More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_0114 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_0114  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
728 aa  1488    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0106  TonB-dependent siderophore receptor  89.29 
 
 
728 aa  1363    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4286  TonB-dependent siderophore receptor  99.18 
 
 
728 aa  1481    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4426  TonB-dependent siderophore receptor  98.9 
 
 
728 aa  1474    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  37.14 
 
 
814 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1440  TonB-dependent siderophore receptor  36.18 
 
 
827 aa  396  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1841  TonB-dependent siderophore receptor  34.81 
 
 
696 aa  393  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000240616  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  35.23 
 
 
803 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1653  TonB-dependent siderophore receptor  34.75 
 
 
741 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0605702  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  35.82 
 
 
815 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2711  TonB-dependent siderophore receptor  34.34 
 
 
741 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2733  TonB-dependent siderophore receptor  34.06 
 
 
747 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000321343  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2812  TonB-dependent siderophore receptor  33.65 
 
 
747 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215946  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  35.95 
 
 
816 aa  379  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2414  TonB-dependent siderophore receptor  34.29 
 
 
737 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.486485  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2121  TonB-dependent siderophore receptor  33.61 
 
 
693 aa  372  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000812539  normal  0.443663 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4556  TonB-dependent siderophore receptor  34.16 
 
 
720 aa  372  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2342  TonB-dependent siderophore receptor  33.61 
 
 
693 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000105633  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4082  TonB-dependent siderophore receptor  34.87 
 
 
819 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671478  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0137  TonB-dependent iron-siderophore receptor precursor  31.99 
 
 
721 aa  365  1e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0950  TonB-dependent siderophore receptor  33.15 
 
 
723 aa  365  1e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000152119  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  35.32 
 
 
799 aa  363  5.0000000000000005e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2124  TonB-dependent siderophore receptor  32.51 
 
 
722 aa  362  9e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000170131  normal  0.221939 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  33.95 
 
 
802 aa  362  2e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3097  TonB-dependent siderophore receptor  33.24 
 
 
723 aa  361  3e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.582192  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2136  TonB-dependent siderophore receptor  32.82 
 
 
722 aa  360  6e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.503645  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1326  TonB-dependent siderophore receptor  31.57 
 
 
741 aa  358  1.9999999999999998e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.624497  normal  0.0240469 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3410  TonB-dependent siderophore receptor  33.29 
 
 
714 aa  357  2.9999999999999997e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0952  TonB-dependent siderophore receptor  32.57 
 
 
729 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000770151  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0603  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 
716 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00298801  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4072  TonB-dependent siderophore receptor  33.81 
 
 
817 aa  356  1e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2339  TonB-dependent siderophore receptor  32.4 
 
 
722 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000312883  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1501  TonB-dependent siderophore receptor  34.06 
 
 
732 aa  354  2.9999999999999997e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.125781  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  32.56 
 
 
833 aa  353  7e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0988  TonB-dependent siderophore receptor  32.22 
 
 
731 aa  351  2e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00021194  normal  0.772446 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3717  TonB-dependent siderophore receptor  34.06 
 
 
726 aa  352  2e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3033  ferric alcaligin siderophore receptor  33.98 
 
 
700 aa  351  3e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1617  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.19 
 
 
728 aa  350  8e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000544721  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4418  ferripyoverdine receptor  33.33 
 
 
766 aa  349  1e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1055  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  30.65 
 
 
747 aa  349  1e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0540  TonB-dependent siderophore receptor  33.56 
 
 
718 aa  346  1e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3863  TonB-dependent siderophore receptor  31.59 
 
 
733 aa  345  1e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000567085  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  33.04 
 
 
795 aa  344  2.9999999999999997e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  32.62 
 
 
812 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2539  TonB-dependent siderophore receptor  31.02 
 
 
753 aa  344  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1507  TonB-dependent siderophore receptor  33.2 
 
 
737 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.681157  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1517  TonB-dependent siderophore receptor  32.92 
 
 
737 aa  344  4e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0134645  normal  0.877607 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2440  FhuE receptor  30.88 
 
 
753 aa  343  5e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1482  TonB-dependent siderophore receptor  32.75 
 
 
723 aa  343  7e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  32.95 
 
 
812 aa  339  8e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3496  TonB-dependent siderophore receptor  32.29 
 
 
723 aa  340  8e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1451  TonB-dependent siderophore receptor  32.53 
 
 
737 aa  339  9e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17690  TonB-dependent siderophore receptor  32.95 
 
 
806 aa  338  1.9999999999999998e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3276  TonB-dependent siderophore receptor  33.77 
 
 
840 aa  338  2.9999999999999997e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.130164 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09970  type I ferripyoverdine receptor, FpvB  32.95 
 
 
802 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2724  FhuE receptor  32.82 
 
 
707 aa  337  3.9999999999999995e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  33.24 
 
 
807 aa  337  5e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1171  TonB-dependent siderophore receptor  33.48 
 
 
803 aa  336  1e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.963652  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1784  TonB-dependent siderophore receptor  32.47 
 
 
717 aa  331  4e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.306565  normal  0.0192687 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2192  TonB-dependent siderophore receptor  32.84 
 
 
725 aa  331  4e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44970  TonB-dependent siderophore receptor  32.03 
 
 
798 aa  330  5.0000000000000004e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259905  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3692  TonB-dependent siderophore receptor  31.29 
 
 
722 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0692  TonB-dependent siderophore receptor  32.65 
 
 
801 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2121  TonB-dependent siderophore receptor  31.74 
 
 
722 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0440064  normal  0.552205 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0669  outer membrane ferric siderophore receptor  32.62 
 
 
810 aa  328  3e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.907614  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3531  TonB-dependent siderophore receptor  32.17 
 
 
740 aa  326  9e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313722  decreased coverage  0.00643483 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3601  TonB-dependent siderophore receptor  32.61 
 
 
836 aa  325  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.743224  normal  0.189186 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3064  TonB-dependent siderophore receptor  31.71 
 
 
712 aa  324  4e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1303  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  31.43 
 
 
724 aa  323  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.11921  hitchhiker  0.00000000921463 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2165  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  31.43 
 
 
724 aa  323  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000331924 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1981  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  31.29 
 
 
724 aa  323  8e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0489607  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1280  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  31.14 
 
 
724 aa  322  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.76264 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40910  ferripyoverdine receptor  32.32 
 
 
808 aa  322  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00205881  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  32.19 
 
 
821 aa  321  3e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1318  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  31.14 
 
 
724 aa  321  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45545  hitchhiker  0.0000000229507 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3182  TonB-dependent receptor family protein  29.87 
 
 
699 aa  320  6e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.223092 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2798  TonB-dependent receptor  30.57 
 
 
686 aa  319  1e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000816891  hitchhiker  0.0000136093 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2462  TonB-dependent siderophore receptor  33.24 
 
 
724 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5131  TonB-dependent siderophore receptor  32.3 
 
 
841 aa  315  1.9999999999999998e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.112839  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1481  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  30.14 
 
 
729 aa  311  2e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00382185  hitchhiker  0.00000310394 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1223  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  30.14 
 
 
729 aa  311  2e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000020204  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3182  TonB-dependent siderophore receptor  32.48 
 
 
735 aa  311  2e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2222  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  30.14 
 
 
729 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0115447  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01098  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  30.14 
 
 
729 aa  310  4e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.523255  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2499  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  30.14 
 
 
729 aa  310  4e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318087  unclonable  0.0000000283448 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1224  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  30.14 
 
 
729 aa  310  4e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000059752  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01106  hypothetical protein  30.14 
 
 
729 aa  310  4e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.689576  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2545  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 
729 aa  310  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00327648  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2583  TonB-dependent siderophore receptor  30.53 
 
 
748 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4481  TonB-dependent siderophore receptor  31.11 
 
 
824 aa  310  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207643  normal  0.919252 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0874  TonB-dependent siderophore receptor  32.12 
 
 
840 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.708566 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2025  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  30.14 
 
 
729 aa  307  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000237263  hitchhiker  0.0000045764 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02230  outer membrane ferripyoverdine receptor  32.03 
 
 
789 aa  305  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0288  TonB-dependent siderophore receptor  32.92 
 
 
765 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.566614  normal  0.515749 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0298  TonB-dependent siderophore receptor  33.06 
 
 
765 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496708  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2549  TonB-dependent siderophore receptor  28.51 
 
 
700 aa  302  1e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.133657  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0604  TonB-dependent siderophore receptor  30.45 
 
 
831 aa  301  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0272  TonB-dependent siderophore receptor  32.92 
 
 
765 aa  301  3e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199499 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00133  FhuE receptor  28.26 
 
 
697 aa  300  6e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.174299  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3328  TonB-dependent siderophore receptor  30.18 
 
 
822 aa  300  6e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.513174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>