More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3328 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3328  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 822 aa  1687    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.513174  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0604  TonB-dependent siderophore receptor  62.53 
 
 		 831 aa  993    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0400  ferripyoverdine receptor  40.97 
 
 		 744 aa  520  1e-146  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.736403  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09970  type I ferripyoverdine receptor, FpvB  39.05 
 
 		 802 aa  512  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  36.14 
 
 		 812 aa  489  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4481  TonB-dependent siderophore receptor  37.15 
 
 		 824 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207643  normal  0.919252 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0874  TonB-dependent siderophore receptor  36.6 
 
 		 840 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  37.39 
 
 		 816 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0669  outer membrane ferric siderophore receptor  36.08 
 
 		 810 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.907614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3273  TonB-dependent siderophore receptor  35.77 
 
 		 826 aa  464  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480033  normal  0.0611881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1585  TonB-dependent siderophore receptor  35.47 
 
 		 828 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927871  normal  0.219293 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0845  TonB-dependent siderophore receptor  38.31 
 
 		 703 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0329429  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40910  ferripyoverdine receptor  34.86 
 
 		 808 aa  449  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00205881  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3666  TonB-dependent siderophore receptor  35.2 
 
 		 828 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.476594 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3478  TonB-dependent siderophore receptor  34.65 
 
 		 825 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2121  TonB-dependent siderophore receptor  37.66 
 
 		 722 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0440064  normal  0.552205 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0879  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  37.88 
 
 		 713 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.871457  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3601  TonB-dependent siderophore receptor  35.32 
 
 		 836 aa  438  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.743224  normal  0.189186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0860  TonB-dependent siderophore receptor  35.18 
 
 		 841 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  34.68 
 
 		 812 aa  435  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1879  TonB-dependent siderophore receptor  34.56 
 
 		 841 aa  432  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.432996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0846  TonB-dependent siderophore receptor  35.18 
 
 		 841 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09340  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  37.28 
 
 		 720 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5131  TonB-dependent siderophore receptor  34.07 
 
 		 841 aa  431  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.112839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  35.48 
 
 		 814 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  35.48 
 
 		 802 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2065  TonB-dependent siderophore receptor  34.7 
 
 		 809 aa  425  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4072  TonB-dependent siderophore receptor  34.8 
 
 		 817 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  35.21 
 
 		 821 aa  420  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  35.73 
 
 		 799 aa  421  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  34.31 
 
 		 844 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1449  TonB-dependent siderophore receptor  33.17 
 
 		 822 aa  416  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3374  TonB-dependent siderophore receptor  36.42 
 
 		 738 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0588335  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4993  TonB-dependent siderophore receptor  36.42 
 
 		 738 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0250813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5294  TonB-dependent siderophore receptor  36.42 
 
 		 727 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117694 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44970  TonB-dependent siderophore receptor  34.16 
 
 		 798 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259905  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1848  TonB-dependent siderophore receptor  34 
 
 		 826 aa  409  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.817483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0677  TonB-dependent siderophore receptor  35.43 
 
 		 745 aa  411  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1823  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  36.52 
 
 		 747 aa  410  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  33.13 
 
 		 795 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1678  TonB-dependent siderophore receptor  33.96 
 
 		 830 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.463262  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3692  TonB-dependent siderophore receptor  36.84 
 
 		 722 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2155  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  35.98 
 
 		 752 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2462  TonB-dependent siderophore receptor  36.34 
 
 		 724 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0793  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  35.83 
 
 		 719 aa  405  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.454561  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0883  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  35.83 
 
 		 719 aa  405  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17690  TonB-dependent siderophore receptor  32.34 
 
 		 806 aa  401  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1732  TonB-dependent siderophore receptor  32.87 
 
 		 864 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0884061  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1784  TonB-dependent siderophore receptor  35.42 
 
 		 717 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.306565  normal  0.0192687 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2151  TonB-dependent siderophore receptor, putative  32.15 
 
 		 825 aa  395  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0848793  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  32.66 
 
 		 807 aa  395  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  33.81 
 
 		 815 aa  395  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02230  outer membrane ferripyoverdine receptor  33.33 
 
 		 789 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1961  TonB-dependent siderophore receptor  34.68 
 
 		 803 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.281016  normal  0.90568 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0759  TonB-dependent siderophore receptor  34.09 
 
 		 800 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  33.96 
 
 		 803 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4082  TonB-dependent siderophore receptor  33.63 
 
 		 819 aa  389  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671478  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2152  TonB-dependent siderophore receptor, putative  33.71 
 
 		 743 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101667  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1962  TonB-dependent siderophore receptor  34.19 
 
 		 746 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1440  TonB-dependent siderophore receptor  33.79 
 
 		 827 aa  381  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1171  TonB-dependent siderophore receptor  34.13 
 
 		 803 aa  378  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.963652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  33.7 
 
 		 787 aa  374  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0450384 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3276  TonB-dependent siderophore receptor  33.42 
 
 		 840 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130164 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0692  TonB-dependent siderophore receptor  33.41 
 
 		 801 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  33.93 
 
 		 833 aa  357  3.9999999999999996e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1501  TonB-dependent siderophore receptor  35.61 
 
 		 732 aa  355  2e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.125781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0288  TonB-dependent siderophore receptor  34.56 
 
 		 765 aa  347  7e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.566614  normal  0.515749 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2440  FhuE receptor  32.62 
 
 		 753 aa  345  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2583  TonB-dependent siderophore receptor  33.2 
 
 		 748 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1482  TonB-dependent siderophore receptor  33.14 
 
 		 723 aa  343  5e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0272  TonB-dependent siderophore receptor  34.56 
 
 		 765 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199499 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2539  TonB-dependent siderophore receptor  32.67 
 
 		 753 aa  343  5.999999999999999e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0298  TonB-dependent siderophore receptor  34.29 
 
 		 765 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0988  TonB-dependent siderophore receptor  33.57 
 
 		 731 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00021194  normal  0.772446 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0952  TonB-dependent siderophore receptor  32.82 
 
 		 729 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000770151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0950  TonB-dependent siderophore receptor  33.05 
 
 		 723 aa  337  7e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000152119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3496  TonB-dependent siderophore receptor  33.93 
 
 		 723 aa  328  2.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4418  ferripyoverdine receptor  32.8 
 
 		 766 aa  323  6e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2124  TonB-dependent siderophore receptor  31.53 
 
 		 722 aa  321  3e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000170131  normal  0.221939 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3531  TonB-dependent siderophore receptor  31.93 
 
 		 740 aa  320  6e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313722  decreased coverage  0.00643483 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3182  TonB-dependent receptor family protein  31.35 
 
 		 699 aa  320  6e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.223092 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3863  TonB-dependent siderophore receptor  31.2 
 
 		 733 aa  318  3e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000567085  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1326  TonB-dependent siderophore receptor  30.94 
 
 		 741 aa  317  4e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.624497  normal  0.0240469 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2136  TonB-dependent siderophore receptor  31.91 
 
 		 722 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.503645  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2339  TonB-dependent siderophore receptor  31.63 
 
 		 722 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000312883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1303  TonB-dependent siderophore receptor  33.19 
 
 		 724 aa  312  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1653  TonB-dependent siderophore receptor  31.3 
 
 		 741 aa  310  5e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0605702  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2733  TonB-dependent siderophore receptor  30.87 
 
 		 747 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000321343  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0569  TonB-dependent siderophore receptor  30.54 
 
 		 724 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.931435 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1055  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  32.02 
 
 		 747 aa  309  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0580  TonB-dependent siderophore receptor  30.29 
 
 		 725 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2711  TonB-dependent siderophore receptor  31.01 
 
 		 741 aa  306  9.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0586  TonB-dependent siderophore receptor  30.43 
 
 		 724 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0137  TonB-dependent iron-siderophore receptor precursor  30.52 
 
 		 721 aa  304  4.0000000000000003e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0114  TonB-dependent siderophore receptor  31.03 
 
 		 728 aa  304  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4640  TonB-dependent siderophore receptor  32.47 
 
 		 719 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0269226  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2812  TonB-dependent siderophore receptor  30.53 
 
 		 747 aa  303  8.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215946  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4286  TonB-dependent siderophore receptor  30.18 
 
 		 728 aa  302  2e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0535  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 		 725 aa  301  3e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0106  TonB-dependent siderophore receptor  29.43 
 
 		 728 aa  301  3e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>