More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0669 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0669  outer membrane ferric siderophore receptor  100 
 
 		 810 aa  1678    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.907614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09970  type I ferripyoverdine receptor, FpvB  42.71 
 
 		 802 aa  591  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  41.85 
 
 		 812 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  40.43 
 
 		 802 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2121  TonB-dependent siderophore receptor  40.59 
 
 		 722 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0440064  normal  0.552205 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1784  TonB-dependent siderophore receptor  39.94 
 
 		 717 aa  498  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.306565  normal  0.0192687 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3692  TonB-dependent siderophore receptor  39.07 
 
 		 722 aa  495  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0759  TonB-dependent siderophore receptor  37.7 
 
 		 800 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0874  TonB-dependent siderophore receptor  37.85 
 
 		 840 aa  489  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  36.94 
 
 		 816 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1449  TonB-dependent siderophore receptor  36.42 
 
 		 822 aa  484  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2462  TonB-dependent siderophore receptor  39.58 
 
 		 724 aa  484  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4481  TonB-dependent siderophore receptor  36.31 
 
 		 824 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207643  normal  0.919252 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  36.73 
 
 		 814 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0604  TonB-dependent siderophore receptor  36.01 
 
 		 831 aa  473  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  37.84 
 
 		 799 aa  472  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0692  TonB-dependent siderophore receptor  38.42 
 
 		 801 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3328  TonB-dependent siderophore receptor  35.84 
 
 		 822 aa  460  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.513174  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  36.61 
 
 		 815 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3478  TonB-dependent siderophore receptor  35.57 
 
 		 825 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3273  TonB-dependent siderophore receptor  36.58 
 
 		 826 aa  453  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480033  normal  0.0611881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4082  TonB-dependent siderophore receptor  36.79 
 
 		 819 aa  452  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671478  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  37.09 
 
 		 803 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17690  TonB-dependent siderophore receptor  36.73 
 
 		 806 aa  450  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40910  ferripyoverdine receptor  35.1 
 
 		 808 aa  448  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00205881  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4072  TonB-dependent siderophore receptor  36.02 
 
 		 817 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1171  TonB-dependent siderophore receptor  37.61 
 
 		 803 aa  442  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.963652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  35.71 
 
 		 795 aa  443  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1879  TonB-dependent siderophore receptor  36.28 
 
 		 841 aa  440  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.432996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1585  TonB-dependent siderophore receptor  34.94 
 
 		 828 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927871  normal  0.219293 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3666  TonB-dependent siderophore receptor  35.15 
 
 		 828 aa  439  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.476594 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0860  TonB-dependent siderophore receptor  34.71 
 
 		 841 aa  439  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1678  TonB-dependent siderophore receptor  36.27 
 
 		 830 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.463262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  34.59 
 
 		 812 aa  431  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1961  TonB-dependent siderophore receptor  35.57 
 
 		 803 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.281016  normal  0.90568 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1440  TonB-dependent siderophore receptor  35.74 
 
 		 827 aa  429  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  34.66 
 
 		 807 aa  430  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0845  TonB-dependent siderophore receptor  36.87 
 
 		 703 aa  426  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0329429  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0846  TonB-dependent siderophore receptor  34.47 
 
 		 841 aa  429  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02230  outer membrane ferripyoverdine receptor  35.28 
 
 		 789 aa  429  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44970  TonB-dependent siderophore receptor  34.8 
 
 		 798 aa  427  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259905  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  34.47 
 
 		 821 aa  425  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2151  TonB-dependent siderophore receptor, putative  35.2 
 
 		 825 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0848793  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1848  TonB-dependent siderophore receptor  33.86 
 
 		 826 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.817483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2583  TonB-dependent siderophore receptor  37.91 
 
 		 748 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  33.65 
 
 		 844 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3601  TonB-dependent siderophore receptor  33.89 
 
 		 836 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.743224  normal  0.189186 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1962  TonB-dependent siderophore receptor  34.95 
 
 		 746 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4418  ferripyoverdine receptor  36.44 
 
 		 766 aa  416  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2065  TonB-dependent siderophore receptor  34.02 
 
 		 809 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2152  TonB-dependent siderophore receptor, putative  34.84 
 
 		 743 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101667  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1732  TonB-dependent siderophore receptor  33.06 
 
 		 864 aa  402  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0884061  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0879  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  34.87 
 
 		 713 aa  398  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.871457  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3276  TonB-dependent siderophore receptor  36.35 
 
 		 840 aa  395  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130164 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1501  TonB-dependent siderophore receptor  35.37 
 
 		 732 aa  390  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.125781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4556  TonB-dependent siderophore receptor  34.55 
 
 		 720 aa  391  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2539  TonB-dependent siderophore receptor  34.85 
 
 		 753 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0677  TonB-dependent siderophore receptor  35.6 
 
 		 745 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2440  FhuE receptor  34.58 
 
 		 753 aa  389  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1482  TonB-dependent siderophore receptor  35.14 
 
 		 723 aa  387  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1823  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  34.34 
 
 		 747 aa  387  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2342  TonB-dependent siderophore receptor  34.97 
 
 		 693 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000105633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2121  TonB-dependent siderophore receptor  34.97 
 
 		 693 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000812539  normal  0.443663 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09340  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  34.6 
 
 		 720 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5131  TonB-dependent siderophore receptor  32.38 
 
 		 841 aa  383  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.112839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  32.68 
 
 		 833 aa  380  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2155  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  34.73 
 
 		 752 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1841  TonB-dependent siderophore receptor  34.93 
 
 		 696 aa  380  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000240616  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1055  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  34.76 
 
 		 747 aa  380  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2192  TonB-dependent siderophore receptor  35.46 
 
 		 725 aa  382  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3410  TonB-dependent siderophore receptor  34.9 
 
 		 714 aa  377  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0883  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  34.44 
 
 		 719 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3374  TonB-dependent siderophore receptor  34.44 
 
 		 738 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0588335  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0988  TonB-dependent siderophore receptor  35.62 
 
 		 731 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00021194  normal  0.772446 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4993  TonB-dependent siderophore receptor  34.44 
 
 		 738 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0250813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0793  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  34.59 
 
 		 719 aa  379  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.454561  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  31.81 
 
 		 787 aa  374  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0450384 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5294  TonB-dependent siderophore receptor  34.15 
 
 		 727 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117694 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0952  TonB-dependent siderophore receptor  35.58 
 
 		 729 aa  373  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000770151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4535  TonB-dependent siderophore receptor  34.39 
 
 		 778 aa  373  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.453333 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2414  TonB-dependent siderophore receptor  35.74 
 
 		 737 aa  367  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.486485  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3182  TonB-dependent receptor family protein  33.56 
 
 		 699 aa  368  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.223092 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1318  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.33 
 
 		 724 aa  369  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45545  hitchhiker  0.0000000229507 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1981  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.15 
 
 		 724 aa  369  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0489607  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1303  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.01 
 
 		 724 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.11921  hitchhiker  0.00000000921463 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2165  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.01 
 
 		 724 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000331924 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3496  TonB-dependent siderophore receptor  35.88 
 
 		 723 aa  368  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2025  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.95 
 
 		 729 aa  366  1e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000237263  hitchhiker  0.0000045764 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2545  TonB-dependent siderophore receptor  33.76 
 
 		 729 aa  364  3e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00327648  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1223  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.76 
 
 		 729 aa  364  3e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000020204  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1481  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.76 
 
 		 729 aa  364  3e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00382185  hitchhiker  0.00000310394 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1280  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  32.87 
 
 		 724 aa  364  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.76264 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2124  TonB-dependent siderophore receptor  35.28 
 
 		 722 aa  364  4e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000170131  normal  0.221939 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3863  TonB-dependent siderophore receptor  35.52 
 
 		 733 aa  364  4e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000567085  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01098  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.76 
 
 		 729 aa  363  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.523255  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2499  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.76 
 
 		 729 aa  363  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318087  unclonable  0.0000000283448 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1224  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.76 
 
 		 729 aa  363  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000059752  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01106  hypothetical protein  33.76 
 
 		 729 aa  363  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.689576  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0950  TonB-dependent siderophore receptor  35.37 
 
 		 723 aa  362  1e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000152119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2222  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.52 
 
 		 729 aa  362  1e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0115447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>