More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3692 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  53.86 
 
 		 812 aa  721    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3692  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 722 aa  1487    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1784  TonB-dependent siderophore receptor  89.47 
 
 		 717 aa  1342    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.306565  normal  0.0192687 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2462  TonB-dependent siderophore receptor  63.85 
 
 		 724 aa  912    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2121  TonB-dependent siderophore receptor  65.05 
 
 		 722 aa  952    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0440064  normal  0.552205 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09970  type I ferripyoverdine receptor, FpvB  46.72 
 
 		 802 aa  592  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0669  outer membrane ferric siderophore receptor  39.07 
 
 		 810 aa  495  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.907614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  40 
 
 		 816 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4481  TonB-dependent siderophore receptor  40.37 
 
 		 824 aa  465  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207643  normal  0.919252 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1449  TonB-dependent siderophore receptor  39.25 
 
 		 822 aa  457  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0874  TonB-dependent siderophore receptor  38.12 
 
 		 840 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708566 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  40.31 
 
 		 799 aa  445  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0759  TonB-dependent siderophore receptor  38.93 
 
 		 800 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  37.4 
 
 		 802 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  38.15 
 
 		 815 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4082  TonB-dependent siderophore receptor  37.96 
 
 		 819 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671478  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0604  TonB-dependent siderophore receptor  36.88 
 
 		 831 aa  423  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0692  TonB-dependent siderophore receptor  39.11 
 
 		 801 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1962  TonB-dependent siderophore receptor  37.22 
 
 		 746 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  37.48 
 
 		 814 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4418  ferripyoverdine receptor  38.35 
 
 		 766 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2152  TonB-dependent siderophore receptor, putative  36.6 
 
 		 743 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101667  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4072  TonB-dependent siderophore receptor  37.73 
 
 		 817 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3478  TonB-dependent siderophore receptor  37.17 
 
 		 825 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  38.34 
 
 		 803 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40910  ferripyoverdine receptor  36.66 
 
 		 808 aa  413  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00205881  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  36.72 
 
 		 812 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0860  TonB-dependent siderophore receptor  35.26 
 
 		 841 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0846  TonB-dependent siderophore receptor  35.72 
 
 		 841 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3328  TonB-dependent siderophore receptor  36.58 
 
 		 822 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.513174  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1961  TonB-dependent siderophore receptor  36.24 
 
 		 803 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.281016  normal  0.90568 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  36.57 
 
 		 807 aa  407  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1848  TonB-dependent siderophore receptor  35.94 
 
 		 826 aa  405  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.817483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  36.43 
 
 		 795 aa  403  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3273  TonB-dependent siderophore receptor  37.71 
 
 		 826 aa  405  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480033  normal  0.0611881 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44970  TonB-dependent siderophore receptor  37.41 
 
 		 798 aa  402  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259905  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2151  TonB-dependent siderophore receptor, putative  36.53 
 
 		 825 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0848793  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2711  TonB-dependent siderophore receptor  36.51 
 
 		 741 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17690  TonB-dependent siderophore receptor  36.59 
 
 		 806 aa  401  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1653  TonB-dependent siderophore receptor  36.51 
 
 		 741 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0605702  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1440  TonB-dependent siderophore receptor  37.64 
 
 		 827 aa  399  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1501  TonB-dependent siderophore receptor  36.07 
 
 		 732 aa  397  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.125781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2812  TonB-dependent siderophore receptor  36.16 
 
 		 747 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215946  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1171  TonB-dependent siderophore receptor  37.35 
 
 		 803 aa  393  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.963652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2733  TonB-dependent siderophore receptor  35.85 
 
 		 747 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000321343  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02230  outer membrane ferripyoverdine receptor  37.29 
 
 		 789 aa  393  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1585  TonB-dependent siderophore receptor  35.9 
 
 		 828 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927871  normal  0.219293 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1223  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  35.75 
 
 		 729 aa  389  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000020204  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1481  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  35.75 
 
 		 729 aa  389  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00382185  hitchhiker  0.00000310394 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2414  TonB-dependent siderophore receptor  35.33 
 
 		 737 aa  390  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.486485  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1678  TonB-dependent siderophore receptor  35.89 
 
 		 830 aa  392  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.463262  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01098  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  35.75 
 
 		 729 aa  389  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.523255  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2545  TonB-dependent siderophore receptor  35.62 
 
 		 729 aa  388  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00327648  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1841  TonB-dependent siderophore receptor  36.18 
 
 		 696 aa  387  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000240616  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1224  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  35.75 
 
 		 729 aa  389  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000059752  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2499  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  35.75 
 
 		 729 aa  389  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318087  unclonable  0.0000000283448 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01106  hypothetical protein  35.75 
 
 		 729 aa  389  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.689576  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1879  TonB-dependent siderophore receptor  36.32 
 
 		 841 aa  389  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.432996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2583  TonB-dependent siderophore receptor  36.27 
 
 		 748 aa  388  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2222  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  35.49 
 
 		 729 aa  386  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0115447  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0400  ferripyoverdine receptor  34.24 
 
 		 744 aa  387  1e-106  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.736403  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2025  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  35.75 
 
 		 729 aa  388  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000237263  hitchhiker  0.0000045764 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  34.41 
 
 		 844 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3496  TonB-dependent siderophore receptor  35 
 
 		 723 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  36.2 
 
 		 833 aa  379  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2440  FhuE receptor  33.68 
 
 		 753 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0845  TonB-dependent siderophore receptor  35.62 
 
 		 703 aa  382  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0329429  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2539  TonB-dependent siderophore receptor  34.21 
 
 		 753 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0879  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  36.14 
 
 		 713 aa  379  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.871457  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  35.92 
 
 		 821 aa  378  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2121  TonB-dependent siderophore receptor  36.04 
 
 		 693 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000812539  normal  0.443663 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3666  TonB-dependent siderophore receptor  36.41 
 
 		 828 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.476594 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2342  TonB-dependent siderophore receptor  35.6 
 
 		 693 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000105633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1482  TonB-dependent siderophore receptor  33.56 
 
 		 723 aa  374  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2192  TonB-dependent siderophore receptor  37.38 
 
 		 725 aa  373  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1617  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  35.39 
 
 		 728 aa  375  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000544721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1318  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  35.35 
 
 		 724 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45545  hitchhiker  0.0000000229507 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2065  TonB-dependent siderophore receptor  34.97 
 
 		 809 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1981  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  35.17 
 
 		 724 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0489607  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1451  TonB-dependent siderophore receptor  36.32 
 
 		 737 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1517  TonB-dependent siderophore receptor  36.18 
 
 		 737 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0134645  normal  0.877607 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2165  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  35.12 
 
 		 724 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000331924 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1507  TonB-dependent siderophore receptor  36.36 
 
 		 737 aa  370  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.681157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1055  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  35.53 
 
 		 747 aa  369  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1303  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  35.02 
 
 		 724 aa  369  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.11921  hitchhiker  0.00000000921463 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4556  TonB-dependent siderophore receptor  36.36 
 
 		 720 aa  366  1e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3182  TonB-dependent siderophore receptor  35.39 
 
 		 735 aa  365  2e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1280  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  34.88 
 
 		 724 aa  364  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.76264 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2155  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  35.32 
 
 		 752 aa  363  7.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0677  TonB-dependent siderophore receptor  33.83 
 
 		 745 aa  362  9e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3182  TonB-dependent receptor family protein  33.02 
 
 		 699 aa  362  2e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.223092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3374  TonB-dependent siderophore receptor  34.52 
 
 		 738 aa  361  3e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0588335  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09340  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  34.93 
 
 		 720 aa  361  3e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4993  TonB-dependent siderophore receptor  34.52 
 
 		 738 aa  361  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0250813  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3033  ferric alcaligin siderophore receptor  35.65 
 
 		 700 aa  360  5e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5294  TonB-dependent siderophore receptor  34.52 
 
 		 727 aa  360  5e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117694 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0883  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  34.84 
 
 		 719 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0793  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  34.84 
 
 		 719 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.454561  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1326  TonB-dependent siderophore receptor  34.03 
 
 		 741 aa  355  1e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.624497  normal  0.0240469 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0298  TonB-dependent siderophore receptor  34.48 
 
 		 765 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496708  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>