More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3317 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  46.79 
 
 		 802 aa  705    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 816 aa  1675    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  46.01 
 
 		 799 aa  649    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  42.82 
 
 		 814 aa  631  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  41.51 
 
 		 815 aa  601  1e-170  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40910  ferripyoverdine receptor  42.75 
 
 		 808 aa  598  1e-169  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00205881  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1440  TonB-dependent siderophore receptor  43.02 
 
 		 827 aa  593  1e-168  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  41.6 
 
 		 812 aa  590  1e-167  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4072  TonB-dependent siderophore receptor  40.97 
 
 		 817 aa  586  1e-166  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1171  TonB-dependent siderophore receptor  41.97 
 
 		 803 aa  580  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.963652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  41.05 
 
 		 795 aa  577  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0692  TonB-dependent siderophore receptor  42.86 
 
 		 801 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44970  TonB-dependent siderophore receptor  42.82 
 
 		 798 aa  576  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259905  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02230  outer membrane ferripyoverdine receptor  40.41 
 
 		 789 aa  563  1.0000000000000001e-159  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1501  TonB-dependent siderophore receptor  44.08 
 
 		 732 aa  555  1e-156  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.125781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  40.49 
 
 		 807 aa  553  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17690  TonB-dependent siderophore receptor  40.67 
 
 		 806 aa  550  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4082  TonB-dependent siderophore receptor  40.8 
 
 		 819 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671478  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  40.61 
 
 		 803 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  39.48 
 
 		 833 aa  544  1e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  40.07 
 
 		 812 aa  519  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4418  ferripyoverdine receptor  42.82 
 
 		 766 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2583  TonB-dependent siderophore receptor  40.88 
 
 		 748 aa  498  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0669  outer membrane ferric siderophore receptor  36.94 
 
 		 810 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.907614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3496  TonB-dependent siderophore receptor  41.38 
 
 		 723 aa  488  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0604  TonB-dependent siderophore receptor  37.56 
 
 		 831 aa  483  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4481  TonB-dependent siderophore receptor  36.84 
 
 		 824 aa  485  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207643  normal  0.919252 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09970  type I ferripyoverdine receptor, FpvB  37.44 
 
 		 802 aa  478  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2121  TonB-dependent siderophore receptor  39.8 
 
 		 722 aa  476  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0440064  normal  0.552205 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2539  TonB-dependent siderophore receptor  39.09 
 
 		 753 aa  469  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2440  FhuE receptor  38.68 
 
 		 753 aa  468  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3276  TonB-dependent siderophore receptor  37.95 
 
 		 840 aa  468  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130164 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3692  TonB-dependent siderophore receptor  40 
 
 		 722 aa  466  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3328  TonB-dependent siderophore receptor  37.09 
 
 		 822 aa  464  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.513174  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3531  TonB-dependent siderophore receptor  37.34 
 
 		 740 aa  454  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313722  decreased coverage  0.00643483 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1653  TonB-dependent siderophore receptor  38.51 
 
 		 741 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0605702  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2711  TonB-dependent siderophore receptor  38.51 
 
 		 741 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1784  TonB-dependent siderophore receptor  39.64 
 
 		 717 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.306565  normal  0.0192687 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2414  TonB-dependent siderophore receptor  38.54 
 
 		 737 aa  451  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.486485  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3410  TonB-dependent siderophore receptor  38.28 
 
 		 714 aa  449  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2192  TonB-dependent siderophore receptor  39.18 
 
 		 725 aa  451  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2812  TonB-dependent siderophore receptor  37.7 
 
 		 747 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215946  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2733  TonB-dependent siderophore receptor  38.14 
 
 		 747 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000321343  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1055  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  38.23 
 
 		 747 aa  442  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3182  TonB-dependent receptor family protein  37.39 
 
 		 699 aa  444  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.223092 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4556  TonB-dependent siderophore receptor  38.71 
 
 		 720 aa  443  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0874  TonB-dependent siderophore receptor  35.48 
 
 		 840 aa  445  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708566 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1482  TonB-dependent siderophore receptor  38.53 
 
 		 723 aa  443  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2342  TonB-dependent siderophore receptor  36.58 
 
 		 693 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000105633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1841  TonB-dependent siderophore receptor  36.43 
 
 		 696 aa  443  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000240616  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2121  TonB-dependent siderophore receptor  36.43 
 
 		 693 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000812539  normal  0.443663 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2462  TonB-dependent siderophore receptor  37.79 
 
 		 724 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0137  TonB-dependent iron-siderophore receptor precursor  37.23 
 
 		 721 aa  440  9.999999999999999e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01098  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  37.57 
 
 		 729 aa  436  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.523255  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2545  TonB-dependent siderophore receptor  37.57 
 
 		 729 aa  437  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00327648  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01106  hypothetical protein  37.57 
 
 		 729 aa  436  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.689576  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1223  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  37.57 
 
 		 729 aa  436  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000020204  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1224  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  37.57 
 
 		 729 aa  436  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000059752  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2499  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  37.57 
 
 		 729 aa  436  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318087  unclonable  0.0000000283448 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1617  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  37.97 
 
 		 728 aa  438  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000544721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1481  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  37.57 
 
 		 729 aa  436  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00382185  hitchhiker  0.00000310394 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2025  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  37.29 
 
 		 729 aa  436  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000237263  hitchhiker  0.0000045764 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1326  TonB-dependent siderophore receptor  38.49 
 
 		 741 aa  436  1e-121  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.624497  normal  0.0240469 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2222  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  37.57 
 
 		 729 aa  436  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0115447  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1449  TonB-dependent siderophore receptor  34.7 
 
 		 822 aa  433  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1507  TonB-dependent siderophore receptor  38.54 
 
 		 737 aa  433  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.681157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0860  TonB-dependent siderophore receptor  33.96 
 
 		 841 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3478  TonB-dependent siderophore receptor  35.81 
 
 		 825 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  35.14 
 
 		 844 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1517  TonB-dependent siderophore receptor  37.77 
 
 		 737 aa  427  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0134645  normal  0.877607 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1082  TonB-dependent siderophore receptor  37.65 
 
 		 730 aa  422  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0846  TonB-dependent siderophore receptor  33.88 
 
 		 841 aa  425  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1303  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  36.48 
 
 		 724 aa  425  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.11921  hitchhiker  0.00000000921463 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2165  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  36.48 
 
 		 724 aa  426  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000331924 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0950  TonB-dependent siderophore receptor  38.02 
 
 		 723 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000152119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1451  TonB-dependent siderophore receptor  37.77 
 
 		 737 aa  426  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1981  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  36.34 
 
 		 724 aa  425  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0489607  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4535  TonB-dependent siderophore receptor  36.77 
 
 		 778 aa  425  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.453333 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3033  ferric alcaligin siderophore receptor  37.48 
 
 		 700 aa  420  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1318  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  36.19 
 
 		 724 aa  422  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45545  hitchhiker  0.0000000229507 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1280  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  36.34 
 
 		 724 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.76264 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3863  TonB-dependent siderophore receptor  37.75 
 
 		 733 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000567085  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0759  TonB-dependent siderophore receptor  34.24 
 
 		 800 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1879  TonB-dependent siderophore receptor  36.41 
 
 		 841 aa  417  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.432996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0988  TonB-dependent siderophore receptor  37.57 
 
 		 731 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00021194  normal  0.772446 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0952  TonB-dependent siderophore receptor  37.29 
 
 		 729 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000770151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3273  TonB-dependent siderophore receptor  35.12 
 
 		 826 aa  414  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480033  normal  0.0611881 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3666  TonB-dependent siderophore receptor  34.9 
 
 		 828 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.476594 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3182  TonB-dependent siderophore receptor  36.81 
 
 		 735 aa  415  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5131  TonB-dependent siderophore receptor  34.18 
 
 		 841 aa  415  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.112839  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2152  TonB-dependent siderophore receptor, putative  38.13 
 
 		 743 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101667  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1962  TonB-dependent siderophore receptor  37.41 
 
 		 746 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1585  TonB-dependent siderophore receptor  34.65 
 
 		 828 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927871  normal  0.219293 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2124  TonB-dependent siderophore receptor  35.74 
 
 		 722 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000170131  normal  0.221939 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2136  TonB-dependent siderophore receptor  35.89 
 
 		 722 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.503645  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0298  TonB-dependent siderophore receptor  36.73 
 
 		 765 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2339  TonB-dependent siderophore receptor  35.6 
 
 		 722 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000312883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0288  TonB-dependent siderophore receptor  36.64 
 
 		 765 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.566614  normal  0.515749 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3601  TonB-dependent siderophore receptor  33.88 
 
 		 836 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.743224  normal  0.189186 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  34.85 
 
 		 821 aa  398  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>