More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2065 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1678  TonB-dependent siderophore receptor  48.92 
 
 		 830 aa  728    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.463262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1848  TonB-dependent siderophore receptor  46.61 
 
 		 826 aa  761    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.817483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2065  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 809 aa  1657    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0874  TonB-dependent siderophore receptor  43.79 
 
 		 840 aa  617  1e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1585  TonB-dependent siderophore receptor  40.23 
 
 		 828 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927871  normal  0.219293 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3666  TonB-dependent siderophore receptor  40.7 
 
 		 828 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.476594 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3273  TonB-dependent siderophore receptor  40.2 
 
 		 826 aa  524  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480033  normal  0.0611881 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3478  TonB-dependent siderophore receptor  38.38 
 
 		 825 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0759  TonB-dependent siderophore receptor  40.55 
 
 		 800 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2151  TonB-dependent siderophore receptor, putative  36.73 
 
 		 825 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0848793  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1961  TonB-dependent siderophore receptor  36.73 
 
 		 803 aa  463  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.281016  normal  0.90568 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0604  TonB-dependent siderophore receptor  34.8 
 
 		 831 aa  444  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09970  type I ferripyoverdine receptor, FpvB  36.59 
 
 		 802 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1962  TonB-dependent siderophore receptor  36.89 
 
 		 746 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2152  TonB-dependent siderophore receptor, putative  36.58 
 
 		 743 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101667  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4481  TonB-dependent siderophore receptor  34.43 
 
 		 824 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207643  normal  0.919252 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3328  TonB-dependent siderophore receptor  34.34 
 
 		 822 aa  419  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.513174  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  34.75 
 
 		 844 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0860  TonB-dependent siderophore receptor  33.65 
 
 		 841 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0846  TonB-dependent siderophore receptor  33.65 
 
 		 841 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0669  outer membrane ferric siderophore receptor  34.02 
 
 		 810 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.907614  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  33.65 
 
 		 812 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4082  TonB-dependent siderophore receptor  34.92 
 
 		 819 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671478  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5131  TonB-dependent siderophore receptor  33.57 
 
 		 841 aa  402  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.112839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  33.96 
 
 		 821 aa  399  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4072  TonB-dependent siderophore receptor  33.85 
 
 		 817 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3601  TonB-dependent siderophore receptor  33.97 
 
 		 836 aa  388  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.743224  normal  0.189186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  33.53 
 
 		 802 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02230  outer membrane ferripyoverdine receptor  33.09 
 
 		 789 aa  382  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2121  TonB-dependent siderophore receptor  34.92 
 
 		 722 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0440064  normal  0.552205 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1879  TonB-dependent siderophore receptor  33.7 
 
 		 841 aa  377  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.432996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1784  TonB-dependent siderophore receptor  34.25 
 
 		 717 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.306565  normal  0.0192687 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1732  TonB-dependent siderophore receptor  32.85 
 
 		 864 aa  373  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0884061  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  32.7 
 
 		 816 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3692  TonB-dependent siderophore receptor  34.97 
 
 		 722 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0879  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  35.19 
 
 		 713 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.871457  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17690  TonB-dependent siderophore receptor  32.19 
 
 		 806 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0692  TonB-dependent siderophore receptor  32.16 
 
 		 801 aa  365  2e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09340  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  34.45 
 
 		 720 aa  364  3e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2155  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  34.79 
 
 		 752 aa  364  4e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0677  TonB-dependent siderophore receptor  32.86 
 
 		 745 aa  361  3e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3374  TonB-dependent siderophore receptor  34.12 
 
 		 738 aa  361  3e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0588335  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4993  TonB-dependent siderophore receptor  34.12 
 
 		 738 aa  361  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0250813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5294  TonB-dependent siderophore receptor  34.12 
 
 		 727 aa  360  5e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117694 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0793  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  34.64 
 
 		 719 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.454561  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0883  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  34.64 
 
 		 719 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1823  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  34.46 
 
 		 747 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  34.13 
 
 		 815 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0845  TonB-dependent siderophore receptor  34.72 
 
 		 703 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0329429  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  33.17 
 
 		 803 aa  356  8.999999999999999e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  32.36 
 
 		 787 aa  355  2.9999999999999997e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0450384 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  33.74 
 
 		 814 aa  355  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  32.1 
 
 		 799 aa  354  4e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1449  TonB-dependent siderophore receptor  32.8 
 
 		 822 aa  352  2e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2462  TonB-dependent siderophore receptor  32.92 
 
 		 724 aa  343  9e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1171  TonB-dependent siderophore receptor  32.33 
 
 		 803 aa  333  6e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.963652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44970  TonB-dependent siderophore receptor  30.71 
 
 		 798 aa  333  9e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259905  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  29.62 
 
 		 812 aa  331  3e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0400  ferripyoverdine receptor  31.11 
 
 		 744 aa  323  6e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.736403  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1440  TonB-dependent siderophore receptor  32.48 
 
 		 827 aa  321  3.9999999999999996e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  29.13 
 
 		 807 aa  319  2e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0288  TonB-dependent siderophore receptor  33.03 
 
 		 765 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.566614  normal  0.515749 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0272  TonB-dependent siderophore receptor  33.03 
 
 		 765 aa  313  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199499 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4640  TonB-dependent siderophore receptor  34.18 
 
 		 719 aa  313  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0269226  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40910  ferripyoverdine receptor  28.85 
 
 		 808 aa  311  2e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00205881  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0298  TonB-dependent siderophore receptor  32.8 
 
 		 765 aa  312  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3276  TonB-dependent siderophore receptor  30.51 
 
 		 840 aa  310  5.9999999999999995e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130164 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4535  TonB-dependent siderophore receptor  31.88 
 
 		 778 aa  304  5.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.453333 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3182  TonB-dependent siderophore receptor  33.28 
 
 		 735 aa  304  5.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  30.76 
 
 		 833 aa  301  3e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0535  TonB-dependent siderophore receptor  32.37 
 
 		 725 aa  294  4e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0569  TonB-dependent siderophore receptor  31.75 
 
 		 724 aa  294  5e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.931435 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0580  TonB-dependent siderophore receptor  32.08 
 
 		 725 aa  292  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1501  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 732 aa  292  2e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.125781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3496  TonB-dependent siderophore receptor  32.34 
 
 		 723 aa  291  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4418  ferripyoverdine receptor  31.59 
 
 		 766 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2192  TonB-dependent siderophore receptor  31.78 
 
 		 725 aa  287  7e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0586  TonB-dependent siderophore receptor  32.33 
 
 		 724 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2539  TonB-dependent siderophore receptor  31.37 
 
 		 719 aa  283  6.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4556  TonB-dependent siderophore receptor  31.09 
 
 		 720 aa  277  6e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2583  TonB-dependent siderophore receptor  32.7 
 
 		 748 aa  275  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1055  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.58 
 
 		 747 aa  271  4e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1841  TonB-dependent siderophore receptor  31.33 
 
 		 696 aa  268  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000240616  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2440  FhuE receptor  30.4 
 
 		 753 aa  267  5e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1303  TonB-dependent siderophore receptor  31.78 
 
 		 724 aa  266  8e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1482  TonB-dependent siderophore receptor  30.82 
 
 		 723 aa  266  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1481  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.47 
 
 		 729 aa  265  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00382185  hitchhiker  0.00000310394 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1280  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.49 
 
 		 724 aa  266  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.76264 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1223  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.47 
 
 		 729 aa  265  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000020204  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1318  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.35 
 
 		 724 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45545  hitchhiker  0.0000000229507 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01098  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.47 
 
 		 729 aa  265  3e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.523255  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1981  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.35 
 
 		 724 aa  265  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0489607  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1224  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.47 
 
 		 729 aa  265  3e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000059752  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2499  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.47 
 
 		 729 aa  265  3e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318087  unclonable  0.0000000283448 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2222  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.47 
 
 		 729 aa  265  3e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0115447  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01106  hypothetical protein  29.47 
 
 		 729 aa  265  3e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.689576  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1303  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.35 
 
 		 724 aa  265  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.11921  hitchhiker  0.00000000921463 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2539  TonB-dependent siderophore receptor  30.26 
 
 		 753 aa  264  4e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2545  TonB-dependent siderophore receptor  29.33 
 
 		 729 aa  264  6e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00327648  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3410  TonB-dependent siderophore receptor  31.03 
 
 		 714 aa  263  6.999999999999999e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635094 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>