More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1585 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1585  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 828 aa  1709    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927871  normal  0.219293 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3478  TonB-dependent siderophore receptor  57.51 
 
 		 825 aa  955    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3273  TonB-dependent siderophore receptor  43.68 
 
 		 826 aa  652    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480033  normal  0.0611881 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3666  TonB-dependent siderophore receptor  92.15 
 
 		 828 aa  1584    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.476594 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0874  TonB-dependent siderophore receptor  44.84 
 
 		 840 aa  664    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708566 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1848  TonB-dependent siderophore receptor  38.91 
 
 		 826 aa  558  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.817483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1678  TonB-dependent siderophore receptor  40.1 
 
 		 830 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.463262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2065  TonB-dependent siderophore receptor  40.23 
 
 		 809 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1961  TonB-dependent siderophore receptor  38.11 
 
 		 803 aa  525  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.281016  normal  0.90568 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2151  TonB-dependent siderophore receptor, putative  37.08 
 
 		 825 aa  521  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0848793  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4481  TonB-dependent siderophore receptor  36.06 
 
 		 824 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207643  normal  0.919252 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0759  TonB-dependent siderophore receptor  39.58 
 
 		 800 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0846  TonB-dependent siderophore receptor  36.39 
 
 		 841 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  38.54 
 
 		 812 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0860  TonB-dependent siderophore receptor  36.67 
 
 		 841 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2152  TonB-dependent siderophore receptor, putative  40 
 
 		 743 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101667  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1962  TonB-dependent siderophore receptor  39.86 
 
 		 746 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5131  TonB-dependent siderophore receptor  35.92 
 
 		 841 aa  477  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.112839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  37.46 
 
 		 821 aa  471  1.0000000000000001e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3601  TonB-dependent siderophore receptor  35.81 
 
 		 836 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.743224  normal  0.189186 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0879  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  39.51 
 
 		 713 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.871457  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3328  TonB-dependent siderophore receptor  35.47 
 
 		 822 aa  450  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.513174  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  35.8 
 
 		 814 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1879  TonB-dependent siderophore receptor  35.48 
 
 		 841 aa  452  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.432996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0604  TonB-dependent siderophore receptor  35 
 
 		 831 aa  449  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40910  ferripyoverdine receptor  35.74 
 
 		 808 aa  447  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00205881  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09340  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  38.89 
 
 		 720 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  34.83 
 
 		 844 aa  445  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0669  outer membrane ferric siderophore receptor  34.94 
 
 		 810 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.907614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  35.1 
 
 		 802 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1732  TonB-dependent siderophore receptor  32.14 
 
 		 864 aa  431  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0884061  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3374  TonB-dependent siderophore receptor  36.31 
 
 		 738 aa  429  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0588335  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5294  TonB-dependent siderophore receptor  36.31 
 
 		 727 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117694 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4993  TonB-dependent siderophore receptor  36.31 
 
 		 738 aa  429  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0250813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0677  TonB-dependent siderophore receptor  36.46 
 
 		 745 aa  425  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1823  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  36.6 
 
 		 747 aa  424  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09970  type I ferripyoverdine receptor, FpvB  35.25 
 
 		 802 aa  425  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  34.88 
 
 		 812 aa  416  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0793  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  36.36 
 
 		 719 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.454561  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0883  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  36.36 
 
 		 719 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  34.65 
 
 		 816 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2155  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  36.36 
 
 		 752 aa  412  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0845  TonB-dependent siderophore receptor  36.48 
 
 		 703 aa  412  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0329429  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  35.35 
 
 		 799 aa  409  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  34.75 
 
 		 803 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  33.87 
 
 		 787 aa  404  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0450384 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  33.25 
 
 		 815 aa  405  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  33.86 
 
 		 795 aa  396  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2462  TonB-dependent siderophore receptor  36.25 
 
 		 724 aa  395  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1449  TonB-dependent siderophore receptor  33.25 
 
 		 822 aa  392  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3692  TonB-dependent siderophore receptor  35.9 
 
 		 722 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1784  TonB-dependent siderophore receptor  35.04 
 
 		 717 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.306565  normal  0.0192687 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1171  TonB-dependent siderophore receptor  33.45 
 
 		 803 aa  392  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.963652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4072  TonB-dependent siderophore receptor  33.65 
 
 		 817 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44970  TonB-dependent siderophore receptor  32.97 
 
 		 798 aa  384  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259905  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2121  TonB-dependent siderophore receptor  33.84 
 
 		 722 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0440064  normal  0.552205 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0692  TonB-dependent siderophore receptor  33.29 
 
 		 801 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4082  TonB-dependent siderophore receptor  34.13 
 
 		 819 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671478  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17690  TonB-dependent siderophore receptor  32.31 
 
 		 806 aa  378  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  33.05 
 
 		 807 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02230  outer membrane ferripyoverdine receptor  32.93 
 
 		 789 aa  372  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4418  ferripyoverdine receptor  33.84 
 
 		 766 aa  348  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1440  TonB-dependent siderophore receptor  32.47 
 
 		 827 aa  347  6e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0400  ferripyoverdine receptor  33.29 
 
 		 744 aa  346  8.999999999999999e-94  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.736403  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2192  TonB-dependent siderophore receptor  34.03 
 
 		 725 aa  335  2e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0288  TonB-dependent siderophore receptor  33.11 
 
 		 765 aa  330  9e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.566614  normal  0.515749 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0586  TonB-dependent siderophore receptor  32.3 
 
 		 724 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0569  TonB-dependent siderophore receptor  31.78 
 
 		 724 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.931435 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0298  TonB-dependent siderophore receptor  32.76 
 
 		 765 aa  329  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3276  TonB-dependent siderophore receptor  31.23 
 
 		 840 aa  328  3e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130164 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1303  TonB-dependent siderophore receptor  33.66 
 
 		 724 aa  326  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0272  TonB-dependent siderophore receptor  32.85 
 
 		 765 aa  324  5e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199499 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0535  TonB-dependent siderophore receptor  31.5 
 
 		 725 aa  323  6e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0580  TonB-dependent siderophore receptor  31.21 
 
 		 725 aa  323  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  29.39 
 
 		 833 aa  311  2.9999999999999997e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1482  TonB-dependent siderophore receptor  31.64 
 
 		 723 aa  308  2.0000000000000002e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2583  TonB-dependent siderophore receptor  32.84 
 
 		 748 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1653  TonB-dependent siderophore receptor  30.4 
 
 		 741 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0605702  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3182  TonB-dependent siderophore receptor  32.57 
 
 		 735 aa  305  3.0000000000000004e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1326  TonB-dependent siderophore receptor  31.01 
 
 		 741 aa  303  8.000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.624497  normal  0.0240469 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1055  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  31.69 
 
 		 747 aa  303  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4640  TonB-dependent siderophore receptor  33.84 
 
 		 719 aa  303  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0269226  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3496  TonB-dependent siderophore receptor  32.03 
 
 		 723 aa  301  4e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1501  TonB-dependent siderophore receptor  29.78 
 
 		 732 aa  301  4e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.125781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2711  TonB-dependent siderophore receptor  30.11 
 
 		 741 aa  300  7e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2733  TonB-dependent siderophore receptor  30.38 
 
 		 747 aa  299  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000321343  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2812  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 		 747 aa  297  6e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215946  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4556  TonB-dependent siderophore receptor  31.6 
 
 		 720 aa  296  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1841  TonB-dependent siderophore receptor  30.6 
 
 		 696 aa  295  3e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000240616  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2414  TonB-dependent siderophore receptor  29.94 
 
 		 737 aa  294  5e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.486485  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3531  TonB-dependent siderophore receptor  30.81 
 
 		 740 aa  292  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313722  decreased coverage  0.00643483 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2539  TonB-dependent siderophore receptor  29.78 
 
 		 719 aa  292  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1981  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.51 
 
 		 724 aa  290  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0489607  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3410  TonB-dependent siderophore receptor  29.79 
 
 		 714 aa  289  1e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1318  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.43 
 
 		 724 aa  289  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45545  hitchhiker  0.0000000229507 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1280  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.37 
 
 		 724 aa  289  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.76264 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1303  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.37 
 
 		 724 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.11921  hitchhiker  0.00000000921463 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2165  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.23 
 
 		 724 aa  287  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000331924 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2025  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.72 
 
 		 729 aa  287  5.999999999999999e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000237263  hitchhiker  0.0000045764 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1223  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.44 
 
 		 729 aa  287  7e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000020204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>