More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0874 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3273  TonB-dependent siderophore receptor  47.56 
 
 		 826 aa  693    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480033  normal  0.0611881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1585  TonB-dependent siderophore receptor  44.46 
 
 		 828 aa  665    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927871  normal  0.219293 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3666  TonB-dependent siderophore receptor  43.72 
 
 		 828 aa  660    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.476594 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3478  TonB-dependent siderophore receptor  44.07 
 
 		 825 aa  667    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0874  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 840 aa  1717    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2065  TonB-dependent siderophore receptor  43.79 
 
 		 809 aa  622  1e-176  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1848  TonB-dependent siderophore receptor  41.57 
 
 		 826 aa  612  1e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.817483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1678  TonB-dependent siderophore receptor  41.64 
 
 		 830 aa  581  1e-164  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.463262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0604  TonB-dependent siderophore receptor  39.73 
 
 		 831 aa  512  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0759  TonB-dependent siderophore receptor  39.44 
 
 		 800 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  38.49 
 
 		 812 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1879  TonB-dependent siderophore receptor  38.54 
 
 		 841 aa  501  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.432996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1961  TonB-dependent siderophore receptor  38.46 
 
 		 803 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.281016  normal  0.90568 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4481  TonB-dependent siderophore receptor  37.08 
 
 		 824 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207643  normal  0.919252 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0846  TonB-dependent siderophore receptor  37.38 
 
 		 841 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0669  outer membrane ferric siderophore receptor  37.86 
 
 		 810 aa  495  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.907614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0860  TonB-dependent siderophore receptor  37.27 
 
 		 841 aa  495  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5131  TonB-dependent siderophore receptor  37.87 
 
 		 841 aa  493  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.112839  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2151  TonB-dependent siderophore receptor, putative  37.33 
 
 		 825 aa  489  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0848793  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0879  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  39.71 
 
 		 713 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.871457  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1962  TonB-dependent siderophore receptor  41.02 
 
 		 746 aa  479  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3601  TonB-dependent siderophore receptor  35.92 
 
 		 836 aa  478  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.743224  normal  0.189186 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09970  type I ferripyoverdine receptor, FpvB  36.91 
 
 		 802 aa  477  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  35.88 
 
 		 844 aa  475  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3328  TonB-dependent siderophore receptor  36.02 
 
 		 822 aa  473  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.513174  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2152  TonB-dependent siderophore receptor, putative  40.36 
 
 		 743 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101667  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09340  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  39.08 
 
 		 720 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5294  TonB-dependent siderophore receptor  39.07 
 
 		 727 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117694 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0677  TonB-dependent siderophore receptor  39.05 
 
 		 745 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4072  TonB-dependent siderophore receptor  37.9 
 
 		 817 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3374  TonB-dependent siderophore receptor  38.93 
 
 		 738 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0588335  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4993  TonB-dependent siderophore receptor  38.93 
 
 		 738 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0250813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1732  TonB-dependent siderophore receptor  35.17 
 
 		 864 aa  457  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0884061  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  37.26 
 
 		 802 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  35.65 
 
 		 816 aa  452  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  34.97 
 
 		 821 aa  451  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1784  TonB-dependent siderophore receptor  36.84 
 
 		 717 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.306565  normal  0.0192687 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3692  TonB-dependent siderophore receptor  38.12 
 
 		 722 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  36.42 
 
 		 814 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0845  TonB-dependent siderophore receptor  38.01 
 
 		 703 aa  446  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0329429  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1823  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  37.99 
 
 		 747 aa  445  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2121  TonB-dependent siderophore receptor  38.05 
 
 		 722 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0440064  normal  0.552205 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40910  ferripyoverdine receptor  34.94 
 
 		 808 aa  439  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00205881  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4082  TonB-dependent siderophore receptor  35.96 
 
 		 819 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671478  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0883  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  37.25 
 
 		 719 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2155  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  36.67 
 
 		 752 aa  435  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0793  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  37.25 
 
 		 719 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.454561  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  35.63 
 
 		 815 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1449  TonB-dependent siderophore receptor  33.74 
 
 		 822 aa  416  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  34.33 
 
 		 799 aa  414  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  34.06 
 
 		 803 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  34.51 
 
 		 812 aa  407  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44970  TonB-dependent siderophore receptor  34.82 
 
 		 798 aa  409  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259905  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2462  TonB-dependent siderophore receptor  36.66 
 
 		 724 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0692  TonB-dependent siderophore receptor  33.22 
 
 		 801 aa  406  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1171  TonB-dependent siderophore receptor  35.01 
 
 		 803 aa  403  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.963652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  34.15 
 
 		 795 aa  406  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17690  TonB-dependent siderophore receptor  34.24 
 
 		 806 aa  400  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  32.04 
 
 		 787 aa  397  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0450384 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  33.68 
 
 		 807 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1440  TonB-dependent siderophore receptor  33.81 
 
 		 827 aa  383  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0400  ferripyoverdine receptor  35.93 
 
 		 744 aa  383  1e-105  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.736403  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02230  outer membrane ferripyoverdine receptor  32.21 
 
 		 789 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3182  TonB-dependent siderophore receptor  34.76 
 
 		 735 aa  370  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1501  TonB-dependent siderophore receptor  34.69 
 
 		 732 aa  368  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.125781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4640  TonB-dependent siderophore receptor  36.06 
 
 		 719 aa  369  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0269226  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3276  TonB-dependent siderophore receptor  34.44 
 
 		 840 aa  367  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130164 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2192  TonB-dependent siderophore receptor  35.02 
 
 		 725 aa  369  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4418  ferripyoverdine receptor  34.69 
 
 		 766 aa  362  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0569  TonB-dependent siderophore receptor  34.58 
 
 		 724 aa  361  3e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.931435 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  32.6 
 
 		 833 aa  360  5e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4556  TonB-dependent siderophore receptor  34.33 
 
 		 720 aa  360  8e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0288  TonB-dependent siderophore receptor  35.04 
 
 		 765 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.566614  normal  0.515749 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0535  TonB-dependent siderophore receptor  34.64 
 
 		 725 aa  355  2e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0586  TonB-dependent siderophore receptor  34.33 
 
 		 724 aa  354  4e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2583  TonB-dependent siderophore receptor  35.37 
 
 		 748 aa  354  4e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0580  TonB-dependent siderophore receptor  34.13 
 
 		 725 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0298  TonB-dependent siderophore receptor  34.65 
 
 		 765 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2539  TonB-dependent siderophore receptor  34.04 
 
 		 753 aa  352  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2440  FhuE receptor  33.61 
 
 		 753 aa  352  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0272  TonB-dependent siderophore receptor  34.84 
 
 		 765 aa  351  3e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199499 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1841  TonB-dependent siderophore receptor  33.82 
 
 		 696 aa  344  4e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000240616  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4535  TonB-dependent siderophore receptor  34.26 
 
 		 778 aa  343  9e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.453333 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3410  TonB-dependent siderophore receptor  34.6 
 
 		 714 aa  339  9.999999999999999e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1055  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.57 
 
 		 747 aa  336  9e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1653  TonB-dependent siderophore receptor  34.02 
 
 		 741 aa  335  3e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0605702  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2733  TonB-dependent siderophore receptor  34.26 
 
 		 747 aa  333  6e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000321343  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1303  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 724 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1981  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  34.2 
 
 		 724 aa  332  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0489607  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1303  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  34.2 
 
 		 724 aa  332  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.11921  hitchhiker  0.00000000921463 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1280  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  34.19 
 
 		 724 aa  332  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.76264 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2545  TonB-dependent siderophore receptor  32.32 
 
 		 729 aa  331  3e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00327648  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0603  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 716 aa  331  3e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00298801  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2165  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  34.2 
 
 		 724 aa  331  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000331924 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2711  TonB-dependent siderophore receptor  33.87 
 
 		 741 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2812  TonB-dependent siderophore receptor  34.11 
 
 		 747 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215946  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1481  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  32.32 
 
 		 729 aa  330  6e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00382185  hitchhiker  0.00000310394 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1223  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  32.32 
 
 		 729 aa  330  6e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000020204  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1224  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  32.32 
 
 		 729 aa  329  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000059752  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1318  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  34.05 
 
 		 724 aa  329  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45545  hitchhiker  0.0000000229507 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>