More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4535 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4535  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 778 aa  1575    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.453333 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  38.77 
 
 		 802 aa  465  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  37.13 
 
 		 803 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1440  TonB-dependent siderophore receptor  37.21 
 
 		 827 aa  424  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  36.77 
 
 		 816 aa  425  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4082  TonB-dependent siderophore receptor  36 
 
 		 819 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671478  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1449  TonB-dependent siderophore receptor  36.51 
 
 		 822 aa  403  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  35.81 
 
 		 815 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  35.05 
 
 		 799 aa  395  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  35.29 
 
 		 814 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0669  outer membrane ferric siderophore receptor  34.39 
 
 		 810 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.907614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  34.39 
 
 		 833 aa  366  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4072  TonB-dependent siderophore receptor  34.44 
 
 		 817 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02230  outer membrane ferripyoverdine receptor  31.72 
 
 		 789 aa  359  9.999999999999999e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1171  TonB-dependent siderophore receptor  35.6 
 
 		 803 aa  359  9.999999999999999e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.963652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44970  TonB-dependent siderophore receptor  31.93 
 
 		 798 aa  357  6.999999999999999e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259905  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  34.91 
 
 		 812 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0759  TonB-dependent siderophore receptor  34.66 
 
 		 800 aa  353  5e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2440  FhuE receptor  35.23 
 
 		 753 aa  353  5e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2539  TonB-dependent siderophore receptor  35.23 
 
 		 753 aa  353  5.9999999999999994e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  32.82 
 
 		 812 aa  352  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2545  TonB-dependent siderophore receptor  33.92 
 
 		 729 aa  349  1e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00327648  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  32.94 
 
 		 807 aa  348  1e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01098  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.92 
 
 		 729 aa  348  2e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.523255  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1481  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.92 
 
 		 729 aa  348  2e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00382185  hitchhiker  0.00000310394 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1224  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.92 
 
 		 729 aa  348  2e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000059752  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4418  ferripyoverdine receptor  34.67 
 
 		 766 aa  348  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1223  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.92 
 
 		 729 aa  348  2e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000020204  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2499  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.92 
 
 		 729 aa  348  2e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318087  unclonable  0.0000000283448 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01106  hypothetical protein  33.92 
 
 		 729 aa  348  2e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.689576  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1055  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  34.92 
 
 		 747 aa  348  3e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17690  TonB-dependent siderophore receptor  32.49 
 
 		 806 aa  348  3e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0692  TonB-dependent siderophore receptor  34.13 
 
 		 801 aa  347  4e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2222  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.77 
 
 		 729 aa  346  8e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0115447  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  31.72 
 
 		 795 aa  345  2e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2025  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.48 
 
 		 729 aa  342  2e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000237263  hitchhiker  0.0000045764 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40910  ferripyoverdine receptor  33.07 
 
 		 808 aa  340  4e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00205881  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0874  TonB-dependent siderophore receptor  34.01 
 
 		 840 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708566 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1303  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.99 
 
 		 724 aa  337  5e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.11921  hitchhiker  0.00000000921463 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1981  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.84 
 
 		 724 aa  337  5e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0489607  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3276  TonB-dependent siderophore receptor  34.16 
 
 		 840 aa  337  5e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130164 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2165  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.99 
 
 		 724 aa  337  5e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000331924 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1280  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.99 
 
 		 724 aa  334  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.76264 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1318  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  33.69 
 
 		 724 aa  334  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45545  hitchhiker  0.0000000229507 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1617  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  32.85 
 
 		 728 aa  333  9e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000544721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1653  TonB-dependent siderophore receptor  35.03 
 
 		 741 aa  332  2e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0605702  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4556  TonB-dependent siderophore receptor  33.82 
 
 		 720 aa  331  3e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2711  TonB-dependent siderophore receptor  34.93 
 
 		 741 aa  331  4e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2414  TonB-dependent siderophore receptor  35.01 
 
 		 737 aa  328  3e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.486485  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3182  TonB-dependent receptor family protein  33.97 
 
 		 699 aa  328  3e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.223092 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09970  type I ferripyoverdine receptor, FpvB  33.42 
 
 		 802 aa  328  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2812  TonB-dependent siderophore receptor  35.74 
 
 		 747 aa  324  3e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215946  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1501  TonB-dependent siderophore receptor  34.55 
 
 		 732 aa  324  5e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.125781  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2151  TonB-dependent siderophore receptor, putative  33.64 
 
 		 825 aa  323  9.000000000000001e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0848793  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2733  TonB-dependent siderophore receptor  34.64 
 
 		 747 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000321343  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0137  TonB-dependent iron-siderophore receptor precursor  33.54 
 
 		 721 aa  322  9.999999999999999e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2583  TonB-dependent siderophore receptor  34.63 
 
 		 748 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2192  TonB-dependent siderophore receptor  34.46 
 
 		 725 aa  321  3.9999999999999996e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4481  TonB-dependent siderophore receptor  32.51 
 
 		 824 aa  320  7e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207643  normal  0.919252 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3496  TonB-dependent siderophore receptor  33.44 
 
 		 723 aa  319  1e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2121  TonB-dependent siderophore receptor  32.5 
 
 		 693 aa  319  2e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000812539  normal  0.443663 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2342  TonB-dependent siderophore receptor  32.97 
 
 		 693 aa  317  4e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000105633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3273  TonB-dependent siderophore receptor  34.71 
 
 		 826 aa  317  6e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480033  normal  0.0611881 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1517  TonB-dependent siderophore receptor  35.38 
 
 		 737 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0134645  normal  0.877607 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1451  TonB-dependent siderophore receptor  35.22 
 
 		 737 aa  311  2e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1961  TonB-dependent siderophore receptor  32.89 
 
 		 803 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.281016  normal  0.90568 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  33.19 
 
 		 821 aa  310  1.0000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3410  TonB-dependent siderophore receptor  32.57 
 
 		 714 aa  309  1.0000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1879  TonB-dependent siderophore receptor  33.72 
 
 		 841 aa  309  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.432996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1507  TonB-dependent siderophore receptor  34.92 
 
 		 737 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.681157  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3033  ferric alcaligin siderophore receptor  35.23 
 
 		 700 aa  308  3e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1326  TonB-dependent siderophore receptor  33.38 
 
 		 741 aa  307  5.0000000000000004e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.624497  normal  0.0240469 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3692  TonB-dependent siderophore receptor  35.1 
 
 		 722 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3601  TonB-dependent siderophore receptor  31.04 
 
 		 836 aa  305  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.743224  normal  0.189186 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3478  TonB-dependent siderophore receptor  31.82 
 
 		 825 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  32.81 
 
 		 844 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2121  TonB-dependent siderophore receptor  32.78 
 
 		 722 aa  304  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0440064  normal  0.552205 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2065  TonB-dependent siderophore receptor  31.88 
 
 		 809 aa  304  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1784  TonB-dependent siderophore receptor  34.75 
 
 		 717 aa  303  9e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.306565  normal  0.0192687 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1732  TonB-dependent siderophore receptor  32.68 
 
 		 864 aa  301  3e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0884061  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1848  TonB-dependent siderophore receptor  31.76 
 
 		 826 aa  300  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.817483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3531  TonB-dependent siderophore receptor  33.72 
 
 		 740 aa  299  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313722  decreased coverage  0.00643483 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0845  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 703 aa  298  3e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0329429  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3182  TonB-dependent siderophore receptor  34.77 
 
 		 735 aa  298  3e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1841  TonB-dependent siderophore receptor  32.41 
 
 		 696 aa  297  4e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000240616  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1482  TonB-dependent siderophore receptor  33.97 
 
 		 723 aa  295  3e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2462  TonB-dependent siderophore receptor  33.97 
 
 		 724 aa  294  4e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4426  TonB-dependent siderophore receptor  33.03 
 
 		 728 aa  293  6e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3097  TonB-dependent siderophore receptor  32.25 
 
 		 723 aa  294  6e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.582192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0114  TonB-dependent siderophore receptor  33.18 
 
 		 728 aa  293  9e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2152  TonB-dependent siderophore receptor, putative  32.87 
 
 		 743 aa  292  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101667  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3328  TonB-dependent siderophore receptor  30.44 
 
 		 822 aa  291  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.513174  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4286  TonB-dependent siderophore receptor  32.87 
 
 		 728 aa  291  3e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0950  TonB-dependent siderophore receptor  31.51 
 
 		 723 aa  291  4e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000152119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0952  TonB-dependent siderophore receptor  30.98 
 
 		 729 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000770151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0988  TonB-dependent siderophore receptor  31.3 
 
 		 731 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00021194  normal  0.772446 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0106  TonB-dependent siderophore receptor  31.9 
 
 		 728 aa  287  4e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0604  TonB-dependent siderophore receptor  30.73 
 
 		 831 aa  288  4e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5131  TonB-dependent siderophore receptor  32.25 
 
 		 841 aa  287  5.999999999999999e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.112839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3863  TonB-dependent siderophore receptor  31.15 
 
 		 733 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000567085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>