More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0860 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0846  TonB-dependent siderophore receptor  94.17 
 
 		 841 aa  1639    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  61.99 
 
 		 844 aa  1078    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0860  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 841 aa  1727    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1732  TonB-dependent siderophore receptor  38.16 
 
 		 864 aa  538  1e-151  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0884061  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5131  TonB-dependent siderophore receptor  38.26 
 
 		 841 aa  532  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.112839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1961  TonB-dependent siderophore receptor  38.11 
 
 		 803 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.281016  normal  0.90568 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3478  TonB-dependent siderophore receptor  37.06 
 
 		 825 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2151  TonB-dependent siderophore receptor, putative  37.49 
 
 		 825 aa  504  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0848793  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3601  TonB-dependent siderophore receptor  36.92 
 
 		 836 aa  503  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.743224  normal  0.189186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0874  TonB-dependent siderophore receptor  37.5 
 
 		 840 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1585  TonB-dependent siderophore receptor  36.67 
 
 		 828 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927871  normal  0.219293 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3666  TonB-dependent siderophore receptor  36.19 
 
 		 828 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.476594 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0759  TonB-dependent siderophore receptor  37.68 
 
 		 800 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3273  TonB-dependent siderophore receptor  37.45 
 
 		 826 aa  475  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480033  normal  0.0611881 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  34.83 
 
 		 812 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2152  TonB-dependent siderophore receptor, putative  38.32 
 
 		 743 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101667  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4481  TonB-dependent siderophore receptor  35.23 
 
 		 824 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207643  normal  0.919252 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  36.69 
 
 		 821 aa  468  9.999999999999999e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1962  TonB-dependent siderophore receptor  37.57 
 
 		 746 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  35.92 
 
 		 803 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  35.16 
 
 		 802 aa  446  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4072  TonB-dependent siderophore receptor  34.28 
 
 		 817 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0669  outer membrane ferric siderophore receptor  34.71 
 
 		 810 aa  439  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.907614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  33.96 
 
 		 816 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  35.25 
 
 		 795 aa  428  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3328  TonB-dependent siderophore receptor  34.75 
 
 		 822 aa  429  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.513174  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1879  TonB-dependent siderophore receptor  36.39 
 
 		 841 aa  428  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.432996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0604  TonB-dependent siderophore receptor  34.54 
 
 		 831 aa  423  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1678  TonB-dependent siderophore receptor  35.93 
 
 		 830 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.463262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  34.57 
 
 		 814 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40910  ferripyoverdine receptor  33.1 
 
 		 808 aa  414  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00205881  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17690  TonB-dependent siderophore receptor  34.04 
 
 		 806 aa  415  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  32.95 
 
 		 812 aa  409  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1848  TonB-dependent siderophore receptor  33.45 
 
 		 826 aa  412  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.817483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2065  TonB-dependent siderophore receptor  33.65 
 
 		 809 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09970  type I ferripyoverdine receptor, FpvB  34.06 
 
 		 802 aa  412  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4082  TonB-dependent siderophore receptor  33.53 
 
 		 819 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671478  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  33.22 
 
 		 807 aa  408  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3692  TonB-dependent siderophore receptor  35.26 
 
 		 722 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5294  TonB-dependent siderophore receptor  35.7 
 
 		 727 aa  405  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117694 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3374  TonB-dependent siderophore receptor  35.56 
 
 		 738 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0588335  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  34.48 
 
 		 799 aa  405  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4993  TonB-dependent siderophore receptor  35.56 
 
 		 738 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0250813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44970  TonB-dependent siderophore receptor  33.93 
 
 		 798 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259905  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2121  TonB-dependent siderophore receptor  35.84 
 
 		 722 aa  399  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0440064  normal  0.552205 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0793  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  35.19 
 
 		 719 aa  395  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.454561  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0677  TonB-dependent siderophore receptor  34.35 
 
 		 745 aa  395  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1823  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  34.76 
 
 		 747 aa  395  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0883  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  35.19 
 
 		 719 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0879  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  34.85 
 
 		 713 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.871457  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02230  outer membrane ferripyoverdine receptor  32.85 
 
 		 789 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2155  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  34.91 
 
 		 752 aa  392  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1784  TonB-dependent siderophore receptor  34.44 
 
 		 717 aa  389  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.306565  normal  0.0192687 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1171  TonB-dependent siderophore receptor  33.81 
 
 		 803 aa  384  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.963652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2462  TonB-dependent siderophore receptor  36.39 
 
 		 724 aa  383  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09340  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  34.6 
 
 		 720 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0692  TonB-dependent siderophore receptor  31.55 
 
 		 801 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2076  TonB-dependent receptor  39.41 
 
 		 533 aa  370  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0845  TonB-dependent siderophore receptor  33.29 
 
 		 703 aa  366  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0329429  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1449  TonB-dependent siderophore receptor  32.94 
 
 		 822 aa  368  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  31.59 
 
 		 815 aa  365  2e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0288  TonB-dependent siderophore receptor  33.55 
 
 		 765 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.566614  normal  0.515749 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0272  TonB-dependent siderophore receptor  33.86 
 
 		 765 aa  354  4e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199499 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0298  TonB-dependent siderophore receptor  33.9 
 
 		 765 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1501  TonB-dependent siderophore receptor  33.47 
 
 		 732 aa  352  2e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.125781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1440  TonB-dependent siderophore receptor  32.5 
 
 		 827 aa  350  7e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  31.38 
 
 		 787 aa  347  7e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0450384 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0400  ferripyoverdine receptor  32.55 
 
 		 744 aa  342  1e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.736403  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2583  TonB-dependent siderophore receptor  33.16 
 
 		 748 aa  340  7e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  29.73 
 
 		 833 aa  335  2e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4418  ferripyoverdine receptor  32.93 
 
 		 766 aa  332  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3276  TonB-dependent siderophore receptor  32.09 
 
 		 840 aa  326  1e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130164 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3496  TonB-dependent siderophore receptor  33.43 
 
 		 723 aa  323  8e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1326  TonB-dependent siderophore receptor  32.87 
 
 		 741 aa  322  1.9999999999999998e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.624497  normal  0.0240469 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0586  TonB-dependent siderophore receptor  32.8 
 
 		 724 aa  319  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4556  TonB-dependent siderophore receptor  30.57 
 
 		 720 aa  318  2e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1482  TonB-dependent siderophore receptor  32.13 
 
 		 723 aa  313  6.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0569  TonB-dependent siderophore receptor  31.99 
 
 		 724 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.931435 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4640  TonB-dependent siderophore receptor  32.23 
 
 		 719 aa  310  9e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0269226  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0535  TonB-dependent siderophore receptor  31.23 
 
 		 725 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1082  TonB-dependent siderophore receptor  31.86 
 
 		 730 aa  306  1.0000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3182  TonB-dependent siderophore receptor  32.89 
 
 		 735 aa  303  9e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0580  TonB-dependent siderophore receptor  31.14 
 
 		 725 aa  301  4e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2440  FhuE receptor  31.11 
 
 		 753 aa  298  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2539  TonB-dependent siderophore receptor  31.11 
 
 		 753 aa  297  6e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2025  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  31.48 
 
 		 729 aa  296  1e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000237263  hitchhiker  0.0000045764 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1223  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  30.46 
 
 		 729 aa  294  4e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000020204  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1481  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  30.46 
 
 		 729 aa  294  4e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00382185  hitchhiker  0.00000310394 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01098  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  30.46 
 
 		 729 aa  293  6e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.523255  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2499  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  30.46 
 
 		 729 aa  293  6e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318087  unclonable  0.0000000283448 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1224  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  30.46 
 
 		 729 aa  293  6e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000059752  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01106  hypothetical protein  30.46 
 
 		 729 aa  293  6e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.689576  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2545  TonB-dependent siderophore receptor  30.33 
 
 		 729 aa  292  1e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00327648  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1055  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  31.95 
 
 		 747 aa  291  5.0000000000000004e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2222  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  30.08 
 
 		 729 aa  291  5.0000000000000004e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0115447  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1303  TonB-dependent siderophore receptor  31.47 
 
 		 724 aa  290  6e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3410  TonB-dependent siderophore receptor  32.05 
 
 		 714 aa  285  2.0000000000000002e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3182  TonB-dependent receptor family protein  30.33 
 
 		 699 aa  283  1e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.223092 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3531  TonB-dependent siderophore receptor  29.48 
 
 		 740 aa  282  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313722  decreased coverage  0.00643483 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4535  TonB-dependent siderophore receptor  31.25 
 
 		 778 aa  281  3e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.453333 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>