More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1848 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2065  TonB-dependent siderophore receptor  46.61 
 
 		 809 aa  761    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1848  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 826 aa  1707    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.817483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1678  TonB-dependent siderophore receptor  54.89 
 
 		 830 aa  924    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.463262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0874  TonB-dependent siderophore receptor  42.27 
 
 		 840 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708566 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3478  TonB-dependent siderophore receptor  40.08 
 
 		 825 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1585  TonB-dependent siderophore receptor  38.91 
 
 		 828 aa  558  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927871  normal  0.219293 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3666  TonB-dependent siderophore receptor  38.56 
 
 		 828 aa  548  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.476594 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2151  TonB-dependent siderophore receptor, putative  37.74 
 
 		 825 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0848793  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3273  TonB-dependent siderophore receptor  38.35 
 
 		 826 aa  513  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480033  normal  0.0611881 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  37.47 
 
 		 812 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1961  TonB-dependent siderophore receptor  37.47 
 
 		 803 aa  495  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.281016  normal  0.90568 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0759  TonB-dependent siderophore receptor  37.5 
 
 		 800 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4481  TonB-dependent siderophore receptor  36.39 
 
 		 824 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207643  normal  0.919252 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09970  type I ferripyoverdine receptor, FpvB  35.61 
 
 		 802 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0604  TonB-dependent siderophore receptor  34.55 
 
 		 831 aa  436  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4082  TonB-dependent siderophore receptor  33.65 
 
 		 819 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671478  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  35.02 
 
 		 815 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1962  TonB-dependent siderophore receptor  37.05 
 
 		 746 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  34.81 
 
 		 844 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  32.89 
 
 		 807 aa  426  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2152  TonB-dependent siderophore receptor, putative  36.1 
 
 		 743 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101667  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  34.7 
 
 		 821 aa  422  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0669  outer membrane ferric siderophore receptor  33.86 
 
 		 810 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.907614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1784  TonB-dependent siderophore receptor  36.4 
 
 		 717 aa  412  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.306565  normal  0.0192687 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0860  TonB-dependent siderophore receptor  33.45 
 
 		 841 aa  412  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0846  TonB-dependent siderophore receptor  33.61 
 
 		 841 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  33.38 
 
 		 802 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3692  TonB-dependent siderophore receptor  35.94 
 
 		 722 aa  405  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3328  TonB-dependent siderophore receptor  33.29 
 
 		 822 aa  404  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.513174  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2121  TonB-dependent siderophore receptor  35.74 
 
 		 722 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0440064  normal  0.552205 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5131  TonB-dependent siderophore receptor  32.43 
 
 		 841 aa  389  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.112839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0879  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  36.59 
 
 		 713 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.871457  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1879  TonB-dependent siderophore receptor  32.09 
 
 		 841 aa  383  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.432996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0692  TonB-dependent siderophore receptor  31.9 
 
 		 801 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3601  TonB-dependent siderophore receptor  31.34 
 
 		 836 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.743224  normal  0.189186 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1732  TonB-dependent siderophore receptor  31.88 
 
 		 864 aa  378  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0884061  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2462  TonB-dependent siderophore receptor  35.76 
 
 		 724 aa  378  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5294  TonB-dependent siderophore receptor  32.45 
 
 		 727 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117694 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  32.5 
 
 		 803 aa  369  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3374  TonB-dependent siderophore receptor  32.45 
 
 		 738 aa  369  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0588335  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09340  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  35.38 
 
 		 720 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4993  TonB-dependent siderophore receptor  32.45 
 
 		 738 aa  369  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0250813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4072  TonB-dependent siderophore receptor  31.27 
 
 		 817 aa  366  1e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  32.82 
 
 		 814 aa  365  2e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44970  TonB-dependent siderophore receptor  30.01 
 
 		 798 aa  362  2e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259905  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0677  TonB-dependent siderophore receptor  34.03 
 
 		 745 aa  361  3e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1449  TonB-dependent siderophore receptor  30.77 
 
 		 822 aa  359  9.999999999999999e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0845  TonB-dependent siderophore receptor  34.75 
 
 		 703 aa  359  9.999999999999999e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0329429  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  32.34 
 
 		 816 aa  354  5e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2155  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  34.12 
 
 		 752 aa  352  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  30.28 
 
 		 812 aa  353  1e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40910  ferripyoverdine receptor  30.5 
 
 		 808 aa  352  1e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00205881  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  31.58 
 
 		 799 aa  352  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0793  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  33.68 
 
 		 719 aa  350  7e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.454561  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0883  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  33.68 
 
 		 719 aa  349  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17690  TonB-dependent siderophore receptor  30.48 
 
 		 806 aa  348  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1823  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  33.09 
 
 		 747 aa  348  3e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  30.7 
 
 		 787 aa  344  5e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0450384 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  30.24 
 
 		 795 aa  343  7e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02230  outer membrane ferripyoverdine receptor  30.06 
 
 		 789 aa  340  5e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0400  ferripyoverdine receptor  31.87 
 
 		 744 aa  335  1e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.736403  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1440  TonB-dependent siderophore receptor  31.87 
 
 		 827 aa  327  5e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1171  TonB-dependent siderophore receptor  32.24 
 
 		 803 aa  327  7e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.963652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  29.02 
 
 		 833 aa  313  1e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0288  TonB-dependent siderophore receptor  32.5 
 
 		 765 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.566614  normal  0.515749 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0272  TonB-dependent siderophore receptor  32.5 
 
 		 765 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199499 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0298  TonB-dependent siderophore receptor  31.93 
 
 		 765 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3182  TonB-dependent siderophore receptor  32.27 
 
 		 735 aa  301  5e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4418  ferripyoverdine receptor  31.11 
 
 		 766 aa  300  8e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4535  TonB-dependent siderophore receptor  31.76 
 
 		 778 aa  300  1e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.453333 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2124  TonB-dependent siderophore receptor  29.14 
 
 		 722 aa  296  7e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000170131  normal  0.221939 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3276  TonB-dependent siderophore receptor  30.47 
 
 		 840 aa  296  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130164 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4556  TonB-dependent siderophore receptor  29.37 
 
 		 720 aa  294  4e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4640  TonB-dependent siderophore receptor  31.28 
 
 		 719 aa  293  8e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0269226  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0580  TonB-dependent siderophore receptor  30.28 
 
 		 725 aa  293  9e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2583  TonB-dependent siderophore receptor  30.61 
 
 		 748 aa  291  4e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1501  TonB-dependent siderophore receptor  30.69 
 
 		 732 aa  290  1e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.125781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3863  TonB-dependent siderophore receptor  30.39 
 
 		 733 aa  290  1e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000567085  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2339  TonB-dependent siderophore receptor  29.39 
 
 		 722 aa  289  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000312883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3410  TonB-dependent siderophore receptor  32.14 
 
 		 714 aa  289  1e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2136  TonB-dependent siderophore receptor  29.39 
 
 		 722 aa  289  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.503645  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2192  TonB-dependent siderophore receptor  30.6 
 
 		 725 aa  287  5.999999999999999e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2440  FhuE receptor  30.54 
 
 		 753 aa  287  7e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0569  TonB-dependent siderophore receptor  30.43 
 
 		 724 aa  286  8e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.931435 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3496  TonB-dependent siderophore receptor  31.99 
 
 		 723 aa  286  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1653  TonB-dependent siderophore receptor  30.51 
 
 		 741 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0605702  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0586  TonB-dependent siderophore receptor  30.27 
 
 		 724 aa  286  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2711  TonB-dependent siderophore receptor  30.36 
 
 		 741 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2539  TonB-dependent siderophore receptor  30.36 
 
 		 753 aa  284  4.0000000000000003e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0535  TonB-dependent siderophore receptor  30.29 
 
 		 725 aa  284  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2733  TonB-dependent siderophore receptor  30.68 
 
 		 747 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000321343  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2812  TonB-dependent siderophore receptor  30.4 
 
 		 747 aa  281  5e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215946  normal  0.484151 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2545  TonB-dependent siderophore receptor  31.29 
 
 		 729 aa  280  6e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00327648  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2025  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  31.29 
 
 		 729 aa  280  7e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000237263  hitchhiker  0.0000045764 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1481  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  31.29 
 
 		 729 aa  280  9e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00382185  hitchhiker  0.00000310394 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1223  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  31.29 
 
 		 729 aa  280  9e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000020204  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01098  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  31.29 
 
 		 729 aa  279  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.523255  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2499  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  31.29 
 
 		 729 aa  279  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318087  unclonable  0.0000000283448 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1303  TonB-dependent siderophore receptor  30.85 
 
 		 724 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01106  hypothetical protein  31.29 
 
 		 729 aa  279  2e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.689576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>