More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0845 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A0793  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  52.07 
 
 		 719 aa  698    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.454561  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2155  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  52.22 
 
 		 752 aa  699    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0677  TonB-dependent siderophore receptor  50.79 
 
 		 745 aa  689    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0845  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 703 aa  1444    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0329429  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1823  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  52.99 
 
 		 747 aa  715    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3374  TonB-dependent siderophore receptor  51.99 
 
 		 738 aa  695    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0588335  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5294  TonB-dependent siderophore receptor  52.14 
 
 		 727 aa  694    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117694 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0879  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  54.09 
 
 		 713 aa  734    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.871457  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09340  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  52.97 
 
 		 720 aa  722    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0883  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  52.07 
 
 		 719 aa  697    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4993  TonB-dependent siderophore receptor  51.99 
 
 		 738 aa  695    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0250813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3273  TonB-dependent siderophore receptor  38.5 
 
 		 826 aa  467  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480033  normal  0.0611881 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  38.78 
 
 		 812 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09970  type I ferripyoverdine receptor, FpvB  39.04 
 
 		 802 aa  458  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3328  TonB-dependent siderophore receptor  38.35 
 
 		 822 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.513174  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0874  TonB-dependent siderophore receptor  38.01 
 
 		 840 aa  446  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708566 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0604  TonB-dependent siderophore receptor  36.17 
 
 		 831 aa  434  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4481  TonB-dependent siderophore receptor  36.96 
 
 		 824 aa  432  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207643  normal  0.919252 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0669  outer membrane ferric siderophore receptor  36.87 
 
 		 810 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.907614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1585  TonB-dependent siderophore receptor  36.48 
 
 		 828 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927871  normal  0.219293 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1440  TonB-dependent siderophore receptor  37.74 
 
 		 827 aa  411  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3478  TonB-dependent siderophore receptor  36.91 
 
 		 825 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  35.69 
 
 		 821 aa  406  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1879  TonB-dependent siderophore receptor  37.04 
 
 		 841 aa  404  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.432996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1449  TonB-dependent siderophore receptor  34.58 
 
 		 822 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3666  TonB-dependent siderophore receptor  35.43 
 
 		 828 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.476594 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1732  TonB-dependent siderophore receptor  35.29 
 
 		 864 aa  389  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0884061  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3601  TonB-dependent siderophore receptor  35.14 
 
 		 836 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.743224  normal  0.189186 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  35.92 
 
 		 803 aa  392  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0759  TonB-dependent siderophore receptor  36.02 
 
 		 800 aa  389  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1961  TonB-dependent siderophore receptor  35.44 
 
 		 803 aa  388  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.281016  normal  0.90568 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  34.19 
 
 		 844 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40910  ferripyoverdine receptor  33.15 
 
 		 808 aa  389  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00205881  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  35.96 
 
 		 814 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  35.64 
 
 		 816 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3692  TonB-dependent siderophore receptor  35.62 
 
 		 722 aa  382  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1784  TonB-dependent siderophore receptor  34.83 
 
 		 717 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.306565  normal  0.0192687 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  33.48 
 
 		 795 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  34.31 
 
 		 802 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02230  outer membrane ferripyoverdine receptor  33.38 
 
 		 789 aa  378  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2151  TonB-dependent siderophore receptor, putative  35.45 
 
 		 825 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0848793  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  34.9 
 
 		 815 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5131  TonB-dependent siderophore receptor  34.57 
 
 		 841 aa  377  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.112839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17690  TonB-dependent siderophore receptor  33.77 
 
 		 806 aa  373  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  34.54 
 
 		 799 aa  375  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  33.58 
 
 		 812 aa  371  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1678  TonB-dependent siderophore receptor  35.08 
 
 		 830 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.463262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  33.53 
 
 		 807 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0860  TonB-dependent siderophore receptor  33.29 
 
 		 841 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2121  TonB-dependent siderophore receptor  33.2 
 
 		 722 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0440064  normal  0.552205 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1501  TonB-dependent siderophore receptor  34.87 
 
 		 732 aa  364  3e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.125781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44970  TonB-dependent siderophore receptor  32.75 
 
 		 798 aa  364  3e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259905  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3410  TonB-dependent siderophore receptor  34.83 
 
 		 714 aa  362  1e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1962  TonB-dependent siderophore receptor  33.83 
 
 		 746 aa  360  4e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0846  TonB-dependent siderophore receptor  32.86 
 
 		 841 aa  360  5e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1848  TonB-dependent siderophore receptor  34.75 
 
 		 826 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.817483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2065  TonB-dependent siderophore receptor  34.72 
 
 		 809 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2152  TonB-dependent siderophore receptor, putative  33.7 
 
 		 743 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101667  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4556  TonB-dependent siderophore receptor  34.29 
 
 		 720 aa  353  8e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4082  TonB-dependent siderophore receptor  32.99 
 
 		 819 aa  351  3e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671478  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  33.38 
 
 		 787 aa  344  2.9999999999999997e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0450384 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0692  TonB-dependent siderophore receptor  34.38 
 
 		 801 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3276  TonB-dependent siderophore receptor  34.62 
 
 		 840 aa  344  4e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130164 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4640  TonB-dependent siderophore receptor  33.98 
 
 		 719 aa  343  5e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0269226  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3182  TonB-dependent siderophore receptor  33.48 
 
 		 735 aa  343  5e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2462  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 724 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1082  TonB-dependent siderophore receptor  32.47 
 
 		 730 aa  341  2.9999999999999998e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1326  TonB-dependent siderophore receptor  32.04 
 
 		 741 aa  340  4e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.624497  normal  0.0240469 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2711  TonB-dependent siderophore receptor  32.32 
 
 		 741 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2192  TonB-dependent siderophore receptor  36.35 
 
 		 725 aa  338  2.9999999999999997e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1653  TonB-dependent siderophore receptor  32.18 
 
 		 741 aa  337  5.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0605702  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2583  TonB-dependent siderophore receptor  33.05 
 
 		 748 aa  334  3e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2812  TonB-dependent siderophore receptor  32.49 
 
 		 747 aa  333  8e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215946  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2733  TonB-dependent siderophore receptor  31.51 
 
 		 747 aa  333  9e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000321343  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4418  ferripyoverdine receptor  33.57 
 
 		 766 aa  332  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2165  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  32.64 
 
 		 724 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000331924 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1981  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  32.79 
 
 		 724 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0489607  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1303  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  32.64 
 
 		 724 aa  332  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.11921  hitchhiker  0.00000000921463 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4072  TonB-dependent siderophore receptor  32.55 
 
 		 817 aa  332  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2025  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  32.75 
 
 		 729 aa  329  8e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000237263  hitchhiker  0.0000045764 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1318  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  32.64 
 
 		 724 aa  329  9e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45545  hitchhiker  0.0000000229507 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2545  TonB-dependent siderophore receptor  32.75 
 
 		 729 aa  329  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00327648  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3496  TonB-dependent siderophore receptor  33.62 
 
 		 723 aa  329  1.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2342  TonB-dependent siderophore receptor  31.62 
 
 		 693 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000105633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 833 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1280  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  32.49 
 
 		 724 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.76264 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2539  TonB-dependent siderophore receptor  31.29 
 
 		 753 aa  328  2.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2121  TonB-dependent siderophore receptor  31.62 
 
 		 693 aa  327  3e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000812539  normal  0.443663 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2440  FhuE receptor  31.38 
 
 		 753 aa  328  3e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1223  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  32.75 
 
 		 729 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000020204  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1481  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  32.75 
 
 		 729 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00382185  hitchhiker  0.00000310394 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1482  TonB-dependent siderophore receptor  31.65 
 
 		 723 aa  327  4.0000000000000003e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.708537 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01098  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  32.75 
 
 		 729 aa  327  5e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.523255  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2499  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  32.75 
 
 		 729 aa  327  5e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318087  unclonable  0.0000000283448 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1224  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  32.75 
 
 		 729 aa  327  5e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000059752  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01106  hypothetical protein  32.75 
 
 		 729 aa  327  5e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.689576  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2222  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  32.6 
 
 		 729 aa  326  8.000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0115447  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2414  TonB-dependent siderophore receptor  31.45 
 
 		 737 aa  324  4e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.486485  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1303  TonB-dependent siderophore receptor  34.12 
 
 		 724 aa  323  6e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2124  TonB-dependent siderophore receptor  31.72 
 
 		 722 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000170131  normal  0.221939 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>