More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1834 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 787 aa  1608    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0450384 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4640  TonB-dependent siderophore receptor  43.13 
 
 		 719 aa  521  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0269226  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3666  TonB-dependent siderophore receptor  34.79 
 
 		 828 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.476594 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1585  TonB-dependent siderophore receptor  33.87 
 
 		 828 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927871  normal  0.219293 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3478  TonB-dependent siderophore receptor  33.58 
 
 		 825 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4481  TonB-dependent siderophore receptor  34.35 
 
 		 824 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207643  normal  0.919252 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0874  TonB-dependent siderophore receptor  31.97 
 
 		 840 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708566 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3273  TonB-dependent siderophore receptor  34.12 
 
 		 826 aa  392  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480033  normal  0.0611881 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  32.88 
 
 		 815 aa  392  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1303  TonB-dependent siderophore receptor  36.25 
 
 		 724 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  32.27 
 
 		 812 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  33.7 
 
 		 814 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3601  TonB-dependent siderophore receptor  33.45 
 
 		 836 aa  382  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.743224  normal  0.189186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0669  outer membrane ferric siderophore receptor  31.81 
 
 		 810 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.907614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0604  TonB-dependent siderophore receptor  32.83 
 
 		 831 aa  374  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09970  type I ferripyoverdine receptor, FpvB  32.92 
 
 		 802 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3328  TonB-dependent siderophore receptor  33.62 
 
 		 822 aa  372  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.513174  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5131  TonB-dependent siderophore receptor  31.52 
 
 		 841 aa  371  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.112839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  33.25 
 
 		 821 aa  369  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1678  TonB-dependent siderophore receptor  31.05 
 
 		 830 aa  365  2e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.463262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40910  ferripyoverdine receptor  31.3 
 
 		 808 aa  362  2e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00205881  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1879  TonB-dependent siderophore receptor  32.64 
 
 		 841 aa  358  2.9999999999999997e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.432996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  32.32 
 
 		 816 aa  357  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1961  TonB-dependent siderophore receptor  31.65 
 
 		 803 aa  356  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.281016  normal  0.90568 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2065  TonB-dependent siderophore receptor  32.36 
 
 		 809 aa  355  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1449  TonB-dependent siderophore receptor  31.63 
 
 		 822 aa  353  5e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1171  TonB-dependent siderophore receptor  33.29 
 
 		 803 aa  353  7e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.963652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  32.54 
 
 		 799 aa  352  1e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  31.66 
 
 		 844 aa  351  3e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  29.9 
 
 		 802 aa  349  1e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4082  TonB-dependent siderophore receptor  30.17 
 
 		 819 aa  348  3e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671478  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0860  TonB-dependent siderophore receptor  31.38 
 
 		 841 aa  347  7e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0845  TonB-dependent siderophore receptor  33.38 
 
 		 703 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0329429  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0846  TonB-dependent siderophore receptor  30.85 
 
 		 841 aa  345  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1848  TonB-dependent siderophore receptor  30.7 
 
 		 826 aa  344  5e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.817483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  30.27 
 
 		 812 aa  341  2.9999999999999998e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4072  TonB-dependent siderophore receptor  30.3 
 
 		 817 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2151  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.4 
 
 		 825 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0848793  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  32.33 
 
 		 803 aa  341  4e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2155  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  34.57 
 
 		 752 aa  337  5e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1823  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  33.66 
 
 		 747 aa  337  5e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0879  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  32.94 
 
 		 713 aa  335  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.871457  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02230  outer membrane ferripyoverdine receptor  31.3 
 
 		 789 aa  335  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17690  TonB-dependent siderophore receptor  30.58 
 
 		 806 aa  336  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  30.47 
 
 		 795 aa  335  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0883  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  34.28 
 
 		 719 aa  334  4e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0793  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  34.28 
 
 		 719 aa  334  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.454561  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5294  TonB-dependent siderophore receptor  32.96 
 
 		 727 aa  334  4e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117694 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3374  TonB-dependent siderophore receptor  32.82 
 
 		 738 aa  333  6e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0588335  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4993  TonB-dependent siderophore receptor  32.82 
 
 		 738 aa  333  6e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0250813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  30.84 
 
 		 807 aa  330  5.0000000000000004e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44970  TonB-dependent siderophore receptor  30.79 
 
 		 798 aa  327  4.0000000000000003e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259905  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0677  TonB-dependent siderophore receptor  32.57 
 
 		 745 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09340  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  31.56 
 
 		 720 aa  326  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0759  TonB-dependent siderophore receptor  32.13 
 
 		 800 aa  324  4e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2539  TonB-dependent siderophore receptor  32.46 
 
 		 719 aa  324  5e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1784  TonB-dependent siderophore receptor  32.23 
 
 		 717 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.306565  normal  0.0192687 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3692  TonB-dependent siderophore receptor  32.43 
 
 		 722 aa  321  3e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2121  TonB-dependent siderophore receptor  31.72 
 
 		 722 aa  320  5e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0440064  normal  0.552205 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3276  TonB-dependent siderophore receptor  30.55 
 
 		 840 aa  320  5e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130164 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1732  TonB-dependent siderophore receptor  30.77 
 
 		 864 aa  320  6e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0884061  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0580  TonB-dependent siderophore receptor  31.42 
 
 		 725 aa  320  9e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0569  TonB-dependent siderophore receptor  31.81 
 
 		 724 aa  319  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.931435 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  29.74 
 
 		 833 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0535  TonB-dependent siderophore receptor  31.23 
 
 		 725 aa  314  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0586  TonB-dependent siderophore receptor  30.79 
 
 		 724 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0692  TonB-dependent siderophore receptor  29.95 
 
 		 801 aa  310  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2462  TonB-dependent siderophore receptor  31.64 
 
 		 724 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3410  TonB-dependent siderophore receptor  31.82 
 
 		 714 aa  305  3.0000000000000004e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2440  FhuE receptor  30.93 
 
 		 753 aa  303  8.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1653  TonB-dependent siderophore receptor  31.84 
 
 		 741 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0605702  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2539  TonB-dependent siderophore receptor  30.74 
 
 		 753 aa  302  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0106  TonB-dependent siderophore receptor  30.49 
 
 		 728 aa  299  1e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0114  TonB-dependent siderophore receptor  30.88 
 
 		 728 aa  296  7e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2711  TonB-dependent siderophore receptor  31.4 
 
 		 741 aa  296  8e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4286  TonB-dependent siderophore receptor  30.99 
 
 		 728 aa  296  1e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1082  TonB-dependent siderophore receptor  31.47 
 
 		 730 aa  296  1e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4426  TonB-dependent siderophore receptor  30.88 
 
 		 728 aa  294  4e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2414  TonB-dependent siderophore receptor  31.38 
 
 		 737 aa  294  5e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.486485  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2733  TonB-dependent siderophore receptor  31.66 
 
 		 747 aa  293  7e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000321343  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0950  TonB-dependent siderophore receptor  30.87 
 
 		 723 aa  292  1e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000152119  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2152  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.46 
 
 		 743 aa  292  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101667  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1440  TonB-dependent siderophore receptor  31.03 
 
 		 827 aa  291  3e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2812  TonB-dependent siderophore receptor  31.23 
 
 		 747 aa  291  4e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215946  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4418  ferripyoverdine receptor  31.69 
 
 		 766 aa  290  7e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1482  TonB-dependent siderophore receptor  30.27 
 
 		 723 aa  290  8e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1055  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  31.34 
 
 		 747 aa  289  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1962  TonB-dependent siderophore receptor  31.45 
 
 		 746 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4556  TonB-dependent siderophore receptor  31.79 
 
 		 720 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0952  TonB-dependent siderophore receptor  29.81 
 
 		 729 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000770151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2124  TonB-dependent siderophore receptor  29.61 
 
 		 722 aa  283  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000170131  normal  0.221939 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0988  TonB-dependent siderophore receptor  29.61 
 
 		 731 aa  281  3e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00021194  normal  0.772446 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3863  TonB-dependent siderophore receptor  30.8 
 
 		 733 aa  280  5e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000567085  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0298  TonB-dependent siderophore receptor  30.9 
 
 		 765 aa  281  5e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3182  TonB-dependent receptor family protein  29.82 
 
 		 699 aa  279  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.223092 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0400  ferripyoverdine receptor  29.89 
 
 		 744 aa  278  3e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.736403  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2545  TonB-dependent siderophore receptor  29.72 
 
 		 729 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00327648  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0288  TonB-dependent siderophore receptor  30.44 
 
 		 765 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.566614  normal  0.515749 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2136  TonB-dependent siderophore receptor  29.25 
 
 		 722 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.503645  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1501  TonB-dependent siderophore receptor  30.18 
 
 		 732 aa  276  1.0000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.125781  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>