More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3203 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  76.26 
 
 		 707 aa  1095    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 694 aa  1424    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  97.69 
 
 		 715 aa  1360    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  56.3 
 
 		 792 aa  747    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  49.08 
 
 		 719 aa  603  1.0000000000000001e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  47.74 
 
 		 710 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  46.64 
 
 		 770 aa  599  1e-170  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  47.16 
 
 		 710 aa  599  1e-170  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  46.77 
 
 		 695 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  46.93 
 
 		 706 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  46.93 
 
 		 706 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  45.38 
 
 		 757 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  45.38 
 
 		 709 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  36.18 
 
 		 727 aa  377  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  35.61 
 
 		 755 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  34.24 
 
 		 689 aa  350  4e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  32.8 
 
 		 700 aa  344  4e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0267  TonB-dependent siderophore receptor  34.11 
 
 		 689 aa  343  9e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3077  TonB-dependent siderophore receptor  32.45 
 
 		 753 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  33.72 
 
 		 698 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  33.11 
 
 		 742 aa  330  4e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  33.11 
 
 		 742 aa  330  4e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  31.47 
 
 		 732 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  30.42 
 
 		 732 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  30.1 
 
 		 745 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2053  TonB-dependent siderophore receptor  34.27 
 
 		 719 aa  312  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4395  TonB-dependent siderophore receptor  34.61 
 
 		 756 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1961  TonB-dependent siderophore receptor  34.58 
 
 		 705 aa  302  1e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.353089 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2282  TonB-dependent siderophore receptor  34.4 
 
 		 724 aa  303  1e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2005  TonB-dependent siderophore receptor  34.05 
 
 		 724 aa  301  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.22147  normal  0.931942 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4026  TonB-dependent siderophore receptor  34.4 
 
 		 755 aa  301  3e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.865466  normal  0.196913 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2876  TonB-dependent siderophore receptor  31.02 
 
 		 751 aa  299  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1629  TonB-dependent siderophore receptor  33.19 
 
 		 712 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385709 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3638  TonB-dependent siderophore receptor  32.59 
 
 		 821 aa  295  2e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2091  TonB-dependent siderophore receptor  32.94 
 
 		 735 aa  294  3e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761777  normal  0.724468 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  29.79 
 
 		 734 aa  292  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3280  TonB-dependent siderophore receptor  33.72 
 
 		 707 aa  291  3e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0713327  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4786  TonB-dependent siderophore receptor  31.98 
 
 		 712 aa  289  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.789588  normal  0.608467 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  33.49 
 
 		 680 aa  289  1e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1175  TonB-dependent siderophore receptor  32.63 
 
 		 749 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 		 766 aa  287  4e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  29.74 
 
 		 736 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3292  TonB-dependent siderophore receptor  31.95 
 
 		 771 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  30.16 
 
 		 703 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  30.55 
 
 		 708 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  30.09 
 
 		 734 aa  283  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1655  TonB-dependent siderophore receptor  33.04 
 
 		 656 aa  281  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  32.73 
 
 		 731 aa  280  9e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  30.29 
 
 		 753 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3297  TonB-dependent siderophore receptor  32.3 
 
 		 733 aa  275  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  30.52 
 
 		 709 aa  274  3e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  31.36 
 
 		 734 aa  273  6e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1569  TonB-dependent receptor  31.2 
 
 		 767 aa  272  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.428413 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  29.67 
 
 		 843 aa  272  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  32.67 
 
 		 817 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  31.93 
 
 		 743 aa  271  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47140  putative TonB-dependent receptor  32.37 
 
 		 732 aa  270  8e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1055  TonB-dependent siderophore receptor  29.35 
 
 		 720 aa  270  8.999999999999999e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4068  putative TonB-dependent receptor  33.08 
 
 		 733 aa  269  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  29.04 
 
 		 850 aa  269  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4617  TonB-dependent siderophore receptor  30.46 
 
 		 741 aa  268  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  32.22 
 
 		 726 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  31.32 
 
 		 736 aa  266  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  32.08 
 
 		 726 aa  266  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001067  ferric siderophore receptor PsuA  30.92 
 
 		 678 aa  265  2e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  30.34 
 
 		 696 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2558  TonB-dependent siderophore receptor  29.96 
 
 		 760 aa  264  3e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.897783  normal  0.0361628 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  31.47 
 
 		 732 aa  264  4e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3047  TonB-dependent siderophore receptor  29.18 
 
 		 737 aa  264  4.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773185  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  29.88 
 
 		 696 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  28.59 
 
 		 864 aa  261  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4659  TonB-dependent siderophore receptor  29.91 
 
 		 747 aa  261  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1987  TonB-dependent siderophore receptor  28.27 
 
 		 769 aa  261  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  30.54 
 
 		 714 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3085  TonB-dependent siderophore receptor  28.88 
 
 		 767 aa  260  5.0000000000000005e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.432475  normal  0.216415 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  29.76 
 
 		 701 aa  258  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  29.39 
 
 		 860 aa  258  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  29.91 
 
 		 825 aa  257  5e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12430  TonB-dependent siderophore receptor  29.39 
 
 		 753 aa  257  5e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396509  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  29.28 
 
 		 862 aa  256  9e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2318  TonB-dependent siderophore receptor  28.59 
 
 		 724 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000356836  hitchhiker  0.000261806 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2944  TonB-dependent siderophore receptor  33.02 
 
 		 733 aa  254  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  29.97 
 
 		 825 aa  253  7e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  31.14 
 
 		 738 aa  251  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  28.34 
 
 		 815 aa  251  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4597  TonB-dependent siderophore receptor  31.95 
 
 		 725 aa  250  5e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.832775 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  28.86 
 
 		 779 aa  248  4e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  29.55 
 
 		 692 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  28.13 
 
 		 812 aa  247  6e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  30.56 
 
 		 810 aa  246  8e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  31.99 
 
 		 726 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  31.37 
 
 		 701 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  31.53 
 
 		 701 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0108  TonB-dependent siderophore receptor  29.71 
 
 		 759 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  30.71 
 
 		 710 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5130  TonB-dependent siderophore receptor  32.52 
 
 		 725 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  31.6 
 
 		 701 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  31.22 
 
 		 701 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1281  TonB-dependent siderophore receptor  30.93 
 
 		 699 aa  244  3e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0723  TonB-dependent siderophore receptor  28.98 
 
 		 740 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0469238  normal  0.27958 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>