More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2583 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1326  TonB-dependent siderophore receptor  46.22 
 
 		 741 aa  653    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.624497  normal  0.0240469 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2583  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 748 aa  1537    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  42.36 
 
 		 802 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  40.88 
 
 		 816 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  39.81 
 
 		 814 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  39.29 
 
 		 815 aa  472  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2733  TonB-dependent siderophore receptor  36.38 
 
 		 747 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000321343  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1501  TonB-dependent siderophore receptor  37.52 
 
 		 732 aa  454  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.125781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2812  TonB-dependent siderophore receptor  35.57 
 
 		 747 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215946  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4418  ferripyoverdine receptor  36.51 
 
 		 766 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1653  TonB-dependent siderophore receptor  35.97 
 
 		 741 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0605702  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2711  TonB-dependent siderophore receptor  35.84 
 
 		 741 aa  445  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2414  TonB-dependent siderophore receptor  35.71 
 
 		 737 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.486485  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  38.71 
 
 		 803 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4072  TonB-dependent siderophore receptor  37.06 
 
 		 817 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1517  TonB-dependent siderophore receptor  36.58 
 
 		 737 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0134645  normal  0.877607 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3033  ferric alcaligin siderophore receptor  37.7 
 
 		 700 aa  435  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1440  TonB-dependent siderophore receptor  38.01 
 
 		 827 aa  435  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1451  TonB-dependent siderophore receptor  36.58 
 
 		 737 aa  434  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2440  FhuE receptor  35.39 
 
 		 753 aa  430  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4082  TonB-dependent siderophore receptor  37.64 
 
 		 819 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671478  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2539  TonB-dependent siderophore receptor  35.53 
 
 		 753 aa  432  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1482  TonB-dependent siderophore receptor  34.66 
 
 		 723 aa  430  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1507  TonB-dependent siderophore receptor  36.45 
 
 		 737 aa  432  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.681157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  37.48 
 
 		 799 aa  427  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0692  TonB-dependent siderophore receptor  37.96 
 
 		 801 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0669  outer membrane ferric siderophore receptor  37.91 
 
 		 810 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.907614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2342  TonB-dependent siderophore receptor  36.83 
 
 		 693 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000105633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2121  TonB-dependent siderophore receptor  36.54 
 
 		 693 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000812539  normal  0.443663 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1171  TonB-dependent siderophore receptor  39.67 
 
 		 803 aa  415  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.963652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1841  TonB-dependent siderophore receptor  36.43 
 
 		 696 aa  414  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000240616  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3410  TonB-dependent siderophore receptor  35.14 
 
 		 714 aa  409  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4481  TonB-dependent siderophore receptor  36.59 
 
 		 824 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207643  normal  0.919252 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3182  TonB-dependent receptor family protein  34.57 
 
 		 699 aa  409  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.223092 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40910  ferripyoverdine receptor  36.66 
 
 		 808 aa  408  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00205881  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3531  TonB-dependent siderophore receptor  35.18 
 
 		 740 aa  403  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313722  decreased coverage  0.00643483 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17690  TonB-dependent siderophore receptor  36.64 
 
 		 806 aa  402  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4556  TonB-dependent siderophore receptor  34.33 
 
 		 720 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3276  TonB-dependent siderophore receptor  38.54 
 
 		 840 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130164 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3182  TonB-dependent siderophore receptor  36.7 
 
 		 735 aa  402  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  35.56 
 
 		 795 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2192  TonB-dependent siderophore receptor  34.57 
 
 		 725 aa  396  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  35.72 
 
 		 812 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1055  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  34.98 
 
 		 747 aa  393  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44970  TonB-dependent siderophore receptor  35.49 
 
 		 798 aa  393  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259905  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  35.57 
 
 		 807 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3496  TonB-dependent siderophore receptor  34.93 
 
 		 723 aa  395  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2165  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  35.03 
 
 		 724 aa  392  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000331924 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1082  TonB-dependent siderophore receptor  36.38 
 
 		 730 aa  391  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0137  TonB-dependent iron-siderophore receptor precursor  32.51 
 
 		 721 aa  390  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1303  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  34.89 
 
 		 724 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.11921  hitchhiker  0.00000000921463 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1280  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  34.89 
 
 		 724 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.76264 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1981  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  34.89 
 
 		 724 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0489607  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  35.96 
 
 		 812 aa  389  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3692  TonB-dependent siderophore receptor  36.27 
 
 		 722 aa  388  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3863  TonB-dependent siderophore receptor  34.03 
 
 		 733 aa  387  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000567085  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02230  outer membrane ferripyoverdine receptor  35.19 
 
 		 789 aa  388  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2121  TonB-dependent siderophore receptor  35.06 
 
 		 722 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0440064  normal  0.552205 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1318  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  34.75 
 
 		 724 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45545  hitchhiker  0.0000000229507 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0298  TonB-dependent siderophore receptor  35.95 
 
 		 765 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0288  TonB-dependent siderophore receptor  35.47 
 
 		 765 aa  386  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.566614  normal  0.515749 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01098  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  34.14 
 
 		 729 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.523255  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2545  TonB-dependent siderophore receptor  34.14 
 
 		 729 aa  382  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00327648  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0272  TonB-dependent siderophore receptor  36.18 
 
 		 765 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199499 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01106  hypothetical protein  34.14 
 
 		 729 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.689576  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2499  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  34.14 
 
 		 729 aa  381  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318087  unclonable  0.0000000283448 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1223  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  34.14 
 
 		 729 aa  382  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000020204  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1617  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.73 
 
 		 728 aa  382  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000544721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09970  type I ferripyoverdine receptor, FpvB  36.22 
 
 		 802 aa  382  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1481  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  34.14 
 
 		 729 aa  382  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00382185  hitchhiker  0.00000310394 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2025  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.91 
 
 		 729 aa  381  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000237263  hitchhiker  0.0000045764 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1224  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  34.14 
 
 		 729 aa  381  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000059752  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  34.17 
 
 		 833 aa  378  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2222  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.73 
 
 		 729 aa  378  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0115447  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2124  TonB-dependent siderophore receptor  34.14 
 
 		 722 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000170131  normal  0.221939 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0950  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 723 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000152119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0952  TonB-dependent siderophore receptor  33.46 
 
 		 729 aa  376  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000770151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0988  TonB-dependent siderophore receptor  32.98 
 
 		 731 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00021194  normal  0.772446 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3097  TonB-dependent siderophore receptor  33.52 
 
 		 723 aa  369  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.582192  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2724  FhuE receptor  34 
 
 		 707 aa  369  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0603  TonB-dependent siderophore receptor  32.66 
 
 		 716 aa  368  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00298801  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3064  TonB-dependent siderophore receptor  32.81 
 
 		 712 aa  365  2e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2136  TonB-dependent siderophore receptor  34.49 
 
 		 722 aa  363  8e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.503645  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3717  TonB-dependent siderophore receptor  32.02 
 
 		 726 aa  363  8e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1784  TonB-dependent siderophore receptor  35.14 
 
 		 717 aa  362  1e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.306565  normal  0.0192687 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2462  TonB-dependent siderophore receptor  34.09 
 
 		 724 aa  361  3e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0759  TonB-dependent siderophore receptor  34.19 
 
 		 800 aa  360  5e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2339  TonB-dependent siderophore receptor  33.42 
 
 		 722 aa  360  7e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000312883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0540  TonB-dependent siderophore receptor  31.99 
 
 		 718 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0874  TonB-dependent siderophore receptor  35.5 
 
 		 840 aa  353  5e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708566 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5131  TonB-dependent siderophore receptor  34.62 
 
 		 841 aa  352  2e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.112839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0604  TonB-dependent siderophore receptor  33.7 
 
 		 831 aa  350  6e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1449  TonB-dependent siderophore receptor  34.33 
 
 		 822 aa  346  8e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0846  TonB-dependent siderophore receptor  33.16 
 
 		 841 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3478  TonB-dependent siderophore receptor  34.92 
 
 		 825 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0860  TonB-dependent siderophore receptor  33.16 
 
 		 841 aa  340  7e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  33.69 
 
 		 821 aa  339  9.999999999999999e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1879  TonB-dependent siderophore receptor  35.19 
 
 		 841 aa  338  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.432996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3328  TonB-dependent siderophore receptor  32.79 
 
 		 822 aa  337  3.9999999999999995e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.513174  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0845  TonB-dependent siderophore receptor  33.05 
 
 		 703 aa  334  3e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0329429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>