More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0879 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5294  TonB-dependent siderophore receptor  64.42 
 
 
727 aa  910    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.117694 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0883  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  64.49 
 
 
719 aa  891    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2155  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  60.62 
 
 
752 aa  890    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0677  TonB-dependent siderophore receptor  62.4 
 
 
745 aa  897    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029692  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0845  TonB-dependent siderophore receptor  54.09 
 
 
703 aa  735    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0329429  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1823  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  64.96 
 
 
747 aa  911    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0793  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  64.49 
 
 
719 aa  892    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.454561  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0879  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  100 
 
 
713 aa  1452    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.871457  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3374  TonB-dependent siderophore receptor  64.42 
 
 
738 aa  912    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0588335  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09340  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  95.08 
 
 
720 aa  1340    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4993  TonB-dependent siderophore receptor  64.42 
 
 
738 aa  912    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0250813  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0874  TonB-dependent siderophore receptor  39.71 
 
 
840 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.708566 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3478  TonB-dependent siderophore receptor  37.95 
 
 
825 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3273  TonB-dependent siderophore receptor  38.16 
 
 
826 aa  457  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480033  normal  0.0611881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1585  TonB-dependent siderophore receptor  38.43 
 
 
828 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927871  normal  0.219293 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4481  TonB-dependent siderophore receptor  37.61 
 
 
824 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207643  normal  0.919252 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  39.14 
 
 
821 aa  446  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0604  TonB-dependent siderophore receptor  36.29 
 
 
831 aa  438  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  36.36 
 
 
812 aa  436  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3666  TonB-dependent siderophore receptor  37.72 
 
 
828 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.476594 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3328  TonB-dependent siderophore receptor  37.74 
 
 
822 aa  432  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.513174  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09970  type I ferripyoverdine receptor, FpvB  37.59 
 
 
802 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2151  TonB-dependent siderophore receptor, putative  36.47 
 
 
825 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0848793  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1961  TonB-dependent siderophore receptor  38.27 
 
 
803 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.281016  normal  0.90568 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1732  TonB-dependent siderophore receptor  35.72 
 
 
864 aa  419  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0884061  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0759  TonB-dependent siderophore receptor  38.32 
 
 
800 aa  412  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  35.15 
 
 
844 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3601  TonB-dependent siderophore receptor  33.59 
 
 
836 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.743224  normal  0.189186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0669  outer membrane ferric siderophore receptor  34.87 
 
 
810 aa  399  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.907614  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0860  TonB-dependent siderophore receptor  34.95 
 
 
841 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1962  TonB-dependent siderophore receptor  35.11 
 
 
746 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0846  TonB-dependent siderophore receptor  34.5 
 
 
841 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1678  TonB-dependent siderophore receptor  37.3 
 
 
830 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.463262  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2152  TonB-dependent siderophore receptor, putative  34.97 
 
 
743 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101667  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1449  TonB-dependent siderophore receptor  35.35 
 
 
822 aa  391  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2121  TonB-dependent siderophore receptor  34.65 
 
 
722 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0440064  normal  0.552205 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5131  TonB-dependent siderophore receptor  33.15 
 
 
841 aa  392  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.112839  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1879  TonB-dependent siderophore receptor  37.41 
 
 
841 aa  392  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.432996  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1848  TonB-dependent siderophore receptor  36.59 
 
 
826 aa  389  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.817483  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  36.47 
 
 
816 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  35.18 
 
 
815 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3692  TonB-dependent siderophore receptor  35.01 
 
 
722 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  35.17 
 
 
814 aa  379  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1440  TonB-dependent siderophore receptor  35.5 
 
 
827 aa  377  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  36.08 
 
 
802 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2065  TonB-dependent siderophore receptor  34.79 
 
 
809 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  34.81 
 
 
799 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1784  TonB-dependent siderophore receptor  34.11 
 
 
717 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.306565  normal  0.0192687 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17690  TonB-dependent siderophore receptor  32.84 
 
 
806 aa  369  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  33.92 
 
 
795 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2462  TonB-dependent siderophore receptor  34.62 
 
 
724 aa  364  3e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02230  outer membrane ferripyoverdine receptor  33.33 
 
 
789 aa  355  2e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1082  TonB-dependent siderophore receptor  35.68 
 
 
730 aa  355  2e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.68434  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4082  TonB-dependent siderophore receptor  33.98 
 
 
819 aa  355  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671478  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0400  ferripyoverdine receptor  30.72 
 
 
744 aa  353  5.9999999999999994e-96  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.736403  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  34.83 
 
 
803 aa  353  8e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40910  ferripyoverdine receptor  31.38 
 
 
808 aa  350  4e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00205881  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0692  TonB-dependent siderophore receptor  35.22 
 
 
801 aa  350  5e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3410  TonB-dependent siderophore receptor  33.84 
 
 
714 aa  350  5e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  32.66 
 
 
807 aa  348  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4418  ferripyoverdine receptor  35.76 
 
 
766 aa  347  5e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  32.46 
 
 
812 aa  343  5e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44970  TonB-dependent siderophore receptor  32.19 
 
 
798 aa  340  8e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259905  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  32.94 
 
 
787 aa  337  7e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0450384 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0952  TonB-dependent siderophore receptor  32.25 
 
 
729 aa  335  1e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000770151  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1326  TonB-dependent siderophore receptor  32.97 
 
 
741 aa  334  4e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.624497  normal  0.0240469 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1482  TonB-dependent siderophore receptor  32.87 
 
 
723 aa  332  1e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2440  FhuE receptor  32.76 
 
 
753 aa  332  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1171  TonB-dependent siderophore receptor  34.05 
 
 
803 aa  331  3e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.963652  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4640  TonB-dependent siderophore receptor  34.76 
 
 
719 aa  330  4e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0269226  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2539  TonB-dependent siderophore receptor  32.76 
 
 
753 aa  330  7e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3182  TonB-dependent siderophore receptor  32.03 
 
 
735 aa  330  7e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0988  TonB-dependent siderophore receptor  31.98 
 
 
731 aa  328  3e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00021194  normal  0.772446 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2583  TonB-dependent siderophore receptor  33.12 
 
 
748 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1303  TonB-dependent siderophore receptor  33.83 
 
 
724 aa  325  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2165  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.04 
 
 
724 aa  324  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000331924 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1303  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.04 
 
 
724 aa  324  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.11921  hitchhiker  0.00000000921463 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2414  TonB-dependent siderophore receptor  33.73 
 
 
737 aa  324  4e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.486485  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2192  TonB-dependent siderophore receptor  32.6 
 
 
725 aa  324  4e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1981  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.04 
 
 
724 aa  324  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0489607  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1653  TonB-dependent siderophore receptor  32.68 
 
 
741 aa  323  6e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0605702  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1501  TonB-dependent siderophore receptor  32.26 
 
 
732 aa  323  9.000000000000001e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.125781  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1055  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.38 
 
 
747 aa  322  9.999999999999999e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0586  TonB-dependent siderophore receptor  32.03 
 
 
724 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4072  TonB-dependent siderophore receptor  32.67 
 
 
817 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2733  TonB-dependent siderophore receptor  32.55 
 
 
747 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000321343  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2711  TonB-dependent siderophore receptor  32.54 
 
 
741 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1318  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  32.89 
 
 
724 aa  321  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45545  hitchhiker  0.0000000229507 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1280  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  32.89 
 
 
724 aa  321  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.76264 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0950  TonB-dependent siderophore receptor  31.87 
 
 
723 aa  321  3e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000152119  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3863  TonB-dependent siderophore receptor  31.09 
 
 
733 aa  321  3e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000567085  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2812  TonB-dependent siderophore receptor  32.32 
 
 
747 aa  320  5e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215946  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0569  TonB-dependent siderophore receptor  31.95 
 
 
724 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.931435 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1841  TonB-dependent siderophore receptor  32.91 
 
 
696 aa  318  3e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000240616  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2539  TonB-dependent siderophore receptor  32.89 
 
 
719 aa  313  4.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0580  TonB-dependent siderophore receptor  31.66 
 
 
725 aa  314  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3182  TonB-dependent receptor family protein  31.88 
 
 
699 aa  313  9e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.223092 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2545  TonB-dependent siderophore receptor  31.28 
 
 
729 aa  312  1e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00327648  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4556  TonB-dependent siderophore receptor  33.03 
 
 
720 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2025  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  30.87 
 
 
729 aa  311  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000237263  hitchhiker  0.0000045764 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>