More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2076 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1732  TonB-dependent siderophore receptor  99.62 
 
 		 864 aa  1102    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0884061  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2076  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 533 aa  1097    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0661  TonB-dependent receptor  62.3 
 
 		 379 aa  457  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0860  TonB-dependent siderophore receptor  39.41 
 
 		 841 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  39.19 
 
 		 844 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0846  TonB-dependent siderophore receptor  37.64 
 
 		 841 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5131  TonB-dependent siderophore receptor  39.45 
 
 		 841 aa  333  5e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.112839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3601  TonB-dependent siderophore receptor  37.61 
 
 		 836 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.743224  normal  0.189186 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3374  TonB-dependent siderophore receptor  34.88 
 
 		 738 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0588335  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4993  TonB-dependent siderophore receptor  34.88 
 
 		 738 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0250813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09340  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  35.11 
 
 		 720 aa  295  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5294  TonB-dependent siderophore receptor  34.88 
 
 		 727 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117694 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0879  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  34.76 
 
 		 713 aa  293  5e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.871457  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3273  TonB-dependent siderophore receptor  34.81 
 
 		 826 aa  291  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480033  normal  0.0611881 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  34.74 
 
 		 821 aa  289  1e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0677  TonB-dependent siderophore receptor  34.63 
 
 		 745 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0874  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 840 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708566 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0883  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  33.46 
 
 		 719 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0793  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  33.46 
 
 		 719 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.454561  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2155  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  33.27 
 
 		 752 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1961  TonB-dependent siderophore receptor  34.62 
 
 		 803 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.281016  normal  0.90568 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1823  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  33.09 
 
 		 747 aa  271  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4481  TonB-dependent siderophore receptor  33.09 
 
 		 824 aa  270  7e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207643  normal  0.919252 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2151  TonB-dependent siderophore receptor, putative  33.52 
 
 		 825 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0848793  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3478  TonB-dependent siderophore receptor  31.37 
 
 		 825 aa  259  8e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2152  TonB-dependent siderophore receptor, putative  33.46 
 
 		 743 aa  259  9e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101667  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1962  TonB-dependent siderophore receptor  33.27 
 
 		 746 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0669  outer membrane ferric siderophore receptor  31.49 
 
 		 810 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.907614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0759  TonB-dependent siderophore receptor  32.9 
 
 		 800 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1585  TonB-dependent siderophore receptor  31.15 
 
 		 828 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927871  normal  0.219293 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0845  TonB-dependent siderophore receptor  31.73 
 
 		 703 aa  247  3e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0329429  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3666  TonB-dependent siderophore receptor  31.57 
 
 		 828 aa  243  6e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.476594 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1678  TonB-dependent siderophore receptor  32.3 
 
 		 830 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.463262  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  31.2 
 
 		 812 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0604  TonB-dependent siderophore receptor  30.42 
 
 		 831 aa  228  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1848  TonB-dependent siderophore receptor  30.98 
 
 		 826 aa  228  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.817483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2065  TonB-dependent siderophore receptor  31.99 
 
 		 809 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2121  TonB-dependent siderophore receptor  30.04 
 
 		 722 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0440064  normal  0.552205 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1879  TonB-dependent siderophore receptor  30.25 
 
 		 841 aa  218  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.432996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09970  type I ferripyoverdine receptor, FpvB  29.11 
 
 		 802 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1171  TonB-dependent siderophore receptor  32.89 
 
 		 803 aa  217  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.963652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1784  TonB-dependent siderophore receptor  30.18 
 
 		 717 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.306565  normal  0.0192687 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3692  TonB-dependent siderophore receptor  30.12 
 
 		 722 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3328  TonB-dependent siderophore receptor  30.02 
 
 		 822 aa  211  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.513174  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  30.33 
 
 		 816 aa  211  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  30.59 
 
 		 814 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  30.95 
 
 		 802 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1082  TonB-dependent siderophore receptor  32.61 
 
 		 730 aa  204  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4072  TonB-dependent siderophore receptor  29.87 
 
 		 817 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2462  TonB-dependent siderophore receptor  29.11 
 
 		 724 aa  201  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1449  TonB-dependent siderophore receptor  29.04 
 
 		 822 aa  200  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  31 
 
 		 803 aa  199  9e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40910  ferripyoverdine receptor  29.5 
 
 		 808 aa  198  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00205881  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4082  TonB-dependent siderophore receptor  31.64 
 
 		 819 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671478  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  29.52 
 
 		 799 aa  194  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0952  TonB-dependent siderophore receptor  27.21 
 
 		 729 aa  191  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000770151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  29.78 
 
 		 787 aa  191  4e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0450384 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2121  TonB-dependent siderophore receptor  29.42 
 
 		 693 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000812539  normal  0.443663 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2342  TonB-dependent siderophore receptor  29.18 
 
 		 693 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000105633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4418  ferripyoverdine receptor  29.31 
 
 		 766 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  29.8 
 
 		 815 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2124  TonB-dependent siderophore receptor  27.42 
 
 		 722 aa  186  8e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000170131  normal  0.221939 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0692  TonB-dependent siderophore receptor  29.89 
 
 		 801 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0988  TonB-dependent siderophore receptor  26.91 
 
 		 731 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00021194  normal  0.772446 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1841  TonB-dependent siderophore receptor  28.36 
 
 		 696 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000240616  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0658  secretin/TonB  54.71 
 
 		 507 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1440  TonB-dependent siderophore receptor  28.7 
 
 		 827 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1501  TonB-dependent siderophore receptor  28.68 
 
 		 732 aa  180  4.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.125781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0288  TonB-dependent siderophore receptor  29.72 
 
 		 765 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.566614  normal  0.515749 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0272  TonB-dependent siderophore receptor  30.07 
 
 		 765 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199499 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0298  TonB-dependent siderophore receptor  29.84 
 
 		 765 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0586  TonB-dependent siderophore receptor  28.79 
 
 		 724 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0950  TonB-dependent siderophore receptor  28.26 
 
 		 723 aa  179  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000152119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2339  TonB-dependent siderophore receptor  27.78 
 
 		 722 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000312883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2583  TonB-dependent siderophore receptor  29.87 
 
 		 748 aa  176  7e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3863  TonB-dependent siderophore receptor  27.37 
 
 		 733 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000567085  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2440  FhuE receptor  29.15 
 
 		 753 aa  176  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0580  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 725 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2136  TonB-dependent siderophore receptor  27.6 
 
 		 722 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.503645  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2539  TonB-dependent siderophore receptor  29.15 
 
 		 753 aa  173  5.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1326  TonB-dependent siderophore receptor  28.6 
 
 		 741 aa  172  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.624497  normal  0.0240469 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0569  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 724 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.931435 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3496  TonB-dependent siderophore receptor  28.1 
 
 		 723 aa  172  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3410  TonB-dependent siderophore receptor  30.08 
 
 		 714 aa  172  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0535  TonB-dependent siderophore receptor  28.38 
 
 		 725 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4640  TonB-dependent siderophore receptor  30.28 
 
 		 719 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0269226  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1303  TonB-dependent siderophore receptor  32.49 
 
 		 724 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  27.26 
 
 		 795 aa  171  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2192  TonB-dependent siderophore receptor  30.08 
 
 		 725 aa  168  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1653  TonB-dependent siderophore receptor  27.39 
 
 		 741 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0605702  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  28.47 
 
 		 807 aa  166  9e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17690  TonB-dependent siderophore receptor  27.49 
 
 		 806 aa  166  9e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  28.78 
 
 		 812 aa  166  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2711  TonB-dependent siderophore receptor  27.21 
 
 		 741 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3717  TonB-dependent siderophore receptor  27.58 
 
 		 726 aa  164  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3097  TonB-dependent siderophore receptor  27.41 
 
 		 723 aa  162  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.582192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0540  TonB-dependent siderophore receptor  28.33 
 
 		 718 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0137  TonB-dependent iron-siderophore receptor precursor  27.04 
 
 		 721 aa  160  4e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1303  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  27.21 
 
 		 724 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.11921  hitchhiker  0.00000000921463 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1280  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  27.21 
 
 		 724 aa  160  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.76264 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>