More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1879 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_4481  TonB-dependent siderophore receptor  46.6 
 
 
824 aa  698    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207643  normal  0.919252 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1879  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
841 aa  1698    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.432996  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3273  TonB-dependent siderophore receptor  41.13 
 
 
826 aa  526  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480033  normal  0.0611881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0874  TonB-dependent siderophore receptor  38.77 
 
 
840 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.708566 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3478  TonB-dependent siderophore receptor  37.74 
 
 
825 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09970  type I ferripyoverdine receptor, FpvB  36.31 
 
 
802 aa  459  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0604  TonB-dependent siderophore receptor  35.54 
 
 
831 aa  450  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1585  TonB-dependent siderophore receptor  35.48 
 
 
828 aa  452  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927871  normal  0.219293 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3666  TonB-dependent siderophore receptor  36.21 
 
 
828 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.476594 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0669  outer membrane ferric siderophore receptor  36.28 
 
 
810 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.907614  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5131  TonB-dependent siderophore receptor  35.66 
 
 
841 aa  437  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.112839  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  33.66 
 
 
812 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  35.95 
 
 
814 aa  436  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3328  TonB-dependent siderophore receptor  34.34 
 
 
822 aa  431  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.513174  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0860  TonB-dependent siderophore receptor  36.39 
 
 
841 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1171  TonB-dependent siderophore receptor  38.9 
 
 
803 aa  426  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.963652  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0846  TonB-dependent siderophore receptor  36.18 
 
 
841 aa  426  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3601  TonB-dependent siderophore receptor  34.06 
 
 
836 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.743224  normal  0.189186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  36.41 
 
 
816 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  36.39 
 
 
821 aa  414  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2121  TonB-dependent siderophore receptor  37.02 
 
 
722 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0440064  normal  0.552205 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  34.19 
 
 
802 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1732  TonB-dependent siderophore receptor  34.03 
 
 
864 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0884061  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0677  TonB-dependent siderophore receptor  36.55 
 
 
745 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029692  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  32.45 
 
 
795 aa  404  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0845  TonB-dependent siderophore receptor  37.04 
 
 
703 aa  404  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0329429  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4072  TonB-dependent siderophore receptor  34.45 
 
 
817 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1784  TonB-dependent siderophore receptor  36.13 
 
 
717 aa  399  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.306565  normal  0.0192687 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1823  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  37.03 
 
 
747 aa  398  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3374  TonB-dependent siderophore receptor  37.59 
 
 
738 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0588335  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4993  TonB-dependent siderophore receptor  37.59 
 
 
738 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0250813  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  32.2 
 
 
812 aa  396  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5294  TonB-dependent siderophore receptor  37.59 
 
 
727 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.117694 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  35.29 
 
 
803 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0759  TonB-dependent siderophore receptor  35.21 
 
 
800 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1449  TonB-dependent siderophore receptor  34.87 
 
 
822 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  33.09 
 
 
815 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3276  TonB-dependent siderophore receptor  36.7 
 
 
840 aa  392  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.130164 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2462  TonB-dependent siderophore receptor  35.69 
 
 
724 aa  392  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17690  TonB-dependent siderophore receptor  32.36 
 
 
806 aa  391  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0879  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  37.41 
 
 
713 aa  392  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.871457  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40910  ferripyoverdine receptor  32.76 
 
 
808 aa  387  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00205881  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3692  TonB-dependent siderophore receptor  36.32 
 
 
722 aa  389  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2155  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  35.8 
 
 
752 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0883  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  35.8 
 
 
719 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0793  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  35.8 
 
 
719 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.454561  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  33.88 
 
 
799 aa  385  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1961  TonB-dependent siderophore receptor  34.66 
 
 
803 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.281016  normal  0.90568 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4418  ferripyoverdine receptor  37.27 
 
 
766 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1848  TonB-dependent siderophore receptor  32.09 
 
 
826 aa  383  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.817483  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09340  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  36.32 
 
 
720 aa  382  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2065  TonB-dependent siderophore receptor  33.7 
 
 
809 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44970  TonB-dependent siderophore receptor  33.04 
 
 
798 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259905  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2151  TonB-dependent siderophore receptor, putative  33.08 
 
 
825 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0848793  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1440  TonB-dependent siderophore receptor  33.76 
 
 
827 aa  374  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  32.2 
 
 
844 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02230  outer membrane ferripyoverdine receptor  31.83 
 
 
789 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2152  TonB-dependent siderophore receptor, putative  35.08 
 
 
743 aa  372  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101667  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1962  TonB-dependent siderophore receptor  35.78 
 
 
746 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1678  TonB-dependent siderophore receptor  31.96 
 
 
830 aa  369  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.463262  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3531  TonB-dependent siderophore receptor  36.44 
 
 
740 aa  362  2e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313722  decreased coverage  0.00643483 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1501  TonB-dependent siderophore receptor  35.16 
 
 
732 aa  361  2e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.125781  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  32.64 
 
 
787 aa  358  2.9999999999999997e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0450384 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3410  TonB-dependent siderophore receptor  36.49 
 
 
714 aa  353  5.9999999999999994e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1082  TonB-dependent siderophore receptor  34.37 
 
 
730 aa  352  2e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.68434  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2121  TonB-dependent siderophore receptor  33.73 
 
 
693 aa  352  2e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000812539  normal  0.443663 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4082  TonB-dependent siderophore receptor  32.25 
 
 
819 aa  351  4e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671478  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0692  TonB-dependent siderophore receptor  32.35 
 
 
801 aa  349  2e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2342  TonB-dependent siderophore receptor  33.58 
 
 
693 aa  348  2e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000105633  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  30.27 
 
 
807 aa  348  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  32.22 
 
 
833 aa  348  3e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1841  TonB-dependent siderophore receptor  33.58 
 
 
696 aa  347  6e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000240616  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2539  TonB-dependent siderophore receptor  32.42 
 
 
753 aa  342  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2440  FhuE receptor  32.42 
 
 
753 aa  342  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1653  TonB-dependent siderophore receptor  33.92 
 
 
741 aa  342  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0605702  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1326  TonB-dependent siderophore receptor  34.13 
 
 
741 aa  341  4e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.624497  normal  0.0240469 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2583  TonB-dependent siderophore receptor  35.19 
 
 
748 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2711  TonB-dependent siderophore receptor  33.77 
 
 
741 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1055  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  34.29 
 
 
747 aa  337  5.999999999999999e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2733  TonB-dependent siderophore receptor  33.48 
 
 
747 aa  333  1e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000321343  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2414  TonB-dependent siderophore receptor  32.7 
 
 
737 aa  331  3e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.486485  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2812  TonB-dependent siderophore receptor  33.14 
 
 
747 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215946  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1981  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  31.02 
 
 
724 aa  327  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0489607  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4556  TonB-dependent siderophore receptor  32.86 
 
 
720 aa  327  7e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2165  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  31.45 
 
 
724 aa  326  9e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000331924 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1280  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  31.45 
 
 
724 aa  326  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.76264 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1303  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  31.02 
 
 
724 aa  325  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.11921  hitchhiker  0.00000000921463 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0950  TonB-dependent siderophore receptor  31.65 
 
 
723 aa  324  3e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000152119  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1318  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  30.89 
 
 
724 aa  323  9.000000000000001e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45545  hitchhiker  0.0000000229507 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1482  TonB-dependent siderophore receptor  34.03 
 
 
723 aa  323  9.999999999999999e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0988  TonB-dependent siderophore receptor  31.93 
 
 
731 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00021194  normal  0.772446 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0952  TonB-dependent siderophore receptor  31.84 
 
 
729 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000770151  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0298  TonB-dependent siderophore receptor  33.24 
 
 
765 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496708  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2124  TonB-dependent siderophore receptor  30.67 
 
 
722 aa  321  3e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000170131  normal  0.221939 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3863  TonB-dependent siderophore receptor  31.08 
 
 
733 aa  320  7e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000567085  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0288  TonB-dependent siderophore receptor  33.01 
 
 
765 aa  320  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.566614  normal  0.515749 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2192  TonB-dependent siderophore receptor  33.06 
 
 
725 aa  319  2e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3182  TonB-dependent receptor family protein  31.77 
 
 
699 aa  318  4e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.223092 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1617  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  32.07 
 
 
728 aa  316  9.999999999999999e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000544721  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0272  TonB-dependent siderophore receptor  33.1 
 
 
765 aa  315  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199499 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>