More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1481 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01098  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  99.86 
 
 
729 aa  1501    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.523255  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2545  TonB-dependent siderophore receptor  99.73 
 
 
729 aa  1499    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00327648  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1224  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  99.86 
 
 
729 aa  1501    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000059752  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2165  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  80.71 
 
 
724 aa  1225    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000331924 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1303  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  80.71 
 
 
724 aa  1225    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.11921  hitchhiker  0.00000000921463 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1223  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  100 
 
 
729 aa  1504    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000020204  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2025  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  98.63 
 
 
729 aa  1486    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000237263  hitchhiker  0.0000045764 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2499  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  99.86 
 
 
729 aa  1501    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318087  unclonable  0.0000000283448 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1055  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  54.77 
 
 
747 aa  808    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01106  hypothetical protein  99.86 
 
 
729 aa  1501    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.689576  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1617  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  80.5 
 
 
728 aa  1240    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000544721  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1318  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  80.71 
 
 
724 aa  1227    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45545  hitchhiker  0.0000000229507 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1981  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  80.71 
 
 
724 aa  1226    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0489607  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1481  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  100 
 
 
729 aa  1504    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00382185  hitchhiker  0.00000310394 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2222  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  99.59 
 
 
729 aa  1501    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0115447  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1280  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  81.12 
 
 
724 aa  1231    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.76264 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3410  TonB-dependent siderophore receptor  44.48 
 
 
714 aa  609  1e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3182  TonB-dependent siderophore receptor  45.45 
 
 
735 aa  595  1e-169  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4418  ferripyoverdine receptor  36.67 
 
 
766 aa  475  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3276  TonB-dependent siderophore receptor  39.07 
 
 
840 aa  473  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.130164 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1653  TonB-dependent siderophore receptor  36.33 
 
 
741 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0605702  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0950  TonB-dependent siderophore receptor  38.47 
 
 
723 aa  464  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000152119  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0988  TonB-dependent siderophore receptor  38.19 
 
 
731 aa  462  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00021194  normal  0.772446 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0952  TonB-dependent siderophore receptor  38.06 
 
 
729 aa  462  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000770151  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2711  TonB-dependent siderophore receptor  36.46 
 
 
741 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2414  TonB-dependent siderophore receptor  36.45 
 
 
737 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.486485  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1482  TonB-dependent siderophore receptor  37.38 
 
 
723 aa  457  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2733  TonB-dependent siderophore receptor  36.03 
 
 
747 aa  458  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000321343  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2812  TonB-dependent siderophore receptor  36.03 
 
 
747 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215946  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3863  TonB-dependent siderophore receptor  36.81 
 
 
733 aa  449  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000567085  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1440  TonB-dependent siderophore receptor  37.04 
 
 
827 aa  451  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1517  TonB-dependent siderophore receptor  37.62 
 
 
737 aa  452  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0134645  normal  0.877607 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1451  TonB-dependent siderophore receptor  37.35 
 
 
737 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2124  TonB-dependent siderophore receptor  37.18 
 
 
722 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000170131  normal  0.221939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1507  TonB-dependent siderophore receptor  37.35 
 
 
737 aa  445  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.681157  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3033  ferric alcaligin siderophore receptor  38.17 
 
 
700 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2136  TonB-dependent siderophore receptor  36.98 
 
 
722 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.503645  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  37.15 
 
 
803 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2339  TonB-dependent siderophore receptor  36.83 
 
 
722 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000312883  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  37.57 
 
 
816 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1841  TonB-dependent siderophore receptor  35.68 
 
 
696 aa  435  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000240616  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  36.32 
 
 
802 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4082  TonB-dependent siderophore receptor  36.12 
 
 
819 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671478  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2539  TonB-dependent siderophore receptor  36.72 
 
 
753 aa  431  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2440  FhuE receptor  36.57 
 
 
753 aa  431  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3496  TonB-dependent siderophore receptor  35.63 
 
 
723 aa  427  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0692  TonB-dependent siderophore receptor  36.11 
 
 
801 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2342  TonB-dependent siderophore receptor  34.71 
 
 
693 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000105633  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0137  TonB-dependent iron-siderophore receptor precursor  34.44 
 
 
721 aa  416  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2121  TonB-dependent siderophore receptor  34.71 
 
 
693 aa  415  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000812539  normal  0.443663 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  35.55 
 
 
814 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1171  TonB-dependent siderophore receptor  36.78 
 
 
803 aa  410  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.963652  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3182  TonB-dependent receptor family protein  35.82 
 
 
699 aa  412  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.223092 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1784  TonB-dependent siderophore receptor  35.71 
 
 
717 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.306565  normal  0.0192687 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2121  TonB-dependent siderophore receptor  34.41 
 
 
722 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0440064  normal  0.552205 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4556  TonB-dependent siderophore receptor  35.17 
 
 
720 aa  405  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4072  TonB-dependent siderophore receptor  35.02 
 
 
817 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1501  TonB-dependent siderophore receptor  32.96 
 
 
732 aa  398  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.125781  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2192  TonB-dependent siderophore receptor  35.49 
 
 
725 aa  397  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  32.39 
 
 
799 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  35.16 
 
 
815 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3692  TonB-dependent siderophore receptor  35.75 
 
 
722 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1999  outer membrane receptor for Fe  32.32 
 
 
706 aa  390  1e-107  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.928723  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02230  outer membrane ferripyoverdine receptor  33.63 
 
 
789 aa  387  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  34.75 
 
 
812 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  34.26 
 
 
812 aa  387  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40910  ferripyoverdine receptor  34.84 
 
 
808 aa  384  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00205881  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2583  TonB-dependent siderophore receptor  34.14 
 
 
748 aa  382  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  34.26 
 
 
807 aa  382  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17690  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 
806 aa  373  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1326  TonB-dependent siderophore receptor  33.78 
 
 
741 aa  375  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.624497  normal  0.0240469 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09970  type I ferripyoverdine receptor, FpvB  34.52 
 
 
802 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2462  TonB-dependent siderophore receptor  33.73 
 
 
724 aa  371  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  32.75 
 
 
795 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44970  TonB-dependent siderophore receptor  34.5 
 
 
798 aa  369  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259905  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0288  TonB-dependent siderophore receptor  34.47 
 
 
765 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.566614  normal  0.515749 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1082  TonB-dependent siderophore receptor  32.85 
 
 
730 aa  365  2e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.68434  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0669  outer membrane ferric siderophore receptor  33.76 
 
 
810 aa  364  3e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.907614  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  32.74 
 
 
833 aa  363  6e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0272  TonB-dependent siderophore receptor  34.34 
 
 
765 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199499 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2000  outer membrane receptor for Fe  32.71 
 
 
706 aa  362  1e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4481  TonB-dependent siderophore receptor  35.52 
 
 
824 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207643  normal  0.919252 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3097  TonB-dependent siderophore receptor  32.27 
 
 
723 aa  357  5.999999999999999e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.582192  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3531  TonB-dependent siderophore receptor  32.71 
 
 
740 aa  355  1e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313722  decreased coverage  0.00643483 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0298  TonB-dependent siderophore receptor  33.42 
 
 
765 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496708  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1449  TonB-dependent siderophore receptor  33.25 
 
 
822 aa  353  5.9999999999999994e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0603  TonB-dependent siderophore receptor  32.06 
 
 
716 aa  351  2e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00298801  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0873  outer membrane receptor for Fe  31.52 
 
 
712 aa  351  3e-95  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.474088  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4535  TonB-dependent siderophore receptor  33.92 
 
 
778 aa  348  2e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.453333 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3717  TonB-dependent siderophore receptor  31.22 
 
 
726 aa  343  9e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0540  TonB-dependent siderophore receptor  31.71 
 
 
718 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2724  FhuE receptor  32.46 
 
 
707 aa  337  5e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3929  TonB-dependent siderophore receptor  30.26 
 
 
702 aa  336  1e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3277  TonB-dependent siderophore receptor  30.12 
 
 
702 aa  335  3e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.85101  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0874  TonB-dependent siderophore receptor  32.32 
 
 
840 aa  330  8e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.708566 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  33.24 
 
 
821 aa  328  2.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0845  TonB-dependent siderophore receptor  32.75 
 
 
703 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0329429  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3273  TonB-dependent siderophore receptor  33.19 
 
 
826 aa  323  6e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480033  normal  0.0611881 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0604  TonB-dependent siderophore receptor  31.97 
 
 
831 aa  323  6e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1823  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  32.07 
 
 
747 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>