More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6052 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_1933  TonB-dependent siderophore receptor  55.84 
 
 		 863 aa  773    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57776  hitchhiker  0.00557515 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  53.47 
 
 		 796 aa  763    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1422  TonB-dependent siderophore receptor  56.12 
 
 		 881 aa  768    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5895  TonB-dependent siderophore receptor  55.8 
 
 		 827 aa  755    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358544  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  56.65 
 
 		 796 aa  761    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1180  TonB-dependent siderophore receptor  56.12 
 
 		 679 aa  764    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14569  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6052  putative TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 766 aa  1556    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4917  TonB-dependent siderophore receptor  69.67 
 
 		 778 aa  1051    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.705684  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0020  TonB-dependent siderophore receptor  56.12 
 
 		 881 aa  768    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655193  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  52.57 
 
 		 795 aa  738    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  53.59 
 
 		 809 aa  750    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4504  TonB-dependent siderophore receptor  56.57 
 
 		 858 aa  766    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198405  normal  0.487097 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0418  TonB-dependent siderophore receptor  56.12 
 
 		 921 aa  767    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1381  TonB-dependent siderophore receptor  57.16 
 
 		 742 aa  779    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00176773  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4239  TonB-dependent siderophore receptor  71.91 
 
 		 781 aa  1086    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.475083 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  52.02 
 
 		 810 aa  674    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3999  putative TonB-dependent siderophore receptor  57.7 
 
 		 821 aa  747    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0797719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0879  TonB-dependent siderophore receptor  56.27 
 
 		 855 aa  756    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.136442  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  56.05 
 
 		 796 aa  754    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  52.22 
 
 		 795 aa  730    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1509  TonB-dependent siderophore receptor  56.27 
 
 		 882 aa  769    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1361  TonB-dependent siderophore receptor  56.27 
 
 		 855 aa  756    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586931  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1162  TonB-dependent siderophore receptor  56.12 
 
 		 881 aa  767    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283901  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  56.5 
 
 		 796 aa  764    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0139  TonB-dependent siderophore receptor  56.12 
 
 		 921 aa  767    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354912  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  47.92 
 
 		 707 aa  614  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  46.76 
 
 		 721 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  48.66 
 
 		 708 aa  593  1e-168  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  48.63 
 
 		 719 aa  580  1e-164  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  44.63 
 
 		 714 aa  575  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  44.78 
 
 		 714 aa  577  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  44.78 
 
 		 677 aa  577  1.0000000000000001e-163  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  46.13 
 
 		 724 aa  573  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  45.53 
 
 		 713 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  45.39 
 
 		 713 aa  562  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0006  TonB-dependent siderophore receptor  45.44 
 
 		 709 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  43.84 
 
 		 713 aa  532  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  40.72 
 
 		 706 aa  500  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  41.91 
 
 		 705 aa  498  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  42.77 
 
 		 726 aa  496  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4597  TonB-dependent siderophore receptor  41.19 
 
 		 725 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.832775 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0414  TonB-dependent siderophore receptor  41.4 
 
 		 731 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0673732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5026  TonB-dependent siderophore receptor  41.24 
 
 		 722 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3121  TonB-dependent siderophore receptor  41.24 
 
 		 722 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5246  TonB-dependent siderophore receptor  41.24 
 
 		 722 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5130  TonB-dependent siderophore receptor  41.74 
 
 		 725 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0607  TonB-dependent siderophore receptor  36.69 
 
 		 706 aa  395  1e-108  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2239  TonB-dependent receptor plug  41.86 
 
 		 582 aa  384  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.500104 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01120  TonB-dependent siderophore receptor  35.64 
 
 		 793 aa  375  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  34.41 
 
 		 708 aa  287  7e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  32.79 
 
 		 696 aa  283  9e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  32.5 
 
 		 696 aa  280  7e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  32.59 
 
 		 710 aa  273  7e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  33.72 
 
 		 710 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  32.55 
 
 		 692 aa  267  5.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  32.33 
 
 		 711 aa  266  8e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  33.38 
 
 		 708 aa  266  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  33.33 
 
 		 709 aa  266  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  34.28 
 
 		 689 aa  263  8e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  33.28 
 
 		 711 aa  263  8e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  31.58 
 
 		 701 aa  260  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  31.23 
 
 		 703 aa  258  4e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.5 
 
 		 703 aa  252  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  30.95 
 
 		 701 aa  252  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  30.19 
 
 		 708 aa  252  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  31.27 
 
 		 714 aa  250  9e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  31.56 
 
 		 732 aa  249  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  30.35 
 
 		 709 aa  249  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  31.82 
 
 		 712 aa  247  6.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  29.26 
 
 		 703 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  30.43 
 
 		 825 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  31.71 
 
 		 815 aa  244  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  31.24 
 
 		 734 aa  244  6e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  31.82 
 
 		 710 aa  242  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  30.29 
 
 		 825 aa  242  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  30.67 
 
 		 860 aa  238  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  30.84 
 
 		 738 aa  237  6e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  30.4 
 
 		 736 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  32.22 
 
 		 741 aa  234  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  29.77 
 
 		 722 aa  232  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  33.9 
 
 		 817 aa  231  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  32.28 
 
 		 715 aa  230  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  29.24 
 
 		 720 aa  229  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  30.43 
 
 		 757 aa  229  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  30.3 
 
 		 701 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1443  TonB-dependent siderophore receptor  28.73 
 
 		 743 aa  226  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281605  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  30.25 
 
 		 726 aa  226  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  30.39 
 
 		 726 aa  224  4e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  29.79 
 
 		 743 aa  224  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  29.87 
 
 		 701 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  29.87 
 
 		 701 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3611  homoserine O-acetyltransferase  29.6 
 
 		 699 aa  221  3e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000219924  decreased coverage  0.00028675 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  29.43 
 
 		 724 aa  220  6e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  29.65 
 
 		 702 aa  220  7.999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  29.65 
 
 		 702 aa  220  7.999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 689 aa  219  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  29.99 
 
 		 689 aa  219  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  29.38 
 
 		 859 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  29.94 
 
 		 724 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  30.15 
 
 		 723 aa  217  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>