More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3544 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0846  TonB-dependent siderophore receptor  61.56 
 
 		 841 aa  1072    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 844 aa  1737    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0860  TonB-dependent siderophore receptor  61.99 
 
 		 841 aa  1078    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1732  TonB-dependent siderophore receptor  39.43 
 
 		 864 aa  568  1e-160  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0884061  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1961  TonB-dependent siderophore receptor  39.68 
 
 		 803 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.281016  normal  0.90568 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2151  TonB-dependent siderophore receptor, putative  38.25 
 
 		 825 aa  530  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0848793  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3601  TonB-dependent siderophore receptor  37.32 
 
 		 836 aa  522  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.743224  normal  0.189186 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5131  TonB-dependent siderophore receptor  37.39 
 
 		 841 aa  511  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.112839  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  36.59 
 
 		 812 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  37.56 
 
 		 821 aa  490  1e-137  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4481  TonB-dependent siderophore receptor  35.94 
 
 		 824 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207643  normal  0.919252 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0874  TonB-dependent siderophore receptor  35.89 
 
 		 840 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708566 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3478  TonB-dependent siderophore receptor  36.46 
 
 		 825 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1962  TonB-dependent siderophore receptor  38.28 
 
 		 746 aa  463  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0759  TonB-dependent siderophore receptor  36.78 
 
 		 800 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  36.71 
 
 		 802 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3273  TonB-dependent siderophore receptor  35.87 
 
 		 826 aa  460  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480033  normal  0.0611881 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2152  TonB-dependent siderophore receptor, putative  37.29 
 
 		 743 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101667  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1678  TonB-dependent siderophore receptor  36.49 
 
 		 830 aa  458  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.463262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09970  type I ferripyoverdine receptor, FpvB  35.21 
 
 		 802 aa  452  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1585  TonB-dependent siderophore receptor  34.83 
 
 		 828 aa  445  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927871  normal  0.219293 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4082  TonB-dependent siderophore receptor  35.18 
 
 		 819 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671478  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4072  TonB-dependent siderophore receptor  34.9 
 
 		 817 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  33.57 
 
 		 807 aa  429  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1848  TonB-dependent siderophore receptor  34.81 
 
 		 826 aa  427  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.817483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  35.14 
 
 		 816 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  34.93 
 
 		 799 aa  424  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3666  TonB-dependent siderophore receptor  33.79 
 
 		 828 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.476594 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  34.92 
 
 		 803 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0669  outer membrane ferric siderophore receptor  33.65 
 
 		 810 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.907614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0604  TonB-dependent siderophore receptor  33.9 
 
 		 831 aa  417  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1823  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  36.16 
 
 		 747 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3374  TonB-dependent siderophore receptor  35.96 
 
 		 738 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0588335  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5294  TonB-dependent siderophore receptor  36.33 
 
 		 727 aa  415  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117694 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4993  TonB-dependent siderophore receptor  35.96 
 
 		 738 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0250813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02230  outer membrane ferripyoverdine receptor  33.29 
 
 		 789 aa  411  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0879  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  35.15 
 
 		 713 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.871457  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2065  TonB-dependent siderophore receptor  34.75 
 
 		 809 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0793  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  35.93 
 
 		 719 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.454561  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0883  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  35.93 
 
 		 719 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17690  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 806 aa  407  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3328  TonB-dependent siderophore receptor  33.78 
 
 		 822 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.513174  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2155  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  34.72 
 
 		 752 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  33.05 
 
 		 815 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  32.87 
 
 		 812 aa  408  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0677  TonB-dependent siderophore receptor  35.9 
 
 		 745 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44970  TonB-dependent siderophore receptor  33.14 
 
 		 798 aa  405  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259905  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  32.81 
 
 		 795 aa  405  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1449  TonB-dependent siderophore receptor  33.25 
 
 		 822 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09340  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  35.26 
 
 		 720 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2121  TonB-dependent siderophore receptor  35.24 
 
 		 722 aa  399  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0440064  normal  0.552205 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  34.17 
 
 		 814 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40910  ferripyoverdine receptor  32.69 
 
 		 808 aa  389  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00205881  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0845  TonB-dependent siderophore receptor  34.19 
 
 		 703 aa  386  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0329429  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1440  TonB-dependent siderophore receptor  33.14 
 
 		 827 aa  387  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3692  TonB-dependent siderophore receptor  34.41 
 
 		 722 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2462  TonB-dependent siderophore receptor  35.95 
 
 		 724 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  31.1 
 
 		 833 aa  375  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1879  TonB-dependent siderophore receptor  32.2 
 
 		 841 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.432996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2076  TonB-dependent receptor  39.19 
 
 		 533 aa  368  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1784  TonB-dependent siderophore receptor  33.38 
 
 		 717 aa  365  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.306565  normal  0.0192687 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0692  TonB-dependent siderophore receptor  30.34 
 
 		 801 aa  360  8e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0400  ferripyoverdine receptor  33.47 
 
 		 744 aa  355  2e-96  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.736403  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  31.66 
 
 		 787 aa  351  3e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0450384 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1171  TonB-dependent siderophore receptor  31.45 
 
 		 803 aa  347  5e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.963652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4418  ferripyoverdine receptor  32.56 
 
 		 766 aa  342  2e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1501  TonB-dependent siderophore receptor  33.85 
 
 		 732 aa  341  2.9999999999999998e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.125781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0288  TonB-dependent siderophore receptor  33.29 
 
 		 765 aa  336  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.566614  normal  0.515749 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2583  TonB-dependent siderophore receptor  33.95 
 
 		 748 aa  332  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0272  TonB-dependent siderophore receptor  33.15 
 
 		 765 aa  330  6e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199499 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0298  TonB-dependent siderophore receptor  33.2 
 
 		 765 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3276  TonB-dependent siderophore receptor  32.05 
 
 		 840 aa  328  4.0000000000000003e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130164 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1082  TonB-dependent siderophore receptor  33.8 
 
 		 730 aa  323  7e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0586  TonB-dependent siderophore receptor  32.82 
 
 		 724 aa  321  3e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3496  TonB-dependent siderophore receptor  32.92 
 
 		 723 aa  319  1e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1482  TonB-dependent siderophore receptor  31.85 
 
 		 723 aa  318  3e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1326  TonB-dependent siderophore receptor  31.42 
 
 		 741 aa  312  2e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.624497  normal  0.0240469 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4556  TonB-dependent siderophore receptor  31.96 
 
 		 720 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3182  TonB-dependent siderophore receptor  32.73 
 
 		 735 aa  307  5.0000000000000004e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2440  FhuE receptor  31.5 
 
 		 753 aa  304  4.0000000000000003e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0569  TonB-dependent siderophore receptor  32.03 
 
 		 724 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.931435 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4640  TonB-dependent siderophore receptor  31.49 
 
 		 719 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0269226  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4535  TonB-dependent siderophore receptor  32.81 
 
 		 778 aa  304  4.0000000000000003e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.453333 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2539  TonB-dependent siderophore receptor  31.5 
 
 		 753 aa  303  8.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0535  TonB-dependent siderophore receptor  31.75 
 
 		 725 aa  300  9e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0580  TonB-dependent siderophore receptor  31.32 
 
 		 725 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2025  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.66 
 
 		 729 aa  295  3e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000237263  hitchhiker  0.0000045764 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0658  secretin/TonB  38.48 
 
 		 507 aa  294  4e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1055  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  30.28 
 
 		 747 aa  293  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1223  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.58 
 
 		 729 aa  291  3e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000020204  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1481  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.58 
 
 		 729 aa  291  3e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00382185  hitchhiker  0.00000310394 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01098  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.58 
 
 		 729 aa  290  6e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.523255  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2499  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.58 
 
 		 729 aa  290  6e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318087  unclonable  0.0000000283448 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01106  hypothetical protein  29.58 
 
 		 729 aa  290  6e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.689576  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1224  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.58 
 
 		 729 aa  290  6e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000059752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2545  TonB-dependent siderophore receptor  29.44 
 
 		 729 aa  290  9e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00327648  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1303  TonB-dependent siderophore receptor  30.3 
 
 		 724 aa  290  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3410  TonB-dependent siderophore receptor  31.94 
 
 		 714 aa  289  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2222  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.44 
 
 		 729 aa  289  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0115447  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2121  TonB-dependent siderophore receptor  30.06 
 
 		 693 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000812539  normal  0.443663 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>