More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1303 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1303  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
724 aa  1477    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4640  TonB-dependent siderophore receptor  39.12 
 
 
719 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0269226  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  36.25 
 
 
787 aa  387  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0450384 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0874  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 
840 aa  333  6e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.708566 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09970  type I ferripyoverdine receptor, FpvB  32.12 
 
 
802 aa  331  3e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3374  TonB-dependent siderophore receptor  35.25 
 
 
738 aa  328  3e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0588335  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5294  TonB-dependent siderophore receptor  35.25 
 
 
727 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.117694 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4993  TonB-dependent siderophore receptor  35.25 
 
 
738 aa  328  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0250813  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0677  TonB-dependent siderophore receptor  33.11 
 
 
745 aa  326  8.000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029692  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1585  TonB-dependent siderophore receptor  33.66 
 
 
828 aa  326  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927871  normal  0.219293 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3666  TonB-dependent siderophore receptor  33.76 
 
 
828 aa  324  4e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.476594 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0845  TonB-dependent siderophore receptor  34.12 
 
 
703 aa  323  6e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0329429  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0879  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  34.68 
 
 
713 aa  319  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.871457  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2155  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  33.43 
 
 
752 aa  317  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1823  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  33.71 
 
 
747 aa  317  7e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3478  TonB-dependent siderophore receptor  34.28 
 
 
825 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0883  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  33.47 
 
 
719 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0793  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  33.61 
 
 
719 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.454561  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2121  TonB-dependent siderophore receptor  33.92 
 
 
722 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0440064  normal  0.552205 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0586  TonB-dependent siderophore receptor  30.64 
 
 
724 aa  312  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09340  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  34.45 
 
 
720 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0569  TonB-dependent siderophore receptor  30.42 
 
 
724 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.931435 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4481  TonB-dependent siderophore receptor  33.1 
 
 
824 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207643  normal  0.919252 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5131  TonB-dependent siderophore receptor  32.12 
 
 
841 aa  308  3e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.112839  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0535  TonB-dependent siderophore receptor  30.59 
 
 
725 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3328  TonB-dependent siderophore receptor  32.87 
 
 
822 aa  307  5.0000000000000004e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.513174  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0604  TonB-dependent siderophore receptor  31.93 
 
 
831 aa  306  8.000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0580  TonB-dependent siderophore receptor  30.15 
 
 
725 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0669  outer membrane ferric siderophore receptor  30.71 
 
 
810 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.907614  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  32.97 
 
 
821 aa  303  9e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3273  TonB-dependent siderophore receptor  32.54 
 
 
826 aa  296  7e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480033  normal  0.0611881 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2539  TonB-dependent siderophore receptor  32.24 
 
 
719 aa  296  1e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  30.26 
 
 
812 aa  294  4e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1879  TonB-dependent siderophore receptor  32.04 
 
 
841 aa  294  5e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.432996  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0860  TonB-dependent siderophore receptor  31.47 
 
 
841 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  30.3 
 
 
844 aa  290  9e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1678  TonB-dependent siderophore receptor  32.14 
 
 
830 aa  286  7e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.463262  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3692  TonB-dependent siderophore receptor  31.9 
 
 
722 aa  286  9e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0759  TonB-dependent siderophore receptor  32.43 
 
 
800 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0846  TonB-dependent siderophore receptor  31.1 
 
 
841 aa  282  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2462  TonB-dependent siderophore receptor  31.06 
 
 
724 aa  281  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  30.16 
 
 
802 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0288  TonB-dependent siderophore receptor  31.23 
 
 
765 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.566614  normal  0.515749 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0272  TonB-dependent siderophore receptor  31.23 
 
 
765 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199499 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1848  TonB-dependent siderophore receptor  30.85 
 
 
826 aa  278  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.817483  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0298  TonB-dependent siderophore receptor  31.73 
 
 
765 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496708  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1784  TonB-dependent siderophore receptor  32.2 
 
 
717 aa  276  8e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.306565  normal  0.0192687 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1962  TonB-dependent siderophore receptor  30.11 
 
 
746 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3601  TonB-dependent siderophore receptor  29.95 
 
 
836 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.743224  normal  0.189186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4082  TonB-dependent siderophore receptor  30.19 
 
 
819 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671478  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2152  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.91 
 
 
743 aa  270  7e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101667  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1961  TonB-dependent siderophore receptor  31.37 
 
 
803 aa  270  8.999999999999999e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.281016  normal  0.90568 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1449  TonB-dependent siderophore receptor  30.65 
 
 
822 aa  269  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2151  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.16 
 
 
825 aa  267  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0848793  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2065  TonB-dependent siderophore receptor  31.78 
 
 
809 aa  266  7e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  29.97 
 
 
814 aa  264  4e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2440  FhuE receptor  28.96 
 
 
753 aa  263  6e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3496  TonB-dependent siderophore receptor  30.98 
 
 
723 aa  263  8.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2539  TonB-dependent siderophore receptor  28.98 
 
 
753 aa  263  8.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1482  TonB-dependent siderophore receptor  30.52 
 
 
723 aa  261  3e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1171  TonB-dependent siderophore receptor  30.43 
 
 
803 aa  258  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.963652  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1732  TonB-dependent siderophore receptor  28.92 
 
 
864 aa  255  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0884061  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1440  TonB-dependent siderophore receptor  30.71 
 
 
827 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40910  ferripyoverdine receptor  27.32 
 
 
808 aa  255  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00205881  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  29.17 
 
 
816 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02230  outer membrane ferripyoverdine receptor  28.91 
 
 
789 aa  251  4e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3410  TonB-dependent siderophore receptor  29.89 
 
 
714 aa  250  5e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17690  TonB-dependent siderophore receptor  28.24 
 
 
806 aa  250  6e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  27.65 
 
 
812 aa  246  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  28.01 
 
 
795 aa  246  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  27.54 
 
 
815 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3276  TonB-dependent siderophore receptor  29.06 
 
 
840 aa  245  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.130164 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4072  TonB-dependent siderophore receptor  28.73 
 
 
817 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3182  TonB-dependent receptor family protein  28.14 
 
 
699 aa  244  3.9999999999999997e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.223092 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1501  TonB-dependent siderophore receptor  28.96 
 
 
732 aa  243  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.125781  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 
833 aa  242  2e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0692  TonB-dependent siderophore receptor  28.77 
 
 
801 aa  242  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  29.46 
 
 
803 aa  242  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  28.2 
 
 
807 aa  241  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4418  ferripyoverdine receptor  28.89 
 
 
766 aa  241  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3531  TonB-dependent siderophore receptor  31.42 
 
 
740 aa  239  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313722  decreased coverage  0.00643483 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  28.37 
 
 
799 aa  239  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2583  TonB-dependent siderophore receptor  29.58 
 
 
748 aa  237  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44970  TonB-dependent siderophore receptor  27.58 
 
 
798 aa  238  4e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259905  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3182  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 
735 aa  237  5.0000000000000005e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1055  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  28.79 
 
 
747 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4556  TonB-dependent siderophore receptor  28.77 
 
 
720 aa  233  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2733  TonB-dependent siderophore receptor  27.99 
 
 
747 aa  232  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000321343  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1653  TonB-dependent siderophore receptor  28.36 
 
 
741 aa  232  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0605702  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0400  ferripyoverdine receptor  27.37 
 
 
744 aa  232  2e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.736403  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2711  TonB-dependent siderophore receptor  28.09 
 
 
741 aa  229  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1082  TonB-dependent siderophore receptor  29.03 
 
 
730 aa  226  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.68434  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0540  TonB-dependent siderophore receptor  29.73 
 
 
718 aa  223  7e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2165  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  26.72 
 
 
724 aa  221  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000331924 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0106  TonB-dependent siderophore receptor  27.33 
 
 
728 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1318  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  26.54 
 
 
724 aa  221  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45545  hitchhiker  0.0000000229507 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1981  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  27 
 
 
724 aa  221  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0489607  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2812  TonB-dependent siderophore receptor  27.43 
 
 
747 aa  220  7e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215946  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3097  TonB-dependent siderophore receptor  28.22 
 
 
723 aa  219  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.582192  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2414  TonB-dependent siderophore receptor  27.79 
 
 
737 aa  219  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.486485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>