More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_44130 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  47.01 
 
 
814 aa  731    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02230  outer membrane ferripyoverdine receptor  68.52 
 
 
789 aa  1116    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17690  TonB-dependent siderophore receptor  78.66 
 
 
806 aa  1253    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  100 
 
 
812 aa  1674    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  78.03 
 
 
795 aa  1278    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  55.53 
 
 
799 aa  872    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40910  ferripyoverdine receptor  66.21 
 
 
808 aa  1090    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00205881  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  47.2 
 
 
815 aa  739    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  85.31 
 
 
807 aa  1410    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44970  TonB-dependent siderophore receptor  84.25 
 
 
798 aa  1347    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259905  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  41.6 
 
 
816 aa  590  1e-167  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1501  TonB-dependent siderophore receptor  45.72 
 
 
732 aa  566  1e-160  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.125781  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  39.9 
 
 
802 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  40.36 
 
 
833 aa  543  1e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0692  TonB-dependent siderophore receptor  38.1 
 
 
801 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  39.16 
 
 
803 aa  509  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  36.52 
 
 
812 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1171  TonB-dependent siderophore receptor  37.97 
 
 
803 aa  491  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.963652  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4481  TonB-dependent siderophore receptor  36.4 
 
 
824 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207643  normal  0.919252 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4072  TonB-dependent siderophore receptor  35.28 
 
 
817 aa  482  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1440  TonB-dependent siderophore receptor  38.76 
 
 
827 aa  476  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4082  TonB-dependent siderophore receptor  36.34 
 
 
819 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671478  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0604  TonB-dependent siderophore receptor  37.28 
 
 
831 aa  463  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4418  ferripyoverdine receptor  38.45 
 
 
766 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3276  TonB-dependent siderophore receptor  37.12 
 
 
840 aa  458  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.130164 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2440  FhuE receptor  35.93 
 
 
753 aa  433  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0669  outer membrane ferric siderophore receptor  34.59 
 
 
810 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.907614  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1482  TonB-dependent siderophore receptor  38.42 
 
 
723 aa  430  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2539  TonB-dependent siderophore receptor  35.79 
 
 
753 aa  431  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09970  type I ferripyoverdine receptor, FpvB  35.87 
 
 
802 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3328  TonB-dependent siderophore receptor  34.24 
 
 
822 aa  428  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.513174  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3496  TonB-dependent siderophore receptor  37.77 
 
 
723 aa  424  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2121  TonB-dependent siderophore receptor  36.25 
 
 
722 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0440064  normal  0.552205 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1055  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  35.27 
 
 
747 aa  419  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1585  TonB-dependent siderophore receptor  34.88 
 
 
828 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927871  normal  0.219293 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0846  TonB-dependent siderophore receptor  33.02 
 
 
841 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3410  TonB-dependent siderophore receptor  35.39 
 
 
714 aa  414  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3478  TonB-dependent siderophore receptor  33.82 
 
 
825 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3692  TonB-dependent siderophore receptor  36.72 
 
 
722 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0860  TonB-dependent siderophore receptor  32.95 
 
 
841 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1449  TonB-dependent siderophore receptor  35.37 
 
 
822 aa  411  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3182  TonB-dependent receptor family protein  35.03 
 
 
699 aa  409  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.223092 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  32.87 
 
 
844 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2462  TonB-dependent siderophore receptor  37.96 
 
 
724 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3666  TonB-dependent siderophore receptor  34 
 
 
828 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.476594 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3182  TonB-dependent siderophore receptor  35.14 
 
 
735 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1784  TonB-dependent siderophore receptor  37.06 
 
 
717 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.306565  normal  0.0192687 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0950  TonB-dependent siderophore receptor  36.25 
 
 
723 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000152119  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0874  TonB-dependent siderophore receptor  34.71 
 
 
840 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.708566 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1841  TonB-dependent siderophore receptor  34.14 
 
 
696 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000240616  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2124  TonB-dependent siderophore receptor  35.22 
 
 
722 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000170131  normal  0.221939 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1961  TonB-dependent siderophore receptor  34.54 
 
 
803 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.281016  normal  0.90568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0988  TonB-dependent siderophore receptor  35.99 
 
 
731 aa  399  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00021194  normal  0.772446 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1879  TonB-dependent siderophore receptor  32.2 
 
 
841 aa  396  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.432996  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1326  TonB-dependent siderophore receptor  36.93 
 
 
741 aa  397  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.624497  normal  0.0240469 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2583  TonB-dependent siderophore receptor  35.72 
 
 
748 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1617  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.33 
 
 
728 aa  394  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000544721  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0952  TonB-dependent siderophore receptor  36.1 
 
 
729 aa  393  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000770151  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2025  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  34.55 
 
 
729 aa  390  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000237263  hitchhiker  0.0000045764 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1280  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.82 
 
 
724 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.76264 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1981  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.82 
 
 
724 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0489607  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2339  TonB-dependent siderophore receptor  34.78 
 
 
722 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000312883  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1303  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.82 
 
 
724 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.11921  hitchhiker  0.00000000921463 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2136  TonB-dependent siderophore receptor  35.15 
 
 
722 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.503645  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0288  TonB-dependent siderophore receptor  36.57 
 
 
765 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.566614  normal  0.515749 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2812  TonB-dependent siderophore receptor  34.73 
 
 
747 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215946  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1318  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.82 
 
 
724 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45545  hitchhiker  0.0000000229507 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2165  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.82 
 
 
724 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000331924 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01098  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  34.26 
 
 
729 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.523255  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2545  TonB-dependent siderophore receptor  34.26 
 
 
729 aa  388  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00327648  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1224  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  34.26 
 
 
729 aa  387  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000059752  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1481  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  34.26 
 
 
729 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00382185  hitchhiker  0.00000310394 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3863  TonB-dependent siderophore receptor  33.94 
 
 
733 aa  387  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000567085  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2121  TonB-dependent siderophore receptor  33.63 
 
 
693 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000812539  normal  0.443663 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1223  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  34.26 
 
 
729 aa  387  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000020204  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2733  TonB-dependent siderophore receptor  34.73 
 
 
747 aa  389  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000321343  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1653  TonB-dependent siderophore receptor  34.84 
 
 
741 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0605702  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2499  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  34.26 
 
 
729 aa  387  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318087  unclonable  0.0000000283448 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01106  hypothetical protein  34.26 
 
 
729 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.689576  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0272  TonB-dependent siderophore receptor  36.17 
 
 
765 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199499 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3531  TonB-dependent siderophore receptor  34.52 
 
 
740 aa  384  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313722  decreased coverage  0.00643483 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2151  TonB-dependent siderophore receptor, putative  33.88 
 
 
825 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0848793  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2342  TonB-dependent siderophore receptor  33.63 
 
 
693 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000105633  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2711  TonB-dependent siderophore receptor  34.69 
 
 
741 aa  386  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2222  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.97 
 
 
729 aa  385  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0115447  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3273  TonB-dependent siderophore receptor  32.46 
 
 
826 aa  381  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480033  normal  0.0611881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0298  TonB-dependent siderophore receptor  35.99 
 
 
765 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496708  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2414  TonB-dependent siderophore receptor  34.3 
 
 
737 aa  379  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.486485  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0759  TonB-dependent siderophore receptor  33 
 
 
800 aa  376  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0845  TonB-dependent siderophore receptor  33.58 
 
 
703 aa  371  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0329429  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4556  TonB-dependent siderophore receptor  33.71 
 
 
720 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2192  TonB-dependent siderophore receptor  34.58 
 
 
725 aa  369  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1082  TonB-dependent siderophore receptor  33.56 
 
 
730 aa  365  2e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.68434  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  32.32 
 
 
821 aa  361  3e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1507  TonB-dependent siderophore receptor  34.15 
 
 
737 aa  360  4e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.681157  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3033  ferric alcaligin siderophore receptor  34.01 
 
 
700 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1451  TonB-dependent siderophore receptor  33.72 
 
 
737 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3374  TonB-dependent siderophore receptor  32.49 
 
 
738 aa  356  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0588335  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1517  TonB-dependent siderophore receptor  33.72 
 
 
737 aa  356  8.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0134645  normal  0.877607 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4993  TonB-dependent siderophore receptor  32.49 
 
 
738 aa  356  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0250813  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>