More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5895 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4917  TonB-dependent siderophore receptor  51.03 
 
 		 778 aa  741    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.705684  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  53.29 
 
 		 796 aa  833    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1162  TonB-dependent siderophore receptor  60.78 
 
 		 881 aa  956    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283901  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0139  TonB-dependent siderophore receptor  60.78 
 
 		 921 aa  958    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354912  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  55.87 
 
 		 795 aa  850    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1180  TonB-dependent siderophore receptor  65.1 
 
 		 679 aa  924    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14569  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5895  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 827 aa  1668    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1509  TonB-dependent siderophore receptor  60.65 
 
 		 882 aa  950    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826442  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0020  TonB-dependent siderophore receptor  60.9 
 
 		 881 aa  959    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655193  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  52.82 
 
 		 809 aa  858    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4504  TonB-dependent siderophore receptor  60.81 
 
 		 858 aa  977    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198405  normal  0.487097 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  50.48 
 
 		 810 aa  796    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1381  TonB-dependent siderophore receptor  62.07 
 
 		 742 aa  932    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00176773  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4239  TonB-dependent siderophore receptor  54.92 
 
 		 781 aa  758    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.475083 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3999  putative TonB-dependent siderophore receptor  58.27 
 
 		 821 aa  914    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0797719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0879  TonB-dependent siderophore receptor  60.73 
 
 		 855 aa  969    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.136442  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6052  putative TonB-dependent siderophore receptor  55.8 
 
 		 766 aa  762    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  53.17 
 
 		 796 aa  837    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1422  TonB-dependent siderophore receptor  60.9 
 
 		 881 aa  959    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  55.97 
 
 		 795 aa  843    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1361  TonB-dependent siderophore receptor  60.73 
 
 		 855 aa  969    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586931  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0418  TonB-dependent siderophore receptor  60.78 
 
 		 921 aa  958    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1933  TonB-dependent siderophore receptor  61.22 
 
 		 863 aa  994    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57776  hitchhiker  0.00557515 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  53.55 
 
 		 796 aa  841    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  54.16 
 
 		 796 aa  836    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  45.11 
 
 		 721 aa  628  1e-178  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  45.8 
 
 		 714 aa  620  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  45.8 
 
 		 714 aa  620  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  45.8 
 
 		 677 aa  619  1e-176  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  44.46 
 
 		 707 aa  618  1e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  46.93 
 
 		 708 aa  618  1e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  47.33 
 
 		 719 aa  616  1e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  42.98 
 
 		 724 aa  572  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  42.94 
 
 		 713 aa  553  1e-156  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  43.53 
 
 		 713 aa  551  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  43.57 
 
 		 713 aa  543  1e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0006  TonB-dependent siderophore receptor  41.99 
 
 		 709 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  43.13 
 
 		 726 aa  511  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  40.63 
 
 		 705 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  40.36 
 
 		 706 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4597  TonB-dependent siderophore receptor  40.48 
 
 		 725 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.832775 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0414  TonB-dependent siderophore receptor  39.4 
 
 		 731 aa  477  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0673732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5130  TonB-dependent siderophore receptor  40.62 
 
 		 725 aa  469  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5026  TonB-dependent siderophore receptor  40.2 
 
 		 722 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3121  TonB-dependent siderophore receptor  40.06 
 
 		 722 aa  465  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5246  TonB-dependent siderophore receptor  40.06 
 
 		 722 aa  465  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01120  TonB-dependent siderophore receptor  38.11 
 
 		 793 aa  456  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2239  TonB-dependent receptor plug  42.96 
 
 		 582 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.500104 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0607  TonB-dependent siderophore receptor  36.59 
 
 		 706 aa  392  1e-107  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  35.75 
 
 		 710 aa  296  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  33.38 
 
 		 701 aa  281  5e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  34.65 
 
 		 689 aa  280  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  33.1 
 
 		 757 aa  276  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  32.7 
 
 		 722 aa  268  4e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  31.63 
 
 		 708 aa  262  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  31.71 
 
 		 712 aa  261  5.0000000000000005e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  32.38 
 
 		 692 aa  261  6e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  32.39 
 
 		 709 aa  259  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  32.85 
 
 		 708 aa  258  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  30.98 
 
 		 703 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1443  TonB-dependent siderophore receptor  29.7 
 
 		 743 aa  254  5.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281605  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  32.36 
 
 		 722 aa  254  6e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  31.87 
 
 		 734 aa  250  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  32.1 
 
 		 703 aa  249  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  30.33 
 
 		 703 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  31.39 
 
 		 714 aa  240  6.999999999999999e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  30.95 
 
 		 701 aa  240  8e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  31.39 
 
 		 732 aa  239  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  30.95 
 
 		 736 aa  238  4e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  30.8 
 
 		 708 aa  238  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.74 
 
 		 711 aa  237  7e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  30.96 
 
 		 701 aa  237  9e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  30.32 
 
 		 711 aa  236  9e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  28.38 
 
 		 828 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  29.49 
 
 		 703 aa  235  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  30.94 
 
 		 709 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  30.41 
 
 		 701 aa  234  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 794 aa  234  5e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 820 aa  234  6e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  30.97 
 
 		 815 aa  233  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  30.38 
 
 		 701 aa  233  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  30.52 
 
 		 701 aa  232  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  28.25 
 
 		 806 aa  232  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  30.52 
 
 		 701 aa  232  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  30.6 
 
 		 860 aa  230  6e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  29.93 
 
 		 696 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  29.93 
 
 		 696 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  31.69 
 
 		 741 aa  228  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  30.35 
 
 		 738 aa  228  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  27.96 
 
 		 817 aa  227  6e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  28.26 
 
 		 797 aa  227  6e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  31.33 
 
 		 710 aa  227  6e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0688  TonB-dependent receptor protein  30.45 
 
 		 716 aa  227  9e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.07 
 
 		 833 aa  226  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  31.15 
 
 		 743 aa  224  6e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  30.26 
 
 		 710 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04088  TonB-dependent outer membrane Receptor  31.41 
 
 		 713 aa  223  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  32.29 
 
 		 715 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2064  TonB-dependent siderophore receptor  29.39 
 
 		 723 aa  220  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228617  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  29.32 
 
 		 701 aa  220  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>