More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0661 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0661  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 379 aa  778    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1732  TonB-dependent siderophore receptor  62.47 
 
 		 864 aa  462  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0884061  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2076  TonB-dependent receptor  62.3 
 
 		 533 aa  457  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  41.64 
 
 		 844 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0860  TonB-dependent siderophore receptor  41.74 
 
 		 841 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3601  TonB-dependent siderophore receptor  44.2 
 
 		 836 aa  258  9e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.743224  normal  0.189186 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5131  TonB-dependent siderophore receptor  43.75 
 
 		 841 aa  254  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.112839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0846  TonB-dependent siderophore receptor  39.29 
 
 		 841 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  43.37 
 
 		 821 aa  236  5.0000000000000005e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1823  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  38.58 
 
 		 747 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2121  TonB-dependent siderophore receptor  36.5 
 
 		 722 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0440064  normal  0.552205 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3374  TonB-dependent siderophore receptor  37.69 
 
 		 738 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0588335  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5294  TonB-dependent siderophore receptor  37.69 
 
 		 727 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117694 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4993  TonB-dependent siderophore receptor  37.69 
 
 		 738 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0250813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0879  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  38.35 
 
 		 713 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.871457  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0874  TonB-dependent siderophore receptor  37.1 
 
 		 840 aa  215  9e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708566 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0677  TonB-dependent siderophore receptor  37.28 
 
 		 745 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3273  TonB-dependent siderophore receptor  36.56 
 
 		 826 aa  213  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480033  normal  0.0611881 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09340  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  39.35 
 
 		 720 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0759  TonB-dependent siderophore receptor  40 
 
 		 800 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2155  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  37.39 
 
 		 752 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0793  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  37.39 
 
 		 719 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.454561  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0883  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  37.39 
 
 		 719 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3478  TonB-dependent siderophore receptor  34.62 
 
 		 825 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1678  TonB-dependent siderophore receptor  39.81 
 
 		 830 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.463262  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2151  TonB-dependent siderophore receptor, putative  39.51 
 
 		 825 aa  209  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0848793  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0669  outer membrane ferric siderophore receptor  37.66 
 
 		 810 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.907614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1961  TonB-dependent siderophore receptor  36.68 
 
 		 803 aa  202  9e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.281016  normal  0.90568 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1585  TonB-dependent siderophore receptor  36.39 
 
 		 828 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927871  normal  0.219293 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3666  TonB-dependent siderophore receptor  37.26 
 
 		 828 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.476594 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3692  TonB-dependent siderophore receptor  36.71 
 
 		 722 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4481  TonB-dependent siderophore receptor  34.39 
 
 		 824 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207643  normal  0.919252 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1784  TonB-dependent siderophore receptor  34.43 
 
 		 717 aa  193  5e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.306565  normal  0.0192687 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2152  TonB-dependent siderophore receptor, putative  37.31 
 
 		 743 aa  192  6e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101667  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2462  TonB-dependent siderophore receptor  36.7 
 
 		 724 aa  192  8e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1962  TonB-dependent siderophore receptor  37.9 
 
 		 746 aa  190  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  32.75 
 
 		 812 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0604  TonB-dependent siderophore receptor  34.48 
 
 		 831 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1171  TonB-dependent siderophore receptor  37.9 
 
 		 803 aa  183  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.963652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1848  TonB-dependent siderophore receptor  36.91 
 
 		 826 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.817483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1879  TonB-dependent siderophore receptor  33.69 
 
 		 841 aa  180  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.432996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3328  TonB-dependent siderophore receptor  34.49 
 
 		 822 aa  179  4.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.513174  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2065  TonB-dependent siderophore receptor  38.15 
 
 		 809 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  36.09 
 
 		 802 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09970  type I ferripyoverdine receptor, FpvB  35.37 
 
 		 802 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0845  TonB-dependent siderophore receptor  32.64 
 
 		 703 aa  177  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0329429  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0298  TonB-dependent siderophore receptor  36.39 
 
 		 765 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4640  TonB-dependent siderophore receptor  37.73 
 
 		 719 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0269226  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  33.82 
 
 		 816 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0288  TonB-dependent siderophore receptor  35.44 
 
 		 765 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.566614  normal  0.515749 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0272  TonB-dependent siderophore receptor  35.13 
 
 		 765 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199499 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1440  TonB-dependent siderophore receptor  33.65 
 
 		 827 aa  168  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1449  TonB-dependent siderophore receptor  32.45 
 
 		 822 aa  168  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4082  TonB-dependent siderophore receptor  36.6 
 
 		 819 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671478  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4418  ferripyoverdine receptor  34.23 
 
 		 766 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  33.53 
 
 		 803 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  33.97 
 
 		 815 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0580  TonB-dependent siderophore receptor  34.85 
 
 		 725 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0952  TonB-dependent siderophore receptor  31.36 
 
 		 729 aa  160  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000770151  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0535  TonB-dependent siderophore receptor  34.85 
 
 		 725 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0569  TonB-dependent siderophore receptor  34.53 
 
 		 724 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.931435 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  32.83 
 
 		 814 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1303  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  31.92 
 
 		 724 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.11921  hitchhiker  0.00000000921463 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1303  TonB-dependent siderophore receptor  32.93 
 
 		 724 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1318  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  31.92 
 
 		 724 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45545  hitchhiker  0.0000000229507 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1280  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  31.92 
 
 		 724 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.76264 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1981  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  31.92 
 
 		 724 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0489607  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2165  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  31.92 
 
 		 724 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000331924 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0988  TonB-dependent siderophore receptor  31.07 
 
 		 731 aa  157  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00021194  normal  0.772446 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4072  TonB-dependent siderophore receptor  33.03 
 
 		 817 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0586  TonB-dependent siderophore receptor  33.23 
 
 		 724 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1482  TonB-dependent siderophore receptor  35.41 
 
 		 723 aa  153  5e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1082  TonB-dependent siderophore receptor  36.98 
 
 		 730 aa  153  5e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2025  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  32.94 
 
 		 729 aa  151  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000237263  hitchhiker  0.0000045764 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0950  TonB-dependent siderophore receptor  31.81 
 
 		 723 aa  150  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000152119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2124  TonB-dependent siderophore receptor  33.02 
 
 		 722 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000170131  normal  0.221939 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2583  TonB-dependent siderophore receptor  32.38 
 
 		 748 aa  149  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  33.87 
 
 		 787 aa  149  7e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0450384 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1223  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  32.64 
 
 		 729 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000020204  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01098  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  32.34 
 
 		 729 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.523255  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3863  TonB-dependent siderophore receptor  31.81 
 
 		 733 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000567085  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01106  hypothetical protein  32.34 
 
 		 729 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.689576  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0692  TonB-dependent siderophore receptor  32.27 
 
 		 801 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1481  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  32.64 
 
 		 729 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00382185  hitchhiker  0.00000310394 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2499  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  32.34 
 
 		 729 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318087  unclonable  0.0000000283448 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1224  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  32.34 
 
 		 729 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000059752  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  31.07 
 
 		 799 aa  147  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2222  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  32.64 
 
 		 729 aa  147  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0115447  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2545  TonB-dependent siderophore receptor  32.34 
 
 		 729 aa  146  6e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00327648  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40910  ferripyoverdine receptor  29.17 
 
 		 808 aa  146  6e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00205881  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2539  TonB-dependent siderophore receptor  33.23 
 
 		 719 aa  145  9e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4286  TonB-dependent siderophore receptor  31.21 
 
 		 728 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0114  TonB-dependent siderophore receptor  31.5 
 
 		 728 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4426  TonB-dependent siderophore receptor  31.5 
 
 		 728 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4556  TonB-dependent siderophore receptor  32.25 
 
 		 720 aa  144  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3410  TonB-dependent siderophore receptor  33.77 
 
 		 714 aa  144  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1841  TonB-dependent siderophore receptor  31.6 
 
 		 696 aa  144  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000240616  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3531  TonB-dependent siderophore receptor  31.38 
 
 		 740 aa  143  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313722  decreased coverage  0.00643483 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0873  outer membrane receptor for Fe  30.09 
 
 		 712 aa  143  5e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.474088  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2136  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 722 aa  143  6e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.503645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>