More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_01120 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_01120  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
793 aa  1613    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  43.18 
 
 
705 aa  510  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  43.02 
 
 
706 aa  501  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  39.9 
 
 
795 aa  475  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  40.64 
 
 
677 aa  463  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  40.5 
 
 
714 aa  463  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  40.19 
 
 
795 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  40.64 
 
 
714 aa  464  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  38.08 
 
 
796 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  37.45 
 
 
796 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  38.67 
 
 
810 aa  461  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  37.95 
 
 
796 aa  458  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0418  TonB-dependent siderophore receptor  38.05 
 
 
921 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  40.42 
 
 
707 aa  456  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0139  TonB-dependent siderophore receptor  38.05 
 
 
921 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354912  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1162  TonB-dependent siderophore receptor  38.05 
 
 
881 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283901  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  37.88 
 
 
796 aa  452  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0020  TonB-dependent siderophore receptor  37.93 
 
 
881 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655193  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1422  TonB-dependent siderophore receptor  37.93 
 
 
881 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  35.8 
 
 
809 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5895  TonB-dependent siderophore receptor  37.2 
 
 
827 aa  445  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358544  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1509  TonB-dependent siderophore receptor  37.67 
 
 
882 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826442  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1933  TonB-dependent siderophore receptor  37.25 
 
 
863 aa  438  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57776  hitchhiker  0.00557515 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  38.54 
 
 
721 aa  437  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4504  TonB-dependent siderophore receptor  37.8 
 
 
858 aa  436  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198405  normal  0.487097 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0006  TonB-dependent siderophore receptor  38.89 
 
 
709 aa  429  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0879  TonB-dependent siderophore receptor  37.61 
 
 
855 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.136442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1361  TonB-dependent siderophore receptor  37.61 
 
 
855 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586931  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  40.46 
 
 
719 aa  428  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  37.27 
 
 
726 aa  422  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  36.59 
 
 
724 aa  416  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1180  TonB-dependent siderophore receptor  38.4 
 
 
679 aa  411  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14569  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  38.62 
 
 
708 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3999  putative TonB-dependent siderophore receptor  35.09 
 
 
821 aa  404  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0797719  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4917  TonB-dependent siderophore receptor  38.37 
 
 
778 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.705684  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  35.96 
 
 
713 aa  393  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  35.38 
 
 
713 aa  394  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1381  TonB-dependent siderophore receptor  37.91 
 
 
742 aa  396  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00176773  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4239  TonB-dependent siderophore receptor  38.02 
 
 
781 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.475083 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  35.96 
 
 
713 aa  394  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5130  TonB-dependent siderophore receptor  37.52 
 
 
725 aa  392  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944622  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5026  TonB-dependent siderophore receptor  36.73 
 
 
722 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4597  TonB-dependent siderophore receptor  37.66 
 
 
725 aa  388  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.832775 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3121  TonB-dependent siderophore receptor  36.64 
 
 
722 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5246  TonB-dependent siderophore receptor  36.64 
 
 
722 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0414  TonB-dependent siderophore receptor  36.52 
 
 
731 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0673732  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6052  putative TonB-dependent siderophore receptor  35.72 
 
 
766 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2239  TonB-dependent receptor plug  37.84 
 
 
582 aa  345  1e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.500104 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0607  TonB-dependent siderophore receptor  32.1 
 
 
706 aa  307  5.0000000000000004e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  30.35 
 
 
797 aa  270  8e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  30.64 
 
 
778 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  29.59 
 
 
828 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  31.59 
 
 
712 aa  257  6e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  28.83 
 
 
828 aa  254  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  28.98 
 
 
828 aa  253  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  29.8 
 
 
797 aa  252  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 
794 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 
820 aa  245  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  28.64 
 
 
806 aa  244  6e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  30.9 
 
 
710 aa  238  5.0000000000000005e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  29.47 
 
 
708 aa  235  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  29.23 
 
 
703 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  30.71 
 
 
799 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  29.79 
 
 
701 aa  230  8e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  29.41 
 
 
722 aa  224  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  28.2 
 
 
828 aa  224  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.17 
 
 
833 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  30.37 
 
 
692 aa  221  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  28.25 
 
 
806 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  28.88 
 
 
757 aa  221  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  29.81 
 
 
701 aa  218  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  28.13 
 
 
779 aa  218  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  29.99 
 
 
710 aa  216  9e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  30.46 
 
 
815 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  28.84 
 
 
696 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  28.39 
 
 
792 aa  216  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  26.77 
 
 
799 aa  216  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  29.04 
 
 
709 aa  215  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1443  TonB-dependent siderophore receptor  27.78 
 
 
743 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281605  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  28.84 
 
 
696 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  29.15 
 
 
711 aa  214  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  28.44 
 
 
708 aa  214  5.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  29.2 
 
 
722 aa  214  7e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  29.51 
 
 
710 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  28.77 
 
 
770 aa  213  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  28.11 
 
 
810 aa  213  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  28.75 
 
 
710 aa  213  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  29.38 
 
 
701 aa  212  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  29.2 
 
 
701 aa  212  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  27.39 
 
 
810 aa  211  5e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  27.39 
 
 
810 aa  210  7e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  28 
 
 
829 aa  210  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  29.88 
 
 
860 aa  210  9e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  27.41 
 
 
810 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3328  TonB-dependent siderophore receptor  27.01 
 
 
822 aa  209  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.513174  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  26.83 
 
 
816 aa  207  6e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  27.61 
 
 
821 aa  206  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  27.99 
 
 
831 aa  206  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  27.6 
 
 
802 aa  206  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 
715 aa  204  5e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>