 aa  169  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195373  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  26.16 
 
 		 806 aa  169  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4075  TonB-dependent siderophore receptor  26.04 
 
 		 745 aa  169  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  27.16 
 
 		 713 aa  169  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0945  TonB-dependent siderophore receptor  25.98 
 
 		 717 aa  168  4e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  27.18 
 
 		 711 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  27.01 
 
 		 713 aa  167  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3601  TonB-dependent siderophore receptor  24.55 
 
 		 836 aa  167  9e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.743224  normal  0.189186 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  25.98 
 
 		 833 aa  166  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0685  TonB-dependent siderophore receptor  26.71 
 
 		 781 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  26.13 
 
 		 828 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5755  TonB-dependent siderophore receptor  25.79 
 
 		 793 aa  165  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5895  TonB-dependent siderophore receptor  25.9 
 
 		 827 aa  165  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  25.26 
 
 		 778 aa  164  7e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2399  TonB-dependent siderophore receptor  26.15 
 
 		 729 aa  163  9e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  26.51 
 
 		 828 aa  163  9e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4535  TonB-dependent siderophore receptor  26.05 
 
 		 778 aa  163  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.453333 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  26.5 
 
 		 719 aa  162  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  26.27 
 
 		 809 aa  162  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1381  TonB-dependent siderophore receptor  26.64 
 
 		 742 aa  162  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00176773  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5131  TonB-dependent siderophore receptor  23.74 
 
 		 841 aa  162  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.112839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  26.22 
 
 		 796 aa  162  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  28.26 
 
 		 689 aa  161  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  25.85 
 
 		 812 aa  161  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  26.96 
 
 		 709 aa  161  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  26.41 
 
 		 713 aa  161  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1594  TonB-dependent siderophore receptor  26.38 
 
 		 734 aa  160  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000849595  hitchhiker  0.00416618 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  25.77 
 
 		 817 aa  160  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  26.14 
 
 		 721 aa  160  6e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  28.47 
 
 		 741 aa  160  7e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  27.1 
 
 		 710 aa  160  8e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0607  TonB-dependent siderophore receptor  26.46 
 
 		 706 aa  160  9e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  24.34 
 
 		 821 aa  160  9e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  25.2 
 
 		 802 aa  160  9e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  26 
 
 		 828 aa  160  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3273  TonB-dependent siderophore receptor  24.71 
 
 		 826 aa  159  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480033  normal  0.0611881 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  26.52 
 
 		 709 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  25.22 
 
 		 713 aa  158  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  26.68 
 
 		 708 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  27.25 
 
 		 707 aa  157  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1619  TonB-dependent siderophore receptor  25.46 
 
 		 754 aa  157  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285071 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  24.49 
 
 		 829 aa  157  8e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  27.13 
 
 		 715 aa  157  9e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  26.35 
 
 		 859 aa  156  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1164  TonB-dependent siderophore receptor  25.46 
 
 		 754 aa  156  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0408687  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1644  TonB-dependent siderophore receptor  25.46 
 
 		 754 aa  156  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.107171  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  28.07 
 
 		 694 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  28.93 
 
 		 726 aa  156  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  26.29 
 
 		 689 aa  155  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4597  TonB-dependent siderophore receptor  25.53 
 
 		 725 aa  156  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.832775 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>